1
Q
Acides nucléiques dans l’ADN
A
Adénine
Thymine
Guanine
Cytosine
2
Q
Acides nucléiques dans l’ARN
A
Adénine
Uracil
Guanine
Cytosine
3
Q
De quoi sont composés les nucléotides
A
Nucléoside + PO4(2-)
4
Q
De quoi sont composés les nucléosides
A
Baze azotée + Pentose
5
Q
Liaison entre Pentose et Baze azotée
A
Liaison glycosidique
6
Q
Liaison entre Pentose et phosphate
A
Liaison phosphoester
7
Q
Nommez les purines
A
Adenine
Guanine
8
Q
Nommez les pyrimidines
A
Uracil
Thymine
Cytosine
9
Q
Différence entre acide ribonucléique et acide désoxyribonucléique
A
Présence (Ribo) ou abscence (Désoxy) du groupe hydroxyle sur le carbone C2’
10
Q
Qu’est ce qu’une liaison osidique
A
Liaison covalente entre le groupement hydroxyle du carbone anomère d’un ose et le groupement acide d’une autre molécule
11
Q
Que produit la formation d’une liaison osidique
A
De l’eau
12
Q
Liaison entre le 2e et le 3e phosphate des nucléotides
A
Liaison phosphoanhydre (riche en énergie)
13
Q
Principale fonction des nucléotides (2)
A
- Transfert d’un groupe phosphate (P) ou diphosphate (PP) à différents substrats
- Transfert d’un groupe «Adénilyl, guanidilyl, etc.»
14
Q
Sens de nomenclature des chaînes de nucléotides
A
De l’extrémité 5’-3’
15
Q
Combien de charge négative à l’extrémité 5’
A
2
16
Q
liaison entre les nucléotides
A
3’-5’ phosphodiester
17
Q
Structure de l’ADN (2 éléments)
A
2 brins antiparallèles appariés
Squelette sucre-phosphate
18
Q
Règle de Chargaff
A
- Ration purine/pyrimidine = 1
- A=T, G=C, donc A+G=T+C
19
Q
Combien de liens entre A et U (ou A et T)
A
2
20
Q
Combien de liens entre G et C
A
3
21
Q
Caractéristiques de la double hélice d’ADN (ADN-B) (5)
A
- Bases empilées dans le plan perpendiculaire à la page (escalier en spirale)
- Sucre-P-Sucre hydrophile sur les bords de l’hélice
- Centre de l’hélice hydrophobe
- Hélice droite
- Sillon majeur et mineur
22
Q
Caractéristiques ADN déshydratée (ADN-A) (3)
A
- Hélice droite
- Sillons égaux
- Plus compacte (moins espace entre les bases)
23
Q
Caractéristiques ADN-Z (3)
A
- Hélice gauche
- Pas de sillon
- Riche en G et C
24
Q
Forces qui stabilisent l’ADN-B (4)
A
- Effet hydrophobe (paires de bases)
- Forces de Van der Waals (empilement bases)
- Pont H (AT vs GC)
- Ponts salins (gr phosphodiesters négatif et cations Mg+)
25
Qu'est ce que la température de fusion Tm
Température de détachement des brins (50% est en simple brin)
26
1er niveau d'enroulement de l'ADN
Nucléosome
27
Qu'est ce que les histones
5 protéines basiques octamériques autour desquels s'enroule l'ADN
28
Quel est le facteur de condensation du nucléosome
10X
29
Qu'arrive-t-il à la chromatine en milieu de faible force ionique
Décondensation et formation d'un «collier de perles»
30
Quel est le 2e niveau de condensation de l'ADN
La chromatine (solénoïde)
31
Quel est le rôle de l'histone H1
Stabiliser la chromatine
32
Facteur de condensation de la chromatine
4X
33
lorsque la chromatine forme des boucles, sur quoi s'accrochent-elles
une charpente de protéines non-histones
34
Quelle est le facteur d'enroulement des boucles en mini-bandes
200X
35
Quel est le facteur de condensation total de l'ADN
8000X
36
Quelle est la structure du chromosome
Empilement de mini-bandes stabilisées par des complexes de protéines et d'ARN
37
Combien de chromosome chez l'humain
23 paires (donc 46 molécules d'ADN double brin)
38
Qu'est ce qui est nécessaire dans la division cellulaire
Une copie intacte et parfaite du génome
39
Dogme central de la biologie moléculaire
Réplication-Transcription-Traduction
40
2 fonctions de l'ADN
1. Stabilité de l'information (transmission fidèle)
2. Transmission de l'information
41
Pourquoi la structure de l'ADN est favorable à jouer le rôle de gardien de l'info génétique
1. Réplication est fidèle
2. Mécanismes de réparation efficaces
