1
Q
Qu’est ce qu’un virus?
A
- agent qui peut être filtré
- un parasite intracellulaire obligatoire: dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication
- agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la cellule hôte
- fait d’un génome viral d’ADN ou d’ARN
- enveloppé ou non
- agent infectieux dont les composantes individuelles sont assemblées, donc qui ne se reproduit pas par division cellulaire
2
Q
Vrai ou faux: les virus sont vivants?
A
faux
3
Q
Nommez des faits sur les virus.
A
- les virus doivent infecter les cellules pour assurer leur survie
- les virus doivent être capables d’utiliser la machinerie cellulaire de l’hôte pour produire leurs propres composantes
- les virus doivent encoder tous les processus requis qui ne sont pas “fournis” par la cellule hôte
- composantes virales doivent s’assembler par elles-mêmes
4
Q
Comment est-ce que le virus peut infecter l’hôte?
A
le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hôte, une fois le virus entré, la cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer, une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule pour transmettre l’infection (et pouvoir ainsi assurer sa survie)
5
Q
Comment se mesure la taille des virus?
A
en nanomètres
6
Q
Quelle est la structure d’une particule virale?
A
génome d’acide nucléique compris dans une couche protectrice de protéines (capside)
génome + capside = nucléocapside (soit icosahédrique, hélicoïdale, complexe)
avec ou sans enveloppe
7
Q
Quel est le génome d’un virus?
A
soit ADN (simple ou double brin, linéaire ou circulaire) ou ARN (simple brin avec polarité positive comme ARNm ou négative, double brin avec polarité double sens, segmenté ou non)
8
Q
Quelles sont les fonctions de la capside et l’enveloppe?
A
structure, protection, véhicule de transmission, permettent l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une protéine d’attachement virale ou autre structure
si on détruit la couche externe d’un virus, on inactive le virus
9
Q
Qu’est ce que la capside d’un virus?
A
- faite de protéines
- structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
- virus non enveloppés sont généralement résistants à la sécheresse, à l’acidité, aux détergents (incluant l’acide et la bile du tractus digestif = détermine leur mode de transmission)
- capside est symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)
10
Q
Comment est formée la capside icosahédrique?
A
les sous-unités protéiques virales s’unissent en protomères –> 5 protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamères) qui s’assemblent en capside)
capside icosahédrique simple est formée de 12 capsomères, chacun des 12 capsomères (aux 12 sommets) interagit avec 5 autres capsomères (qui sont appelés pentamères ou pentons)
- tous les faces sont identiques
- acide nucléique est compris au centre de la capside qui le protège de l’environnement
- virions à plus grosses capside sont fabriqués en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons
11
Q
Comment est formée la capside hélicoïdale?
A
sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet ou cylindre protéiques creux, rigide ou flexible
12
Q
Qu’est ce que l’enveloppe d’un virus?
A
- membrane composée de lipides, de protéine et de glycoprotéines
- a une structure similaire aux membranes cellulaires
- glycoprotéines virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules (certaines agissent comme des protéines d’attachement virales capables de se lier à des cellules cibles, sont des antigènes majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice, autres fonctions possibles)
13
Q
Quelles sont les conséquences d’avoir une enveloppe?
A
- virus sont facilement inactivés par la sécheresse, les détergents et les solvants donc ne peuvent survivre dans le tractus GI
- structure de l’enveloppe peut être maintenue uniquement dans une solution aqueuse donc sont ces virus sont généralement transmis par les fluides tels que le sang, les gouttelettes respiratoires et les tissus
14
Q
Comment sont classifiés les virus?
A
selon la nature de leur génome (ADN ou ARN, simple brin ou double brin, polarité, segmenté ou non segmenté, linéaire ou circulaire) et leur structure (symétrie de la nucléocapside, enveloppé ou non enveloppé, nombre de capsomères, autres)
15
Q
Quelle est la terminaison pour l’ordre?
