- Le domaine de la biologie moléculaire est né de cette recherche
avec les phages
La biologie moléculaire est fondée sur l’étude des bactériophages
Par exemple, la recherche sur les phages:
-a établi que les acides nucléiques sont des matériaux génétiques et pas des protéines
-a découvert des mécanismes de la régulation des gènes
-a discerné comment les protéines se replient («fold»)
-a élucidé la recombinaison génétique
-a démontré l’évolution des organismes par le transfert horizontal de gènes
ok
Les phages sont actuellement classés principalement selon :
- leur composition d’acide nucléique (ex. ADN or ARN)
- leur morphologie (ex. la présence d’une queue, son type et sa longueur) -d’autres propriétés structurales (ex. présence d’une membrane lipidique)
taxonomie des bactériophages
- __ ordre, ___ familles
1
10
la morphologie des phages est-ce vrm la meilleure facon de classer des phages ??
- Nous ne pouvons pas déterminer la morphologie de tous les phages que nous avons identifiés (ex. dans les données métagénomiques de l’environnement)
- Les prophages sont largement méconnus dans le système taxonomique actuel
- la taxonomie actuelle classe «Salmonella phage P22» et «Phage λ» sous différentes familles en fonction de leur morphologie, même s’ils sont presque génétiquement identiques
taxonomie des phages est-ce la meilleure methode.. pk pas
- elle est fondée sur la transmission verticale des caractéristiques génétiques. Mais le transfert horizontal de gènes est endémique chez les phages, résultant en un haut degré de mosaïcisme
- les phages ne peuvent pas partager d’ancêtre commun
- les phages ne contiennent pas de gènes universellement conservés (l’équivalent de l’ARNr dans les cellules)
Un virion peut produire plus de ___ en ___
100 descendants
infectieux en ~1h
Il se produit ____ productives par seconde pour maintenir la population mondiale de phages___
10à la 24 infections
à 1031
- une fois que le phage adsorbe à la cellule hôte, l’union de la cellule et du phage est appelée
la viro-cellule («virocell»)
14-15
ok
mode de vie ____
- Certains phages sont capables d’établir un partenariat temporaire avec la cellule hôte
- Le phage reporte la production de virions en échange d’une habitation provisoire dans la cellule hôte
- Le génome du phage est répliqué au cours de la réplication du génome de l’hôte
tempéré
- Les phages qui ne commencent pas le cycle lytique immédiatement après l’infection sont appelés les phages ___ .
- Certains phages synthétisent une ___ qui leur permet d’insérer leur génome dans le chromosome de l’hôte à un emplacement spécifique via la ____ au site (site-specific recombination)
tempérés
intégrase
recombinaison spécifique
voir image 18
ok
- Un génome de phage inséré dans le chromosome de l’hôte est appelé un ____
- une bactérie contenant un prophage est une bactérie
____ - La relation entre un prophage et sa cellule hôte est appelée la____
prophage
lysogène
lysogénie
Un prophage peut protéger une viro-cellule («virocell») de l’infection des phages voisins. Une défense appelée ____
immunité de surinfection
- Lorsque les conditions changent, le prophage peut être excisé du chromosome (appelé ____ ) et entrer dans la voie lytique
induction
20-21-22
ok
-les tailles des génomes de phage vont de ~
4000 pb à 500 000 pb
prophase se réplique par
sissiparité
- Une autre stratégie est la ___ , où le génome viral ne se réplique pas à partir de l’hôte, mais demeure simplement dans la cellule
pseudolysogénie
pseudolysogénie
le génome viral ne se réplique pas à partir de l’hôte, mais demeure simplement dans la cellule..
le genome viral reste juste. il sréplique pas
le genome srend pas dans cellule fille
Le choix entre la lysogénie et la voie lytique
Le choix optimal est celui qui
donnera le plus de descendances au fil du temps
Quels facteurs influencent le choix entre la lysogénie et la voie lytique?
Les facteurs qui influencent “le choix” comprennent:
- la concentration des hôtes potentiels
- la concentration de phage en concurrence
- le pourcentage des bactéries qui sont immunisées contre l’infection (la résistance)
- la durée de vie du virion
- l’état métabolique de l’hôte
- le rendement de lyse («burst size») prédit
24
ok
