Cap 2 Flashcards

(74 cards)

1
Q

¿Qué son las proteínas?

A

polímeros formados por aminoácidos, en los que cada residuo de aminoácido esta unido al siguiente a través de un enlace covalente.
Son de las moléculas orgánicas más abundantes en los organismos y de las más diversas tanto estructural como funcionalmente.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Funciones de las proteínas

A

Función enzimática
➢Transporte de sustancias
➢Señalización y mensajeros
➢Defensas para protección del organismo
➢Movimiento y contracción
➢Almacenamiento y reservas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Estructura básica de los aminoácidos

A

Todos poseen un C central llamado Cα que presenta quiralidad, dando lugar a un isómero óptico D y uno L.

Todos poseen un grupo amino-NH2 un grupo carboxilo –COOH.

Poseen carácter anfótero.

El grupo R es diferente, dando características particulares a cada aminoácido.

Solo 20 aminoácidos son codificados en el material genético.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Clasificación de los aminoácidos presentes en las proteínas según estructura

A

Grupos R apoleraes alifáticos: no tiene doble enlace carga ni ramas. Están hechos solo de C y H (hidrocarburos).

Grupos R aromáticos: dobles enlaces alternados

Grupos R polares sin carga: pueden generar momentos dipolo ya que tienen un átomo electronegativo. contiene átomos electronegativos (O, N, S)

Grupos R cargados negativamente

Grupos R cargados positivamente

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Clasificación de los aminoácidos según síntesis

A

Esenciales: Aquellos que el cuerpo humano NO PUEDE sintetizar por sí mismo.

No esenciales: Aquellos que el cuerpo humano PUEDE PRODUCIR por sí mismo.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Aminoácidos Esenciales

A

Isoleucina (Ile)
Leucina (Leu)
Lisina (Lys)
Metionina (Met)
Fenilalanina (Phe)
Treonina (Thr)
Triptófano (Trp)
Valina (Val)
Histidina (His)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Aminoácidos No esenciales

A

Alanina (Ala)
Tirosina (Tyr) -> necesito de la fenilananina
Aspartato (Asp)
Cisteína (Cys) -> necesito de la metionina
Glutamato (Glu)
Glutamina (GIn)
Glicina (Gly) Prolina (Pro)
Serina (Ser)
Asparagina (Asn)
Arginina (Arg)

El cuerpo posee límites de Asp, Gln, y Arg

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Enlace peptídico

A

Los aminoácidos se unen en un orden especifico.
Los aminoácidos vecinos de polipéptido se unen entre ellos por un enlace covalente (enlace covalente).
Por reacción de síntesis por condensación o deshidratación.
La unión se da entre el grupo amino terminar de uno de los aminoácidos con el grupo carboxilo inicial del otro aminoácido.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Péptidos

A

cadenas <50 aa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Proteínas

A

cadenas>50 aa y diferentes cadenas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Que Clasificaciones hay según Conformación y estructura de los péptidos y proteínas

A
  1. Por su estructuración de plegamiento
  2. Por su forma tridimensional
  3. Por su composición molecular
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Clasificacion de los péptidos y proteínas Por su plegamiento:

A
  1. Estructura primaria
  2. Estructura secundaria
  3. Estructura terciaria
  4. Estructura Cuaternaria
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

péptidos y proteínas estructura primaria

A

Es el nivel más simple y consiste en la secuencia de aminoácidos en una cadena polipeptídica, representada de manera lineal.

> La insulina se representa de manera lineal por la sencillez de las dos cadenas peptídicas que la conforman A y B.

> Los genes contenidos en el ADN codifican para la secuencia de a.a. de una proteína. Un solo cambio puede ser suficiente para modificar la secuencia de a.a. y por ende la estructura y función de la proteína.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

péptidos y proteínas estructura secundaria

A

estructuras plegadas localmente que se forman dentro de un péptido debido a las interacciones entre los átomos que lo componen.

Principalmente podemos encontrar en los plegamientos más comunes conocidos como alfa hélice y hoja beta plegada parece una tira con marcas de dobleces).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

péptidos y proteínas estructura terciaria

A

estructura tridimensional general de un polipéptido generada principalmente por las interacciones entre los grupos R laterales de los a.a.