A
-virales (ex: monoegavirales pour virus des oreillons)
16
Q
Quelle est la terminaison pour la famille?
A
-viridae (ex: flaviviridae pour virus de l’hépatite C, paramyxoviridae pour virus des oreillons)
17
Q
Quelle est la terminaison pour la sous-famille?
A
-virinae (ex: para-myxovirinae pour virus des oreillons)
18
Q
Quelle est la terminaison pour le genre?
A
-virus (ex: hepacivirus pour le virus de l’hépatite C, rubulavirus pour virus des oreillons)
19
Q
Quelles sont les classifications pour les virus à ADN?
A
single stranded & non-enveloppe? parvoviridae
si non, envelopped? herpesviridae, hepadnaviridae, poxviridae
si non, linéaire? adénoviridae
si circulaire = papillomaviridae, polyomaviridae
20
Q
Quelles sont les classifications pour les virus à ARN?
A
si single stranded & positive sense, envelopped, icosahedral = flaviviridae, togaviridae, retroviridae
si single stranded & positive sense, envelopped, helical = coronaviridae
si single stranded, envelopped, helical = orthomyxociridae, paramyxoviridae, rhabdoviridae, filoviridae, bunyaviridae, arenaviridae
si double stranded, non-envelopped, icosahedral = reoviridae
21
Q
Qu’est-ce que la famille de virus poxviridae?
A
virus de la variole (virus à ADN)
22
Q
Qu’est ce que la famille de virus herpesviridae?
A
herpes simplex virus types 1 et 2 (virus à ADN)
23
Q
Qu’est ce que la famille de virus adenoviridae?
A
adenovirus (virus à ADN)
24
Q
Qu’est ce que la famille de virus hepadnaviridae?
A
virus de l’hépatite B (virus à ADN)
25
Qu'est ce que la famille de virus papillomaviridae?
virus du papillome humain (VPH) (virus à ADN)
26
Qu'est ce que la famille de virus polyomaviridae?
JC virus (virus à ADN)
27
Qu'est ce que la famille de virus parvoviridae?
parvovirus B19 (virus à ADN)
28
Qu'est ce que la famille de virus paramyxoviridae?
virus de la rougelole, virus des oreillons (ARN)
29
Qu'est ce que la famille de virus orthomyxoviridae?
influenza type A et B (ARN)
30
Qu'est ce que la famille de virus coronaviridae?
coronavirus, SRAS (ARN)
31
Qu'est ce que la famille de virus arenaviridae?
virus de la fièvre de Lassa (ARN)
32
Qu'est ce que la famille de virus rhabdoviridae?
virus de la rage (ARN)
33
Qu'est ce que la famille de virus filoviridae?
virus ebola (ARN)
34
Qu'est ce que la famille de virus bunyaviridae?
virus de l'encéphalite de Californie (ARN)
35
Qu'est ce que la famille de virus retroviridae?
VIH (ARN)
36
Qu'est ce que la famille de virus reoviridae?
rotavirus (ARN)
37
Qu'est ce que la famille de virus togaviridae?
virus de la rubéole (ARN)
38
Qu'est ce que la famille de virus flaviviridae?
virus de la fièvre jaune, virus de l'hépatite C, virus du Nil (ARN)
39
Qu'est ce que la famille de virus caliciviridae?
virus de Norwalk (ARN)
40
Qu'est ce que la famille e virus picornaviridae?
virus de la polio (ARN)
41
Quelles sont les généralités de la réplication virale?
- principales étapes de réplication sont les mêmes d'un virus à l'autre
- cellule hôte agit comme usine en fournissant les substrats, l'énergie et la machinerie nécessaires à la synthèse des protéines virales et à la réplication du génome
- ce qui n'est pas fourni par la cellule hôte doit être encodé dans le génome du virus
42
Quelles sont les étapes de la réplication virale?
