På vilka sätt skiljer sig virus från cellulära organismer?
Virus har ingen metabolisk aktivitet, de har inte de system som krävs för tillväxt på egen hand. De har inte
- Proteinsyntesmaskineri
- Energiproduktionssystem
Detta innebär att de är i behov av en värdcell för reproduktion och spridning.
Vad är RNA-virus?
Virus vars genom är i form av enkel- eller dubbelsträngat RNA.
- Dessa virus har alltid genom som kodar för RNA-polymeras
- Genomet är mindre
- Låg fidelitet, mutationsbenäget –> större genetisk diversitet
- Måste replikera sitt eget genom (värdcellen kan ej replikera RNA)
- Har ej CAP (till skillnad från DNA-virus), men enzymet CAP-snatcher
Vad är DNA-virus?
Virus vars genom är i form av enkel- eller dubbelsträngat DNA.
- Stabil, latent molekyl
- Hög noggrannhet i DNA-replikationen (hög fidelitet)
- Replikeras med värdcellens DNA-polymeras
- Co-och posttranskriptionellt genuttryck
- Producerar egna CAPs
Hur kan det icke-adaptiva immunsystemet skydda från virusangrepp?
- Receptormutationer i cellens ytreceptorer hindrar virus från att binda till dessa
- Mutationer i ytproteiner (ofta kostsamt för cellen då detta ofta försämrar dess funktion, t.ex proteintransport)
- Maskering: produktion av polysackarider som hindrar att virus binder till receptorer
- Restriktionsendonukleaser: klyver modifierat DNA som kommer in i cellen, saxarna känner inte igen bakteriens egna DNA då detta ofta är skyddat med metylering av cytosinrester
Hur kan det adaptiva immunsystemet skydda från virusangrepp?
CRISPR- Cas9 (prokaryoter)
Vilka komponenter består ett virus av?
Genom (DNA eller RNA)
Protein - ofta tillsammans med genomet
Lipid (hölje)
Kolhydrater (hölje)
Vad innebär det för transkriptionen att ett virus har ett plussträng-virus (pluspolaritet)?
Innebär att virusets RNA direkt kan användas för translation, ingen syntes av en ny +-tråd måste ske.
Hur skiljer sig minussträng-virus från plussträng-virus?
Minussträngs-virus kodar för ett eget RNA-polymeras som kan kopiera RNA från RNA (syntas av plussträngsvirus). Plussträngsvirus kan direkt translateras till proteiner.
Vad är kapsidens funktioner?
- Packa och kondensera nukleinsyran
- Skydda nukleinsyran
- Transportera genomen från cell till cell
- Ytproteiner ger specificitet till vidhäftningen
Hur går virusinfektionscykeln till?
- Vidhäftning - Ytproteiner på virusets yta binder till receptorer på cellytan. Virus är både värd-och cellspecifika och har proteiner designade efter specifika celler.
- Penetration - virionen tar sig in i cellen på två sätt:
- virusets membran fuserar med cellmembranet och virusmembranet blir en del av cellmembranet
- Virionen tas in genom endocytos, bildas ett membran kring virionen som sedan släpper den fri - Ta sig till sätt ställe i cellen
RNA- kopierar sig i cytoplasman eftersom de har eget RNA-replikas, sedan sker transkriptionen och translationen i cytoplasman
DNA-virus använder sig av cellens DNA-pol i cellkärnan
Retrovirus genomgår omvänd transkription och integreras sedan i genomet - Avkapsling - genomet frigörs från kapsiden
- Replikation av genom
- Plussträngsvirus kan translateras direkt av cellens transkriptionsmaskineri. Alla RNA-virus har eget RNA-replikas för replikationen
- Minussträngvirus kodar för eget RNA-polymeras som kopierar RNA från RNA - Mognad
Polycistroniska mRNA producerar långa peptider som sedan klyvs till mindre komponenter i efterhand, detta är för att slippa cap-snatching flera gånger.
Kapsidproteiner bildar kapsyler och genomer börjar kondenseras och packas - Utsläpp/avknoppning
Beroende på virus kräver vissa att cellen lyserar, andra knoppas av från membranet och får med sig detta. Om avknoppningen sker snabbare än membranbiosyntes dör cellen. - Spridning från värd
Det är spridningen som orsakar sjukdomssymptom - Spridning till nya värdar
Beroende på vad som är bäst för viruset sprids det på olika sätt (t.ex könssjukdomar, respiratoriskt)
Hur är virus kopplat till cancer?
Ofta är det persistenta infektioner som på något sätt påverkar DNA-replikationen och cellcykeln. Det kallas för onkogen transformation - viruset omvandlar den infekterade cellen till en tumörcell.
Varför är det svårare att producera läkemedel mot virus än bakteriella infektioner?
På grund av att virus inte har några metaboliska processer (som antibiotika biter på), svårt att hämma virus.
Ge ett exempel på vilka steg i virusets livscykel man kan göra läkemedel mot?
Hämning av det enzym som klyver polycistroniska peptider- t.ex bromsmediciner för HIV
Enzym som katalyserar cap-snatching
