C’est quoi un ARN non codant
molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine
Est-ce que tous les ARN non codant ont des fonctions dans la régulation de l’expression des gènes
non, c’est juste les miRNA, siRNA et lncRNA
Rôles des miRNA, siRNA et lncRNA
- régulation de l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du préARN
siRNA (small interference RNA)
RNA interférence
joue un rôle ds La défense de cellules contre les séquences nucléotidiques parasites
inhibent la traduction l’expression ou la traduction de gènes en neutralisant les molécules ARNm ciblées
miRNA (microRNA)
petite molécule de ncRNA
se trouvent chez plantes, animaux et certains virus
Rôle miRNA
inhibent expression génique en ciblant ARNm
Comment fonctionnent les miRNA
- Clivage du brin d’ARNm en deux morceaux
- Déstabilisation du brin d’ARNm par clivage de sa queue PolyA
- Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en prot
Biogenèse des miARN
- transcrits par ADN polymérase II
- transcrit coiffé, adénylé et épissé
- transcrit précurseur appelé pri-miRNA
- 1 pri-miRNA contient 1-6 pré-miRNA
Structure d’un pré-miRNA
épingle à cheveux
Biogenèse des miARN : maturation dans le noyau
- chaque structure en épingle à cheveux de la pri-miRNA est reconnue par une prot DGCR8 (vertébrés) ou Pasha (invertébrés)
- DGCR8 (Pasha) et Drosha (une enzyme) forment le complexe “micro compresseur”
- Drosha découpe pré-miARN des pri-miARN
- CROPPING
- EXPORT
Biogenèse des miARN : maturation dans le cytoplasme
- DICING : pré-miARN processé par Dicer, une endoribonucléase qui coupe boucle reliant les bras
- Forme duplex miARN/miARN* imparfait
complexe “micro-compresseur” formé par quoi
DGCR8 (Pasha) et Drosha
c’est quoi le cropping
Drosha libère les pré-miRNA
- résultat: pré-miRNA a deux nucléotides nn appariés à son extrémité 3’
comment se fait l’export
pré-miARN exportés par Exportine5 qui reconnait les 2 nucleotides
transport dépendant de l’énergie, du GTP lié à la Ran-GTP
brin guide
miARN
brin passager
miARN*
miARN : mécanisme d’action
- Argonaute (Ago) choisi un des deux brins (le brin guide) pour agir comme miARN fonctionnel
- Brin Guide + Ago + d’autres prot forment le RISC (= RNA Induced Silencing Complex)
- c’est là que le miRNA et son ARNm cible interagissent
Mécanismes de RISC
1- Appariement étendu (parfait)
2- Appariement pas extensif (partiel)
3- Les miRNA partiellement complémentaires peuvent inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm
4- Des miRNA partiellement complémentaires peuvent accélérer la déadénylation entraînant la dégradation précoce des ARNm
Les miRNA peuvent provoquer la
modification d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte l’expression des gènes cibles
Mécanisme de RISC : appariement étendu
SLICING : ARNm est clivé puis dégradé
Mécanisme de RISC : appariement partiel
- Pas de Slicing
- traduction inhibée et ARNm cible dégradé
- ARNm séquestrés ds des “P-bodies” où ils seront dégradés
P-bodies
structures dynamiques contenant l’enzyme Dcp1 (Decaping enzyme) ainsi que des enzymes de dégradation des mRNAs