Las interacciones o enlaces que pueda haber de los grupos R incluyen:
Puentes de hidrógeno
Enlaces iónicos
Interacciones dipolo-dipolo
Fuerzas de London
Interacciones hidrofóbicas
Puentes disulfuro (único enlace covalente)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

péptidos y proteínas estructura cuaternaria

A

Muchas proteínas se componen de una sola cadena polipeptídica teniendo solo tres niveles de estructura.

Compuesta de subunidades -> varias cadenas polipeptídicas.
Al unirse estas subunidades generan la estructura cuaternaria de la proteína.

> son como la hemoglobina que son proteínas terciarias pegadas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Clasificación de proteínas por su tridimensionalidad

A

> Proteínas fibrosas
Cadenas polipéptidicas ordenadas en modo paralelo
Ej: colágeno

> Proteínas globulares
Cadenas polipeptídicas plegadas en forma esférica o compacta
Ej: mioglobina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Clasificación de proteínas por su composición molecular

A
  1. proteinas simples
  2. Proteínas conjugadas
    > Nucleoproteínas (ribosomas)
    ➢Lipoproteínas (LDH)
    ➢Fosfoproteínas (Caseína)
    ➢Metaloproteinasa (Hemoglobina)
    ➢Glucoproteínas (inmunoglobulinas)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

prostético

A

La porción no aminoácida de una proteína conjugada se denomina prostético

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Queratina

A

Forma el cabello uñas insectos y crustáceos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

GFP

A

Proteína fluorescente verde, presente en animales del mar o la usamos para detectar genes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Inmunoglobina

A

Defensas del organismo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Proteína más simple

A

Glicina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Proteína con grupo tiol