3. Transfert de l'information à l'ARN
42
3 possibilité pour la réplication de l'ADN
1. Semi-conservative
2. Conservative
3. Dispersive
43
De quelle façon se réplique l'ADN
Semi-conservative
2 brins se détordent et chaque brin sert de matrice pour la formation d'un nouveau brin complémentaire
44
Comment a-t-on découvert que la réplication d'ADN était semi-conservative
Fait pousser des E. Coli en présence de N15 (biomolécules faites de N15), puis on les transfert dans un environnement riche en N14
*1 brin N15 et 1 brin N14*
45
Par quelle enzyme la polymérisation de nucléotides est-elle catalysée
ADN polymérase
46
Sens de la polymérisation des nucléotides
5' vers 3'
47
Qu'est ce qui est nécessaire pour débuter la polymérisation de nucléotides
Une amorce d'ARN
48
Enzyme séparant les 2 brins matrices d'ADN
Hélicases
49
Point de départ du déroulement chez E. Coli et les eucaryotes
Origine de réplication (riche en AT)
50
Origine de réplication des procaryotes
OriC : déclenche le déroulement de l'ADN par les hélicases
51
Origine de réplication chez les eucaryotes
Levure : similaire aux séquences des procaryotes
Eucaryotes supérieurs : Variable, dépend de la structure de la chromatine (régions dépourvus de nucléosomes)
52
Qu'est-ce que l'ORC
Complexe de reconnaissance de l'origine de réplication
*S'associe à des protéines pour recruter hélicases*
53
Eucaryote ou E. Coli : une seule origine de réplication qui progresse dans les 2 sens
E. Coli
54
Eucaryote ou E. Coli : plusieurs origines de réplication qui progressent dans les 2 sens
Eucaryotes
55
Enzyme qui relâche le surenroulement de l'ADN
Topoisomérase
56
3 étapes pour relâcher le surenroulement de l'ADN
1. Coupure
2. Désenroulement
3. Réparation
57
Comment s'Appelle la machinerie protéique capable de répliquer le génome chez les procaryote
Réplicateur (ou réplisome)
58
Qu'arrive-t-il quand les 2 fourches de réplication se rencontrent chez les procaryotes
Les 2 chromosomes se séparent
59
Enzyme qui ajoute l'amorce d'ARN pour la synthèse du brin avancé
Primase
60
3 avantages de l'utilisation d'amorce d'ARN
1. Ajouté sans contrôle-qualité
2. ARN va être facilement reconnu puis dégradé
3. Conservation de l'ADN seulement
61
Rôle ADN polymérase I (chez E. Coli)
Répare ADN et prend part à la synthèse de l'un des brins au cours de la réplication
62
Rôle ADN polymérase II (chez E. Coli)
Collabore à la réparation de l'ADN
63
Rôle ADN polymérase III (chez E. Coli)
Composant-clef du réplicateur
Enzyme principale de la réplication de l'ADN
Assure l'élongation de la chaîne au cours de sa réplication
64
Rôle ADN polymérase alpha et delta (eucaryotes)
Allongement de la réplication d'ADN
65
Rôle ADN polymérase bêta (eucaryotes)
Enzyme de répartion dans le noyau
66
Rôle ADN polymérase gamma (eucaryotes)
Réplication de l'ADN mitochondrial
67
De quelle façon est synthétisé le brin retardé
Discontinue (petits fragments 5'-3')
*Dans le sens opposé au déplacement de la fourche*
68
Comment s'appelle les petits fragments synthétisés à partir du brin retardé
Les fragments d'Okazaki
69
Enzyme digérant les amorces d'ARN
Rnase H
70
Enzyme liant les fragments d'Okazaki
ADN ligase
71
2 domaine que possède la Rnase pour digérer les amorces d'ARN
1. HBD (hybrid binding domain)
2. Catalytique (H-domain)
72
Qu'est ce que l'activité 3'-5' exonucléase de l'ADN polymérase lui permet de faire
De reculer quand il y a une erreur pour enlever le nucléotide et reprendre la synthèse
73
Quand est ce qu'on termine la réplication de l'ADN
E. Coli : au site de terminaison (protéine tus empêche la fourche de dépasser le site)
Eucaryote : Rencontre de 2 répliosomes provenant de 2 OR différentes
74
Que fait-on avec les histones lors de la réplication de l'ADN (2)
1. On les déplace pour décompacter l'ADN
2. Synthèse concomitante d'histones
