nukleiinihapot
DNA ja RNA
DNA
onko bakteereilla histoneita
ei, niillä on muita proteiineja joiden avulla DNA pakataan tiiviimmäksi
RNA
- useita rakenteeltaan ja toiminnaltaan erilaisia tyyppejä: lähettiRNA, siirtäjäRNA, ribosomiRNA, mikroRNA
miten nukeotidit liityvät viereisiin nukeotideihin
kovalenttisin fosfodiesterisidoksin, joissa kaksi sokeriosaa on liittyneinä toisiinsa fosfaattiryhmän välityksellä
-nukleotidi liittyy viimeisen nukleotidin 3. hiileen fosfaatin välityksellä
montako sidosta A-T ja A-U välillä?
entä C-G?
A-T ja A-U: 2 vetysidosta
C-G: 3 vetysidosta, eli vahvempi rakenne
puriinit ja pyrimidiinit
puriinit: A & G
pyrimidiinit: T, S & U
mitä rakenteellista eroa puriinit ja pyrimidiinit
puriinit: kaksoisrengasrakenne
pyrimidiinit: 1 kuusiatominen rengas
DNA:n replikaatio
DNA:n kahdentuminen
DNA kaksoisjuosteen avaava entsyymi
helikaasientsyymi
uuden DNA juosteen katalysoiva entsyymi (yhdistää juosteet)
DNA-polymeraasi
-tarvitsee RNA-alukkeet!
RNA-aluke
lyhyt, yksijuosteinen RNA-pätkä, joka pariutuu emäspariperiaatteen mukaisesti yksijuosteiseen, avattuun DNA:han.
replikaatiokupla
avautunut DNA:n kaksoiskierre, jossa tapahtuu kahdentumista
replikaatiohaarukka
replikaatiokuplan kohta, jossa DNA-kaksoisjuoste on avautumassa vetoketjun tavoin
-tumallisia replikaatiota voi tapahtua monessa kohtaa DNA:ta, joten voi olla samanaikaisesti monta replikaatiokuplaa
mistä suunnasta DNA juoste rakentuu
5’-3’ suunnassa
-uudet nukleotidit liittyvät liitetään vaan edellisen sokeriosan kolmanteen hiileen eli 3’ päähän eli juoste pitenee 3’-päästä
eli siis: 5’ päässä on fosfaatti osa jo kiinni, joten 3’ päähän (jossa OH-ryhmä), liitetään uusin nukleotidi
johtava juoste
yhtäjaksoisesti replikaation etenemissuuntaan muodostava juoste; rakentuu alukkeiden perään samaan suuntaan, mihin DNA-kaksoisjuoste aukeaa
laahaava juoste
rakennetaan avautumissuuntaan nähden vastakkaiseen suuntaan paloina, Okazakin fragmentteina, joista jokainen vaatii oman alukkeen
-lopuksi fragmentit liitetään yhteen ligaasientsyymin toimesta
telomeeri
kromosomien päissä olevat geenittömät (toistuvia emäsjärjestyksiä sisältäviä) alueet, jotka suojaavat solua tämän lyhenemisen aiheuttamilta haittavaikutuksilta (DNA:n replikaatiossa kromosomin päät (telomeerit) lyhenevät hieman, koska replikaatiossa DNA-polymeraasi voi kiinnittyä vain RNA-alukkeeseen ja replikaation päätyttyä alukkeet poistetaan mutta jäljelle jää alukkeen mittainen yksijuosteinen DNA-pätkä joka leikataan irti entsymaattisesti -> jakautumiskertojen myötä telomeerit lopulta loppuvat, mikä johtaa solun toiminnan muuttumiseen ja kuolemaan)
geeni
perinnöllisyyden perusyksikkö: DNA-jakso, joka sisältää RNA-molekyylin rakennusohjeen
=koodi, joka ohjaa solun toimintaa
geenin perusrakenne
säätelyalue (=säätelee geenin aktiivisuutta) ja koodaava alue (=sisältää tiedon proteiinin tai RNA-molekyylin rakentamiseksi)
tumallisen solun säätelyalueen rakenne
tehostajajaksot (voivat sijaita DNA-juosteessa kaukana säätelemästään geenistä, aktivoivat geenin luennan) ja promoottori (geenin koodaavan osan välittömässä läheisyydessä, geenin luennan/proteiinisynteesin aloituskohta)
tumallisen solun koodaavan alueen rakenne
eksonit (informaatiota sisältävät osat eli koodaavat osat) ja intronit (eivät sisällä informaatiota)
mitä eroa tumallisen ja tumattoman solun koodavassa ja säätelyalueessa?
tumattomilla yhtenäinen säätelyalue (promoottori+operaattori), eikä koodaavassa osassa ole introneita (PAITSI arkeoneilla!!!)
kodoni
emäskolmikko = geenin tietoyksikkö = kolmen emäksen muodostama ryhmä