1. reconnaissance de la cellule cible
2. attachement
3. entrée dans la cellule à travers la membrane plasmique
4. décapsidation
5. synthèse des constituants viraux (synthèse de l'ARNm précoce est des protéines non-structurales, réplication du génome, synthèse de l'ARNm tardif et des protéines structurales, modification post-traduction de la protéine)
6. assemblage du virus
7. bourgeonnement des virus enveloppés
8. relâchement du virus hors de la cellule hôte
43
Comment est-ce que le virus reconnait et s'attache à la cellule cible?
protéines d'attachement virales (PAV) ou d'autres structures à la surface du virus se lient à des récepteurs de la cellule hôte: les virus peuvent se lier à des récepteurs présents sur certaines cellules seulement (spécifiques au type de cellule), parfois présents chez certains hôtes seulement (spécifiques à l'hôte
les cellules susceptibles ciblées définissent le tropisme tissulaire (ex: virus de l'hépatite C est hépatotrope)
44
Quels sont les virus pneumotropes?
influenza, adénovirus, rhinovirus et virus respiratoire syncytial
45
Quels sont les virus dermotropes?
variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona
46
Quels sont les virus viscérotropes?
hépatite, fièvre jaune, gastro-entérite, VIH et mononucléose
47
Quels sont les virus neurotropes?
rage, encéphalite et polyomyélite
48
Nommez des protéines d'attachement virales (PAV).
- gp120 (glycoprotéine 120) du VIH
| - HA gp (hémagglutinine) du virus Influenza A
49
Nommez des récepteurs sur la cellule hôte.
- CD4 et co-récepteur chemoline sur les lymphocytes T "helper T-cell" pour le VIH
- acide sialique des cellules épithéliales pour Influenza A
- récepteur de la protéines C3d du complément (Epstein-Barr)
- alpha 2-macroglobuline (hépatite A)
- récepteur du facteur de croissance fibroblastique (virus HSV-1)
- molécule d'adhésion cellulaire neuronale, NCAM (poliovirus)
- récepteur de l'Ach des neurones (virus de la rage)
- ICAM-1 (rhinovirus)
50
Comment est-ce que les virus non enveloppés entrent dans la cellule?
principalement: endocytose médiée par un récepteur
51
Comment est-ce que les virus enveloppés entrent dans la cellule?
- fusion des membranes du virus et de la cellule cible (précédée ou non d'endocytose)
- nucléocapside ou le génome viral est ensuite relâché dans le cytoplasme
52
Comment se passe la décapsidation?
après internalisation, la nucléocapside doit arriver au site de réplication et se rompre
le génome d'ADN est habituellement transporté au noyau (exception: poxvirus), génome d'ARN reste habituellement dans le cytoplasme (exceptions: orthomyxovirus et retrovirus)
53
Quelles sont les étapes de la synthèse des constituants viraux?
1. transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines non-structurales (produits précoces)
2. réplication du génome
3. transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales (produits tardifs)
4. modification post-traduction de la protéine
54
Comment se fait la synthèse des constituants viraux?
– La machinerie cellulaire nécessaire pour la transcription de l’ARNm se trouve dans le noyau de la cellule
– La plupart des virus à ADN utilisent les polymérases de la cellule hôte pour synthétiser l’ARNm dans le noyau (exception: poxvirus)
– Les virus à ARN se répliquent dans le cytoplasme (exceptions orthomyxovirus et rétrovirus) et doivent eux-mêmes encoder les enzymes nécessaires à la transcription et à la réplication (la cellule hôte n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN)
55
Comment se passe l'assemblage et bourgeonnement du virus?