75
2 raisons pourquoi l'ADN est la seule macromolécule réparable
1. Lésions ans l'ADN menacent l'intégrité de l'organisme (même si très couteux énergétiquement)
2. La cellule ne tire aucun avantage à réparer les autres macromolécules
76
3 raisons pourquoi l'altération de l'ADN est inévitable
1. ADN polymérase commet des erreurs
2. Métabolisme cellulaire expose l'ADN aux effets dommageables des espèces réactives de l'oxygène
3. Agents environnementaux (UV, agents chimiques, etc.) endommagent physiquement l'ADN
77
Que provoque les rayons UV (à la thymine)
Dimérisation des thymines
78
Pourquoi la réplication de l'ADN est impossible en présence de dimères de thymine
Les dimères distordent le brin matrice
79
Réparation par photoréaction
Photolase se fixe sur l'ADN en face du dimère de thymine et la dimérisation s'inverse dès que l'enzyme est activée par la lumière
80
Réaction par excision de bases (BER)
ADN glycosylases catalysent l'élimination des bases altérées (hydrolyse la liaison N-glycosidique)
81
En milieux aqueux, que forme la désamination hydrolitique de la cytosine
De l'uracil
82
Quelle enzyme peut réparer l'ADN (BER) en remplaçant l'uracil par la cytosine
L'uracil-ADN glycosylase
83
Utilité de la réparation par excision de nucléotide (NER)
Réparation des dommages causés par la lumière UV et les radicaux libres
84
Fonctionnement de la réparation par excision de nucléotide (NER)
Segment contenant le nucléotide endommagé + 30 de ses voisins est retiré. La lacune résultante est comblée par une ADN polymérase qui utilise le brin complémentaire intact comme matrice
85
Qu'est ce que les radiations et les radicaux libres peuvent causer à l'ADN
Des cassures de la double hélice
86
Fonctionnement de la réparation par jonction des extrémités non-homologues (NHEJ) (3 étapes)
1. Ku reconnait les extrémités cassées et les aligne
2. Ku recrute des endonucléases et des polymérases pour rogner jusqu'à 10 résidus
3. ADN ligase, polymérase et nucléase termine la réparation
87
Vrai ou faux : L'ADN réparer par jonction des extrémités non homologues (NHEJ) génère une molécule dont la séquence est identique à l'ADN originale
Faux, la séquence peut différée de celle de l'originale
88
Vrai ou faux : La réparation de l'ADN par jonction des extrémités non homologues est propice aux erreurs
Vrai
89
Qu'est ce qui est nécessaire dans la réparation par recombinaison homologue (HR)
Une autre molécule d'ADN double brin homologue
90
Qu'est ce qui est nécessaire pour qu'un simple brin d'ADN puisse envahir un autre ADN homologue (réparation par recombinaison homologue)
Des protéines de recombinaison liant l'ADN simple brin (Rad51)
91
Vrai ou faux : la réparation par recombinaison homologue est plus propice aux erreurs que la réparation par jonction des extrémités non homologues
Faux, elle est moins propice aux erreurs
92
Quelle peut être la conséquence d'accumulation de mutations
Augmentation de la susceptibilité au cancer
BCM Laue
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Cours 2 : protéines78
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Cours 3 : glucides lipides68
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Cours 6 : Enzymes44
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Cours 4-5 : métabolisme glucides38
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Cours 7 : métabolisme des lipides66
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Cours 8 : bioénergétique57
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Cours 9 : métabolisme des composés azotés90
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Cours 10 : ADN92
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Cours 11 : Transcription + maturation ARN102
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Cours 12 : Synthèse protéique80
