OBV funkcijas
Aminoskābes uzbve
Sāņu kēžu iedalījums:
L-aminoskābe
-NH2 ir pa kreisi no centrālā C atoma
D-aminoskābe
-NH2 ir pa labi no centrālā C atoma
Ja ph<pKa
-NH2 būs -NH3+ veidā
Ja ph>pKa
-COOH būs -COO- veidā
Izoelektriskais punkts
ph vērtība, kurā aminoskābes kopējais lādiņš ir 0
Kāpēc aminoskābju šķīdība ūdenī izoelektriskajā punktā ir mazāka?
starp molekulām samazinās elektrostatiskā atgrūšanās (tās turas kopā)
Kāda saite veidojas starp aminoskābēm?
peptīdsaite jeb amīdsaite
Otrējā OBV struktūra
-ūdeņražsaites starp C=O un N-H
-iespējamas 2 struktūras:
1. beta-plāksnes
-polipeptīdu ķēdes segmenti atrodas blakus/pretī—> loksnes struktūra
2. alfa-spirāles
-ūdeņražsaites veidojas starp katru ceturto N-H, C=O grupu, veidojot spirāli
Trešējā struktūra
-nosaka sānu ķēžu mijiedarbības:
1. ūdeņražsaites
2. hidrofobās mijiedarbības (nepolāro molekulu tendence agregēties jeb sakārtoties kopā)
3. disulfīda saite (kovalentā saite starp S atomiem cisteīna sānu ķēdē)
4. jonu saite=sāls tiltiņi (starp pretēji lādētiem joniem)
Kādas struktūras nosaka trešējā struktūra?
Ceturtējā struktūra
polipeptīdiem apvienojoties funkcionālā klāsterī
OBV savērpšanās
-obv no lineāras ķēdes sakārtojas E izdevīgākā struktūrā, lai kļūtu funkcionāla
-spontāni
-lielāku obv struktūru veidošanās ir vadīta (šaperoni)
Kas denaturē OBV?