* site et mécanisme d’assemblage du virus dépend d’où la réplication a eu lieu et si la structure finale est celle d’un virus nu ou enveloppé (les virus à ADN sont assemblés dans le noyau sauf poxvirus, les virus à ARN et les poxvirus sont assemblés dans le cytoplasme)
* capsides virales peuvent être assemblées et ensuite remplies du génome ou peuvent être assemblées autour du génome
* L’enveloppe est acquise lors du bourgeonnement du viru (la ppt des virus à ARN bourgeonnent de la membrane plasmatique sans tuer la cellule, d’autres virus acquièrent leur enveloppe du réticulum endoplasmique et de l’appareil de Golgi)
* erreurs sont faites durant l’assemblage et résultent en la formation de virions vides ou contenant un génome défectueux
56
Comment est-ce que les virus sont relâchés hors de la cellule hôte?
par lyse cellulaire, exocytose, bourgeonnement à travers la membrane plasmatique
• Les virus nus sont souvent relâchés après lyse cellulaire et les virus enveloppés le sont souvent par bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer la cellule
• Les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme sont relâchés par exocytose ou lyse cellulaire
57
Quels sont les modes de transmission des virus?
– Aérosols
– Ingestion de nourriture et eau contaminées • fécale-orale
– Fomites
– Contact direct avec les sécrétions (salive, plaie) --> Gouttelettes
– Contact sexuel
– Sang contaminé ou transplantation d’organe
– Zoonoses (animaux, insectes)
– De la mère à l’enfant: transmission verticale
58
De quoi dépend le mode de transmission des virus?
de quelle est la source du virus et de la capacité du virus à endurer les conditions de l'environnement et du corps jusqu'à sa cellule cible
présence ou non d’une enveloppe est le principal déterminant structural du mode de transmission virale: virus non-enveloppés sont résistants à la sécheresse, les détergents, les extrêmes de température et de pH contrairement aux virus enveloppés (donc acidité de l'estomac et effet détergent des acides biliaires de l'intestin)
59
Comment sont transmis les virus non enveloppés?
par voie fécale-orale
source fréquente: objets contaminés (fomites) ex: virus de l'hépatite A (picornaviridae ARN + NE), adénovirus (adenoviridae ADN NE), calicivirus (caliciviridae ARN + NE), etc
60
Comment sont transmis les virus enveloppés?
virus enveloppés sont plus fragiles: ils ont besoin d’une enveloppe intacte pour rester infectieux et doivent rester mouillés
– Souvent transmis par gouttelettes respiratoires, mucus, salive et sperme, sang, organe transplanté
• Ex: VIH (retroviridae ARN+/E), virus de l’hépatite B (hepadnaviridae ADN/E), virus Influenza (orthomyxoviridae ARN-/E), etc.
61
Quel est le l'influence de la structure du virion sur les propriétés virales des virus non-enveloppés?
– La capside est faite de
protéines
– Plus stables aux conditions de l’environnement
– Peuvent être transmis plus facilement
• Fomites, main à main, poussières, petites gouttelettes
• Peuvent rester infectieux malgré la sécheresse
• Peuvent résister l’acide de l’estomac
62
Quel est le l'influence de la structure du virion sur les propriétés virales des virus enveloppés?
– La membranes est faite de lipides, protéines et gp
– Labiles face aux conditions environnementales
– Doivent rester mouillés
• Ne survivent pas au milieu
GI
• Transmis par grosses gouttelettes, sécrétions, tissus, sang contaminé
63
Qu'est ce que les zoonoses?
• animaux peuvent être des vecteurs: ils transmettent l’infection à d’autres animaux humains
• peuvent aussi agir comme réservoir: maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement
– Les maladies virales qui peuvent atteindre les animaux (ou les insectes) et les humains sont appelées zoonoses (ex: rage)
– Lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches..) sont le vecteur d’une infection virale, l’infection est une arbovirose (ex: flavivirus --> virus de la Dengue dont le vecteur est le moustique du genre Aedes)
64
Quelles sont d'autres sources associées à la transmission?
* Attention aux infections asymptomatiques qui peuvent contribuer à la transmission (ITSS)
* Conditions de vie: promiscuité
* Travail/loisirs
* Styles de vie (surtout en voyage)
* Fréquentation des garderies
* Voyages
65
Quels virus sont transmis par transmission respiratoire?
paramyxoviruses, influenza, picornavirus, parvovirus
66
Quels virus sont transmis par voie fécale-orale?
picornaviruses, rotavirus, noroviruses, adenovirus
67
Quels virus sont transmis par contact (lésions, fomites)?
herpes simplex virus, rhinoviruses, poxviruses, adenovirus
68
Quels virus sont transmis par zoonoses (animaux, insectes)?
togaviruses, flaviviruses, bunyaviruses, arenaviruses, hanta virus, virus de la rage, influenza A
69
Quels virus sont transmis par le sang?
