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Metabo Flashcards

(40 cards)

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1
Q

Ordre de grandeurs des ΔG°’ des hydrolyses de l’ATP, ADP…

A

ΔG°’ ≈ -30 kJ/mol

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Q

Pourquoi l’ATP possède un haut potentiel de transfert du groupement P ?

A
  • forte répulsion mutuelle des charges (-)

- forte stabilité de résonance du produit formé (car 4 structures mésomères)

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3
Q

Quels groupements dans NAD ?

Quel est le groupement réactif ?

A
  • 1 grpmt Adénosine (Adénine+Ribose)
  • 1 grpmt ribose
  • 1 grpmt Nicotiamide (réactif)
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4
Q

Quels groupements dans FADH2 ?

Quel est le groupement réactif ?

A
  • 1 grpmt Adénosine (Adénine+Ribose)
  • 1 grpmt riboflavine
  • 1 grpmt Isoalloxazine (réactif)
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Q

Par quelles réactions métaboliques sont fournis NADH et FADH2 ?

A

Par la Glycolyse et le Cycle de Krebs

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6
Q

Quels groupements dans CoA ?

Quel est le groupement réactif ? A quoi se lie-t-il ?

A
  • 1 grpmt Adénosine (Adénine+Ribose)
  • 1 grpmt Pantothenate
  • 1 Cystéine
    - Le SH (thiol) de la Cystéine est la fonction réactive. Elle se lie à un Acyl ou un Acétyl.
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7
Q

Krebs 1 (Oxaloacetate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 1 : Acetyl-CoA+Oxaloacetate → Citrate
  • Enzyme: Citrate Synthase
  • Co-facteurs : H2O → CoA-SH
  • ΔG°’ = -32,2 kJ/mol
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8
Q

Krebs 2 (Citrate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 2 : Citrate ↔ Cis-aconitate ↔ Isocitrate
  • Enzyme : Aconitase x2
  • Co -facteur : NON
  • ΔG = 13 kJ/mol
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9
Q

Krebs 3 (Isocitrate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réac 3: Isocitrate → Oxalosuccinate → αcétoglutarate + CO2
  • Enzyme : Isocitrate DH x2
  • Co-facteur sur la 2ème : NAD+ → NADH,H+
  • ΔG = -21 kJ/mol
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10
Q

Krebs 4 (αcétoglutarate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 4 : αcétoglutarate + CoA → Succinyl-CoA + CO2
  • Enzyme : αcétoglutarate DH
  • Co-facteur : NAD+ → NADH,H+
  • ΔG = -33 kJ/mol
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11
Q

Krebs 5 (Succinyl-CoA)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 5 : Succinyl-CoA ↔ Succinate + CoA
  • Enzyme : Succinyl-CoA synthétase
  • Co-facteurs : GDP → GTP
  • ΔG = -3 kJ/mol
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12
Q

Krebs 6 (Succinate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 6 : Succinate ↔ Fumarate
  • Enzyme : Succinate DH
  • Co-enzyme : FAD → FADH2
  • ΔG = 0 kJ/mol
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13
Q

Krebs 7 (Fumarate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 7 : Fumarate ↔ Malate
  • Enzyme: Fumarase
  • Co-enzyme : H20
  • ΔG = -4 kJ/mol
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14
Q

Krebs 8 (Malate)
Noms réactif(s) et produit, nom enzyme, Co-facteurs? Irréversible?
ΔG

A
  • Réaction 8 : Malate ↔ Oxaloacétate
  • Enzyme : Malate DH
  • Co-enzyme : NAD+ → NADH,H+
  • ΔG = 30 kJ/mol
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15
Q

E1 du Complexe Pyruvate DH (PDC):

…… + Cofacteur = ……

A

Pyruvate DH + Cofacteur = TPP (Thiamine PyroPhosphate)

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16
Q

E2 du Complexe Pyruvate DH (PDC):

…… + Cofacteur = ……

A

Dihydrolipoamide acetyltransferase + Cofacteur = Acide Lipoïque

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17
Q

Autre nom de l’E3 du Complexe Pyruvate DH (PDC):

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A

Dihydrolipoyl DH

Flavoprotéine (FAD) utilisant NAD+

18
Q

Quelle co-enzyme du PDC contient un noyau Thiazole ?

