Was sind Vektoren?
Plasmide oder Bakteriophagen, die in der Lage sind, Fremd-DNA in einen anderen Organismus einzuschleusen (“Gentaxi”, “Genfähre”)
Was sind Restriktionsenzyme?
Schneiden DNA an spezifischen palindromischen (Palidnrom: ANNA) Sqeuenzenerzeugen Blunt- oder Sticky-Ends;
Was ist LIgase?
(DNA-Replikation) verbindet Desoxyribose-phosphat-Gerüst der DNA
Was sind Marker-/Reportergene?
Codieren Antibiotica-Resistenzen oder Bildung von Farbstoffen (XGal, GFP) -> Selektion erfolgreich transformierter Bakterien
Was sind Stempeltechnik?
Replizieren von Bakterienkolonien auf Agarplatten mit gleicher Lage!
Was ist Transformation?
Veränderung des Genoms von Lebewesen, Einschleusen von Fremd-DNA
Was ist ein Hybridplasmid?
Plasmid mit Fremd-DNA
Was ist der genetische Fingerabdruck?
DNA-Profil eines Individuums, das in hohem Maße charakteristisch für dieses ist (Ausnahme: eineiige Zwillinge). Das genetische Material wird aus Gewebeproben (Hautzellen, Haarfollikel..) oder Sekreten (Blut, Speichel, Sperma…) gewonnen.
Was sind Gene?
codierende Bereiche der DNA sind stark konserviert, kaum individuelle Abweichungen vorhandne
Was schaut man sich an wenn man DNA verlgeichen will?
Analyse von nicht codierenden Bereichen, dort sammeln sich Mutationen individuell an
-> Ofe Mikrosateliten (=STR, short tandem repeats): Kurze sich wiederholende Basensequenzen (zB TACTAC)
Wenn es wenig DNA Material ist, wie kann man Proben überhaupt vergleichen?
Vervielfältigung der gewünschten Sequenzen durch PCR anschließend Vergleich der Proben durch Gel-Elektrophorese
Was ist die PCR?
Methode zur in-vitro-Vervielfältigung von DNA und RNA
Was braucht man für eine PCR?
Genetische Probe, spezifische Primer (vorwärts- + Rückwärtsprimer), DNA-Nukleotide, hitzebeständige DNA-Polymerase
Wie läuft die PCR ab?
Nach dem 3. Zyklus liegen dann doppelstänge in der gewünschten Länge vor die keine überstehenden Einzelstränge mehr haben
Was ist die Gel-elektrophorese?
physikalische Auftrennung von RNA/DNA-Molekülen (oder Proteinen) nach ihrer Größe
Wie funktioniert die Gel-Elektrophorese?
Aufgrund der endständigen, freien Phosphat-Gruppen (PO43-) sind DNA- oder RNA-Moleküle negativ geladen
* Es wird ein elektrisches Feld angelegt. Die Proben werden nahe des Minus-Pols in das Gel gegeben und
bewegen sich in Richtung des Plus-Pols
* Je größer das DNA-Fragment, desto langsamer bewegt es sich durch das Gel → Auftrennung in Banden
* DNA-Längenstandard wird mit aufgetragen, um Länge der DNA-Stücke abschätzen zu können
Was ist die DNA-Chip-Technologie?
Methode, um Genexpression in bestimmten Zellen zu messen oder Genome auf das
Vorhandensein bestimmter Sequenzen zu untersuchen.
Wie funktioniert die DNA-Chip-Technologie grob?
Glas- oder Kunststoffplatten, auf denen sich in einem Raster DNA-Sonden befinden.
* Deren Sequenz und genaue Position auf der Platte werden digital gespeichert
* Durch komplementäre Basenpaarung und Fluoreszenzmarkierung erfolgt Identifikation
Wie wird bei der Genomanalyse mit DNA-Chip-Technologie vorgegangen?
Spotting: Aufbringen der DNA mit bekannter Sequenz auf definierte Postition der
Platte
o mRNA wird isoliert und mit reverser Transkriptase in einzelsträngige copy- DNA
(=cDNA) umgewandelt
o Die cDNA (oder „normale“ DNA Probe) wird auf das Microarray gebracht.
Komplementäre Sequenzen Hybridisieren mit DNA auf Chip, Rest wird
abgewaschen
o Auswertung: cDNA wird mit Fluoreszenzfarbstoff markiert → je nach Intensität
der Fluoreszenz wurde unterschiedlich viel gebunden → Aussage über Intensität
der Genexpression
o Auch mit mehreren mRNA-Proben aus zwei unterschiedlichen Geweben
möglich. Die entstehende cDNA wird dann mit unterschiedlichen
Fluoreszenzfarbstoffen (blau und gelb) markiert
o Aufnahme von zwei identisch gespotteten Platten, einmal mit Probe 1 und
einmal mit Probe 2 hybridisiert.
o Fluoreszenzaufnahmen werden übereinandergelegt. Blau = Sequenz nur in Probe
1; Gelb = Sequenz nur in Probe 2; Grün (Mischung d. Farben) = Sequenz in beiden
Proben enthalten.
Was ist Reverse Transkriptase?
Enzym aus RNA-Viren, die einzelsträngige RNA-Moleküle in
einzel- oder doppelsträngige DNA transkribiert. Eine so entstandene DNA nennt man
cDNA
Was ist CRISPR CAS und was kann es?
Leitet sich aus dem natürlichen Immunsystem von Bakterien gegen Bakteriophagen ab
* Programmierbare Genschere mit Einsetz-Funktion
* Enzym CRISPR erkennt mit komplementärer guide-RNA die jeweilige Zielsequenz und
schneidet diese dort
* Protein CAS9 mit Fremd-DNA fügt diese in die durch CRISPR erzeugte Schnittstelle ein
und verbindet diese mit der ursprünglichen DNA zu einem durchgängigen DNA
Doppelstrang
Was versteht man unter Gentherapie?
Gentechnische Veränderung des menschlichen Erbguts zur Behandlung von
Erbkrankheiten
Wofür steht die Abkürzung PND?
pränatale Diagnostik
Wofür wird die PND verwendet?
Erkennung von schwerwiegenden genetischen Defekten (oder anderen
Erkrankungen)