A

SH

Cisteina -> Da cabello chino

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
anfótero
puede comportarse tanto como ácido (si ya no tiene H) como base (si tiene H)
26
REACCIÓN EXERGÓNICA: AG < O
reacción es espontánea Se libera energía
27
REACCIÓN ENDERGÓNICA: AG > O
La reacción no es espontánea Se usa energía Si los valores salen positivos quiere decir que la reacción no es favorable por lo que no será espontánea, esto es muy frecuente en anabolismo
28
¿Qué pasa si las reacciones no son favorables?
El anabolismo requiere de suministro de energía
29
Quienes aceleran o facilitan una reacción química dentro de un organismo.
generalmente proteínas
30
Proteínas de importancia biomédica:
•Lactasa •Amilasas y proteasas •RNA polimerasas
31
catalizadores
Enzimas, Favorecen y facilitan las reacciones químicas. Disminuyen la energía de activación. Las enzimas se unen a los reactivos o sustratos facilitando la formación o rompimiento de los enlaces químicos (SITIO ACTIVO).
32
Interacción entre enzimas y el sustrato
Es fundamental el arreglo espacial especifico de aminoácidos en la estructura terciaria de la proteína para favorecer la unión con el sustrato. El sitio activo es la región donde el sustrato se asocia para: 1. Disminuir energía de activación 2. Aumentar el número de colisiones productivas 3. Acelerar la velocidad de reacción
33
Tipos de Estructura de las enzimas
Enzimas simples Enzimas conjugadas
34
Elementos en la estructura de las enzimas
Cofactor: Compuesto no proteico necesario para la actividad de una enzima como catalizador. es un tipo de cofactor Coenzima: Molécula que se une al sitio activo para ayudar en reacción, transitorio. Apoenzima: Apoproteína: solo la parte proteica, inactiva, de la enzima. Es la proteína por sí sola, que aún no se ha unido a su cofactor. Holoenzima: Enzima formada por una parte proteica unida a su cofactor correspondiente. complejo completo y activo. el reactivo o sustrato es la materia prima que será procesada
35
Cofactor
Puede ser de origen proteico y no proteico. •No proteicos: Iones metálicos como el Fe²⁺, Fe³⁺, Mg²⁺, Mn²⁺, Zn²⁺ y Cu²⁺ •Moléculas orgánicas: - Coenzimas: Se unen de forma transitoria (vitaminas y sus derivados NAD⁺ o la coenzima A). - Proteicos: Conocidos como grupos prostéticos y se unen firmemente a la enzima (Flavina).
36
¿Qué función tienen estos cofactores?
1.Estabilizar cargas negativas, para favorecer el plegamiento de proteínas 2.Atraer y fijar el sustrato para convertirlo en producto 3.Facilitar las reacciones de oxido reducción.
37
Catálisis enzimática
Los catalizadores reducen la energía de activación hasta 8 grados de magnitud (100,000,000 veces).
38
Modelos enzimáticos
Permiten describir la interacción entre la enzima y el sustrato. Modelo de llave-cerradura (Fischer 1894). •Alta especificidad. •La interacción es estática y no cambia la forma de la enzima (falta de dinamismo). Modelo de ajuste inducido (Koshland 1958). •Más flexible con la especificidad. •La interacción puede inducir cambios conformacionales en la enzima para tener un mejor sitio de unión.
39
Clasificación de las enzimas por el tipo de reacción que realizan
•Oxidorreductasas: Catalizan reacciones de oxido-reducción (Lactato deshidrogenasa) •Transferasas: Catalizan la transferencia de grupos metilo, glucosilo o fosforilo (GTP) •Hidrolasas: Catalizan la ruptura hidrolítica de enlaces covalentes (amilasa) •Liasas: catalizan la ruptura de enlaces covalentes por eliminación de átomos generando dobles enlaces (piruvato descarboxilasa) •Isomerasas: catalizan cambios geométricos dentro de una molécula (triosafosfato isomerasa) •Ligasas: catalizan la unión de 2 moléculas utilizando ATP (ADN ligasa)
40
Inhibidores enzimáticos
La actividad enzimática debe ser regulada a través de mecanismos de inhibición enzimática. Son una molécula que se une a una enzima y disminuye su actividad. Esta unión puede ser reversible o irreversible.
41
Inhibición competitiva
Existencia de 2 moléculas que pueden unirse al sitio activo de la enzima. Por lo que, compiten entre ellos para poder unirse al sitio activo. La Km aparente (Km) aumenta La Velocidad Máxima (Vmax) no cambia
42
Inhibición competitiva alostérica
•La enzima posee otro sitio de unión (Sitio de unión alostérica). •Al unirse, cambia la forma de la enzima y reduce su actividad catalítica. •Puede controlar la velocidad de reacciones en cascada. La interacción con el modulador alostérico es transitoria Básicamente se deforma la enzima y se pierde el sitio de unión y la enzima ya no funciona.
43
Inhibición no competitiva
Tanto el inhibidor como el sustrato pueden unirse. Pero la unión del inhibidor impide la actividad catalítica de la enzima. En esta inhibición la estructura terciaria cambia si es alosterico. NO afecta la afinidad de la enzima por el sustrato (Km no cambia). Lo único que hace es impedir que la enzima catalice la reacción, reduciendo la Vmax.
44
Inhibición mixta
•El inhibidor puede unirse a la enzima libre y al complejo enzima-sustrato. Afectando tanto la afinidad de la enzima por el sustrato como la velocidad máxima de reacción. •La inhibición mixta implica que el inhibidor tiene diferente afinidad por la enzima en su estado libre y en su estado unido al sustrato.