19
Q

Dans quelles réactions enzymatique intervient le TPP ?

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A
  • La PDH
  • L’ αc DH
  • La pyruvate décarbocylase (fermentation alcoolique)
  • La transcétolase (voie des pentoses)
20
Q

But de la PDC ? (transformer … en …)

En combien d’étapes ?

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A

Décarboxylation oxydative du Pyruvate en Acetyl-CoA

5 étapes

21
Q

But de la Glycolyse ? (transformer … en …)

EN combien de réactions ?

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A

1 Glucose en 2 pyruvates

10 réactions

22
Q

Lieu de la glycolyse ?

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A

Dans le cytosol

23
Q

Lieu de la décarboxylation oxydative du pyruvate par PDC ?

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A

Mithochondrie

24
Q

Que forme la décarboxylation oxydative du pyruvate ? (en plus de l’acétyl-CoA)

25
La décarboxylation oxydative du pyruvate est-elle endergonique ou exergonique ?
Exergonique : ΔG << 0
26
Glycolyse Phase 1 : Premier et dernier composé, nombre de réactions, ATP, NAD... ?
- Glucose (6C) → ... → DAG x2 (3C) - 5 réactions (2 irréversibles) - 2 ATP utilisés (Réaction 1 et Réaction 3)
27
Glycolyse Phase 2 : Premier et dernier composé, nombre de réactions, ATP, NAD... ?
-2 DAG (3C) → ... → 2 Pyruvates - 5 réactions (1 irréversible) - Par molécule de DAG : 2 ADP utilisés → Création de 2 ATP 1 NAD+ utilisés → Création 1 NADH,H+
28
Bilan de la Glycolyse
1 Glucose + 2 ATP + 2x 2ADP + 2x Pi + 2x NAD+ | → 2 pyruvates + 2x 2ATP + 2x H20 + 2x NADH,H+
29
Glc → G6P : | Etape et phase, enzyme, co-facteurs, changement de groupes, ΔG
``` Etape 1 (Phase 1) irréversible de la Glycolyse Enzyme : Hexokinase Utilise un ATP Grpmt CH2OH → CH2OP (en bas) ΔG = -33 kJ/mol ```
30
F6P → F1,6BP | Etape et phase, enzyme, co-facteurs, changement de groupes, ΔG
``` Etape 3 (phase 1) irréversible de la Glycolyse Enzyme : PhosphoFructoKinase Utilise un ATP Grpmt CH2OH → CH2OP (en haut) ΔG = -22 kJ/mol ```
31
GAP → 1,3 BiPhosphoGlycerate | Etape et phase, enzyme, co-facteurs, changement de groupes, ΔG
``` Etape 6 (étape 1, phase 2) réversible de la Glycolyse Enzyme : GAP DH NAD+ → NADH H → OPO32- (en haut) ΔG = -3,4 kJ/mol ```
32
Phosphoénol pyruvate → Pyruvate | Etape et phase, enzyme, co-facteurs, changement de groupes, ΔG
Etape 10 (étape 5, phase 2) irréversible de la Glycolyse Enzyme : Pyruvate Kinase ADP → ATP ΔG = -35 kJ/mol
33
Les deux réaction qui utilisent de l'ATP dans la phase 1 de la Glycolyse
1 - Hexokinase (Glc → G6P) | 3 - PhosphoFructoKinase (F6P → F1,6BP)
34
Les deux réactions qui fournissent de l'ATP dans la Glycolyse
7 - PhosphoGlycerate Kinase (1,3BPG → 3PG) | 10 - Pyruvate Kinase (Phosphoénol pyruvate → Pyruvate)
35
La réaction qui fournit du NADH dans la Glycolyse
6 - GAP DH (GAP → 1,3BPG)
36
Les 5 complexes de la phosporylation oxydative
``` I - NADH DH II - Succinate DH III - Cytochrome C Reductase IV - Cytochrome C Oxydase V - ATP Synthase ```
37
Angles Helice α
ϕ = -60° ψ= -50°
38
Angles Hélices 3 10
ϕ = -50° ψ= -25°
39
Angles Brin β anti-parallèles
ϕ = -150° ψ= 135°
40
Angles Brin β parallèles
ϕ = -120° ψ= 120°
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