Cours 3 Flashcards

(66 cards)

1
Q

Def de la génétique humaine

A

Spécialité médicale qui s’intéresse aux maladies rares

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Q

Qui sont les patients en génétiques humaines

A

Patients :
Malformations congénitales : fentes labiales, surdité , anomalies rénales
Troubles du développement : difficultés de croissance , retard dvlp moteur
Maladies évolutives : neuro dégénératives , cardiopathies

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3
Q

Quels sont les différents voies du médecine généticien

A

Cliniques (consultations) : pédiatrique , oncogenetqiue
Génétique biologique : cytogénétique et génétique moléculaire

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4
Q

Quel est le but de la consultation génétique

A

Établir un diagnostic
Évaluer le rôle des facteurs génétiques
prévention
Étude familiale
Diagno pré symptomatique

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Q

quel est le but d’une consultation

A

Établir un diagnostic

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6
Q

Prélèvement post natal se fait ou

A

Sang
Biopsie de peau
Frottis jugal
Urines
Tumoraux
Organes post mortem

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7
Q

Comment se font les prélèvements prénatal

A

8nvasif : BT, amniocentese, sang foet1le
Nn invasif : sanguin mat ou parentaux

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8
Q

Comment se fait un caryotype méthode

A

Prélèvement sur tube heparine
Sur un prélèvement fœtal
Analyse sur les leucocytes
But : cellules en métaphase

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9
Q

Comment est classe le caryotiqhdp

A

Par paires , taille ( grand ou petit ),

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10
Q

Quels sorn les avantages du caryotype

A

Analyse pangenomique
Détection anomalies chromo équilibre et déséquilibre
Détection de mosaïque

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11
Q

Quels sorn les inconvénients du caryotype

A

Limites de résolutions 5 à 10 mb

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12
Q

Quels sorn les indications du caryotype en postnatal

A

Trouble dvlp sexuel
Phénotype évocateur anomalie chromo
Apparente de pers porteuse d’anomalie de structur chromo
Atcd mort feotale
Fc et infertilité

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13
Q

Def fish

A

Technique qui se base sur les propriétés de dénaturation et renaturation de l’ADN
Hybridation in situ fluorescence
Permet de détecter la présence ou l’abs de la position d’un gène
Cytogénétique mol

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14
Q

Fish se passe sur qui

A

En métaphase
Sur les noyaux interphasiques

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15
Q

Quels sont les avantages de la fish

A

résolution de + petite taille
Détecte ion anomalie chromo équilibre et déséquilibre
Recherche de microdeletion
Rapidité ( 48h)

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16
Q

Quels sorn les inconvénients de la fish

A

Analyse ciblée

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17
Q

Quand la fish est indiqué en postnatal

A

Recherche syndrome microdeletionnel / dupl
Étude des remaniements subtelomeriques
Évaluation d’une mosaïque
Confirmation d’un réarrangement chromosomique au caryotype
Précision des points de cassure
Étude des gonosomes

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18
Q

Def analyse chromosomique par puce à adn = CGH array

A

Sur tube EDTA
Recherche CNV
Colorant : perte ou gain

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19
Q

Def CGH array

A

Mélanger l’ADN du patient et du témoin reprenste par des couleurs
Et faire la lecture des fluorescences
Cytogénétique ( tt gen)

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20
Q

Def CGH array

A

Mélanger l’ADN du patient et du témoin reprenste par des couleurs
Et faire la lecture des fluorescences

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21
Q

Quels sont les avantepages de l’acpa

A

Résolut! :5 à 200 kb
Analyse pangenomique

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22
Q

Quels sont les inconvénients de l’acpa

A

Détection uniquement des anomalies déséquilibres
Difficultés d’interprétation des cnv de signification incertaine

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23
Q

Comment se fait l’interprétation de l’acpa

A

Par une base de données : Soit bénin ou polymorphisme ,Pathogène ou délétère
Par étude parentale : de novo , hérédité d’un parent