VIH, HTLV-/, virus de l'hépatite B et C, hépatite delta, cytomegalovirus
70
Quels virus sont transmis par contact sexuel?
VIH, hépatite B et C, herpes simplex cirus, HPV, molluscum contagiosum
71
Quels virus sont transmis de façon verticale?
virus de la rubéole, CMV, parvo B19 virus, echovirus, HSV, VZV, VIH
72
Comment peut-on diagnostiquer des infections virales?
* Culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire (on peut observer l’apparition d’effets cytopathogènes caractéristiques, encore utilisé pour certains spécimens)
* Détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté: sérologie [sérum précoce, sérum tardif (phase aiguë ou latente) qui est très souvent utilisé
* Détection du matériel génétique viral (PCR) qui est de plus en plus utilisé
* Observation en microscopie électronique (en laboratoire de recherche)
73
Quels sont les moyens de contrôler des infections virales?
- vaccination (prévention): inactivés, vivants atténués, autres
- traitement antiviral (pour certains infections virales seulement)
74
Quelles sont les cibles thérapeutiques du traitement antiviral?
principalement les étapes du cycle de réplication virale
75
Quels sont les traitements antiviraux qui inhibent l'attachement du virus à la cellule?
• Anticorps neutralisants
– ex: immunisation passive de l’hépatite B (immunoglobulines)
• Antagonistes de récepteurs spécifiques
– Analogues des récepteurs cellulaires ou de la PAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la cellule
» ex: inhibiteurs du récepteur cellulaire CCR5 qui empêchent le VIH de se lier aux macrophages et certaines cellules CD4
76
Quels sont les traitements antiviraux qui inhibent l'entrée dans la cellule et inhibent la décapsidation?
Si ce processus est bloqué, le génome du virus ne peut pas être relâché dans la cellule pour se répliquer
• Pour les virus qui entrent pas des vésicules endocytiques, certains antiviraux vont neutraliser le pH de ces compartiments pour empêcher la fusion ou le bris de la membrane empêchant la décapsidation
– Amantadine et rimantadine
» Action plus spécifique contre l’Influenza A
– Enfuvirtide qui bloque l’entrée et la décapsidation du VIH en inhibant la protéine de fusion gp41
L’ARNm n’est pas une bonne cible puisqu’il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber l’ARNm de la cellule hôte
77
Quels sont les traitements antiviraux qui inhibent la réplication du génome?
La plupart des antiviraux sont des analogues des nucléosides (nucléosides modifiés)
• L’ADN polymérase virale du HSV et la transcriptase inverse du VIH sont de bons exemples
– Cibles thérapeutiques idéales puisqu’elles sont essentielles à la réplication virale et elles sont différentes des enzymes de l’hôte
• analogues nucléosidiques se lient facilement à la polymérase virale (qui est moins précise que les enzymes de l’hôte) et inhibent la réplication virale le plus souvent par arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN ou d’ARN
– ex: acyclovir et valacyclovir contre le HSV, ganciclovir contre le CMV, lamivudine et zidovudine contre le VIH
78
Quels sont les traitements antiviraux qui inhibent l'assemblage du virus et le relâchement hors de la cellule?
On veut inhiber des enzymes responsables de ces étapes
• Inhibiteurs de la protéase du VIH, enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux
– ex: darunavir et ritonavir
• Inhibiteurs de la neuraminidase de l’Influenza A et B (la neuraminidase permet au virus d’être libéré hors de la cellule)
– ex: oseltamivir et zanamivir
SF3 examen 2
flashcards
Decks in class (12)
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