45
Cinética enzimática
El estudio de la velocidad a la que ocurren las reacciones bioquímicas catalizadas por enzimas.
46
Las reacciones enzimáticas pueden clasificarse en:
Reacciones de orden cero n=0 -> V = K En una reaccion de orden cero, la velocidad de reacción es constante y entonces, independiente de la concentración del reactante A. Reacciones de primer orden n=1 V = C en una reacción de primer orden, La velocidad de reacción es directamente proporcional a la concentreción del reactante A. Reacciones de segundo orden n=2 V = KCA En una reacción de segundo orden, la velocidad es proporcional al cuadrado de la concentración del reactante A.
47
Factores que afectan la velocidad de reacción
influyen en la Vmáx PH ➢Cambios en la carga de los aminoácidos. ➢Cambios en la estructura terciaria ➢Disociación de iones ➢Modificación de los grupos funcionales TEMPERATURA ➢ La Temperatura aumenta la Vmax. ➢ Altas Temperaturas desnaturalizan a las proteínas perdiendo su estructura terciaria. Se rompen los enlaces no covalentes. ➢ aumentó de temperaturas aumenta velocidad de las moléculas COFACTORES ➢ Un exceso de cofactores podría generar competencia entre ellos e interrupción de el correcto funcionamiento de la enzima. CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO La velocidad de una reacción enzimática aumenta con la concentración del sustrato hasta alcanzar un punto máximo donde la enzima se satura. La constante Km indica la concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es Vmax/2 V0= Vmax[S] /Km + [S]
48
pepsina:
Enzima digestiva creada en el estómago (peptidasa). PH1.5
49
La ureasa:
Enzima que cataliza la hidrólisis de urea a dióxido de carbono y amoníaco.
50
La Arginasa:
Enzima hidrolasa que cataliza la conversión de L-arginina en L-ornitina y urea. Ph: 9.7
51
aminoácidos condicionalmente no esenciales
son aquellos que normalmente el organismo puede sintetizar por sí mismo, pero que en ciertas condiciones especiales (estrés, enfermedad, crecimiento rápido, prematuridad, quemaduras, sepsis, etc.) la demanda excede la capacidad de síntesis y entonces se vuelven "esenciales" en la dieta. Arginina Cisteína Glutamina Tirosina Glicina Prolina
52
Energía libre de Gibbs
Energía presente en moléculas Más energía crea más inestabilidad que favorece a que ocurran las reacciones ya que quieren tener más estabilidad
53
Sustrato
Mismo que reactivó, en Joules
54
Catalizadores
Aceleran reacciones ya que aumentan probabilidad de choque
55
Prostetico
Cofactor
56
Delta G
Energía final - energía inicial Cambio en la Energía Libre de Gibbs y es la medida de la energía útil disponible para realizar trabajo nos dice si una reacción es energéticamente favorable
57
Orden de reacción
Qué tan rápido puedo hacer la reacción en relación a la concentración de sustratos. En una prueba al aplicar el químico entre más color tiene más velocidad de reacción hay
58
Eje x, Eje Y
Concentración de sustratos - X Velocidad de reacción - Y
59
A partir de que temperatura se desnaturaliza una proteína (enzimas tmb)
40º
60
Meceta
Punto donde la velocidad no puedo aumentar.m cuándo se alcanza. En máximo se producen inhibidores para alcanzar nuevamente el punto basal.
61
Km
Constante de afinidad. Está a la mitad de la concentración máxima en el eje Y. Es la concentración de sustrato a la cual la velocidad de reacción enzimática es la mitad de su velocidad máxima (Vmax). “medida de la afinidad que tiene una enzima por su sustrato.”
62
Donde está el Glucógeno almacenado
Hígado y Musculos
63
Para que sirven carbs en la membrana
Señalización Reconocimiento Adherencia
64
Polivalentes
Tienen OH en cada carbón, esto permite gran capacidad de disolución
65
Determina giro D o L
Penúltimo carbono, ósea ultimo carbono del tipo quiral.
66
Km BAJO
(Ej: 0.1 mM) -> Alta Afinidad. La enzima necesita una concentración muy baja de sustrato para alcanzar la mitad de su velocidad máxima.
67
Km ALTO
(Ej: 100 mM) Baja Afinidad. La enzima necesita una concentración muy alta de sustrato para alcanzar la mitad de su velocidad máxima. Le cuesta trabajo unirse al sustrato
68
aumento de la Km aparente
La inhibición es competitiva. la enzima requiere una mayor concentración de sustrato para alcanzar la mitad de la Vmax. desplazamiento de la curva hacia la derecha en una gráfica - Km aumenta (Km aparente > Km real) - Vmax permanece sin cambios - El inhibidor generalmente se parece estructuralmente al sustrato
69
70
Vmax disminuye, Km no cambia
No competitiva
71
tanto Vmax como Km disminuyen
Acompetitiva
72
disminuye la Vmax pero no altera la Km
Inhibición No Competitiva Pura Alostérica la afinidad por el sustrato sigue siendo la misma, pero la enzima no puede convertir el sustrato en producto tan eficientemente
73
disminuye la Vmax y aumenta la Km
Inhibición Mixta Alostérica disminuye la afinidad por el sustrato
74
V0= Vmax[S] /Km + [S]
cuando [S] es baja, la velocidad (V₀) aumenta casi linealmente con la concentración de sustrato. A medida que [S] aumenta, la velocidad comienza a aumentar cada vez más lentamente. Finalmente, la curva se aplana y se acerca asintóticamente a Vmax, sin llegar a superarla nunca.