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24
Q

Quels sont les éléments d’étude cytogeniqhe

A

Analyse ciblée : fish
Analyse pangenomique : caryotype, acpa

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25
Def biologie mol
Étude de la séquence d’ADN Par NGS : étudier un panel de gènes , exome : analyse exons, génome
26
Def séquençage sanger
Séquençage par terminaison de chaîne Détermination de la séquence d’ADN
27
Def panel de gènes
Plusieurs gènes séquences en mm tps Centre sur un grp de pathologies
28
Exome et génome point commun
Analyse pangenomique
29
Def analyse des variants
Filtrer les variants selon les critères de pathogenicite
30
Quels sorn les éléments pris en compte dans les analyses de variants
Type de variant Conséquence prédite Prenste dans base de donnés Interet du gène mute Ségrégation familiale
31
Quels psnr les types de variants
Délétion Insertion;
32
Quels sont les csquce des variants ponctuels
Variants troquants ou perte de fonction Insertion ou délétion avec décalage du cadre de lecture Sites consensus d’epissage Variants faux sens
33
Quel est l*intert du gène mute dans les variants
Gène connu en pathologie Phénotype compatible Type de variant cohérent Mode de transmission cohérent
34
Quels sont l es 5 catégories de variants
Pathogène Probablement pathogène Signification inconnue : pas le droit de faire recherche Probablement bénin Bénin
35
Def diagnostic prénatal
Détection et reconnaissance au cours de la grossesse d’une affection
36
Def CPDPN
Mission d’aider les équipes médicales et les couples : dans l’analyse, la prise de décision et le suivi de la grossesse lors ‘d’une malformation ou anomalie fœtale
37
Situation pour entrainer l’img
Santé de la femme mise en péril si grossesse se poursuit Enfant à naître forte probabilité d?être atteint avec gravité reconnue comme incurable
38
Quans est mise en place img
Tout moment de la grossesse
39
Def foetopathologie
Examen autopsique du fœtus après img Cas d’abs diagno étiologique
40
Quels sont les test génétiques non invasif en pré Natal
Dpni: dépistage combiné t21 Sexe fœtale Dpni exclusion de variant pathogène
41
Quels sont les test génétiques invasif en pré Natal
Caryotype foetal Fish Acpa Panel de gènes Exome
42
De qd a qd se passe la bt
11 à 14 sem
43
Quand débute l’amniocentese
A 16 sem
44
Comment se fait le dépistage combiné de la t21
Âge mat Clarté nucale Marqueurs sériques mat du 1re trimestre : papp a et bêta HCG
45
Quand se fait le dépistage de la t21
1re trimestre
46
Comment évolue les risques dans le dépistage de la trisomie 21
< 1/1000 : suivi habituel Compris entre 1/1000 et 1/51 : prise de sang négatif ou posi Sup a 1/50: amniocentese ou choriocentese
47
Jusqu’à quand se font l’avortement par aspiration
16 sem
48
Quand se fait le dépistage t21 si pas 1re trimestre
A 22e me
49
Quel est le % de l’ADN foetale dans le sang de la mère
10%
50
Def dpni dépistage Aneuploidies
Si positif Vérifie par un prélèvement invasif
51
Def diagnostic prénatal non invasif d’exclusion de variants pathogènes
Diagnostic de maladie monogénique : Variant identifie dans la famille Étude de ségrégation parentale faite Mutation abs du plasma mat Analyse qualitative = dpni d’exclusion
52
Fish indication en pré natal
Recherche ant
53
Def indication d’acpa en pré natal , signes cliniques ?
Hyper clarté nucal Syndrome poly malformatif Cardiopathie Association de signes atypiques
54
Condition de l’exoome en prénatal
Slmt si résultat génétique fait changer d?avis le couple Utilité clinique Prélèvement des 2 parents Discute en CPDPN
55
Quels sont les 2 méthodes de diagnostic
Cytogénétique : anomalies de chromosomes Biologie moléculaire : anomalie des gènes
56
Quels psnr les 2 méthodes d’acpa
CGH array Snp array
57
Def snp array
Log radio de l’ADN patient / adn référence Dans l’acpa
58
Def séquençage NGS
Séquençage parallèle aléatoire d’un très grand nb de frag dans un même milieu
59
Def de la ségrégation familiale
Permet de filtrer les variants en fonction de leur transmission
60
Comment se fait la recherche du sexe fœtal
ADN fœtal circulant Recherche la présence de chromosome Y dans le sang mat
61
Dans quelle maladie intérêt de la recherche de sexe fœtal pr
Myopathie de Duchene
62
Quels sont les test génétiques possibles en prénatal non invasif
Dpni Sexe fœtal Dpni d’exclusion de variant pathogène
63
Quels sont les test génétiques possibles en prénatal invasif
Caryotype fœtal Fish Acpa Panel de gènes Exome
64
Quels sont les indications du caryotype en prénatal
Risque sup a 1/50 Signes d’appels echographique ou malformation Atcd couple de déséquilibre chromo Parents porteurs remaniements chromo
65
Recherche adn fœtale circulant fait quand
1re trimestre
66
Date biopsie de trophoblaste
Entre 11 et 14 sem