Microbiologie générale > Chapitre 3 > Flashcards

Chapitre 3 Flashcards

(68 cards)

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1
Q

Comment est définie la croissance?

A

Croissance est définie par l’accroissement du nombre de cellules ou masse cellulaire

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Q

Comment se poursuit la croissance de la plupart des procaryote?

A

Par fission binaire (scissiparité) : division en 2 nouvelles cellules identiques à la mère

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3
Q

Comment représentons la croissance d’une population bactérienne en milieu liquide?

A

Dans un système fermé (discontinue) : Courbe de croissance de log10 de la concentration bactérienne (bact/ml) par rapport au temps (heures). Formé de 4 phases :

  1. Latence
  2. Exponentielle (phase optimale)
  3. Stationnaire
  4. Mortalité
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4
Q

Quest ce que la phase de latence? Durée varie en fct de quoi?

A

Phase adaptation (pas actif) ou il n’y a pas de division cellulaire. La durée de la phase varie en fonction de l’age des bactéries et leur origine (composition et T)

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5
Q

Quest ce que la phase exponentielle (log)?

A
  • Acceleration de croissance et division cellulaire
  • Microorganismes se développent/divisent à vitesse maximale
  • Population uniforme (propriétés chimiques/physiologique)
  • Courte durée
  • Relation entre concentration nutriments et croissance
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6
Q

Quest ce que la phase stationnaire?

A

Nombre totale de microorganismes viables est constant, donc équilibre entre division et mort cellulaire (10^9cellule/ml) : semble inactif, mais est plutot un équilibre. Causes : limitations nutriments et accumulation conditions défavorables (déchets, acidités)

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7
Q

Quest ce que la phase de mortalité?

A

Arrêt de la division cellulaire = diminution nombre de bactérie viable de façon constante en fonction du temps. Causes :

  • dégats irréparables = perte de viabilité
  • réponse génétique déclenché (mort programmé)
  • formation cellules viables non cultivable (VNC = dormance = pas division)
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8
Q

Quel est la différence entre la culture continue comparativement à la discontinue?

A

Continue = ouvert

  • permet de garder bon apport nutriment
  • éliminer bien les déchets
  • phase de croissance exponentielle plus longue
  • concentration constante de la biomasse
    • chémostat : aaport constant de nutriment à la mm vitesse que le milieu est éliminé (dillution constante)
    • turbidostat : vitesse de dillution déterminé par densité
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9
Q

Quels sont les 2 méthodes directes pour dénombrer le nombre de microorganismes?

A
  1. décompte total des colonies selon la taille
    • compteur Coulter et Cytomètre de flux (protiste, levure, mammifères) (grosse cellule)
    • Hémocytomètre (levure et cellule mammifère) et cellule Petroff-Hausser (bactéries) = chambre de compactage au microscope
  2. décompte des unités viables (qui peuvent se reproduire)
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10
Q

Quels sont les avantages et désavantages de la chambre de compactage au microscope?

A

Avantage :

  • facile à utiliser
  • peu couteux
  • donne info sur taille et morphologie du microorganisme

Désavantage :

  • densité microbienne élevé (petit volume) : besoin concentration minimale ds solution
  • décompte cellule morte = rouge / vivante = vert (comme Live/Dead BacLight bacterial viability)
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11
Q

Comment fonctionne un hémocytomètre? Dimension?

A
  • Dimension : 0,1 X 0,1 X 0,01 = 1/10 000 cm^3
  • # cellules par ml = 1000 X # cellules X facteur dillution
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12
Q

Comment est composé une cellule de Petroff-Hausser?

A
  • Dimension : 10 fois plus petit que hémocytomètre (1/100 000 cm^3)
  • Cellule / ml = 100 000 X # cellules X facteur dillution
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13
Q

Quelles méthodes sont utilisées pour faire le décompte des unités viables?

Formule?

A
  • Dillution liquide et étalement sur gélose
  • Filtre de cellulose dont la porosité retient microorganismes (0,45um)

colonies X facteur dillution

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14
Q

Quels sont les avantages et désavantages de la méthode de décompte d’unité viables?

A

Avantage : colonies proviennent cellules de cellules vivantes capable de se reproduire : permet de connaitre la concentration initiale de bactéries

Désavantage : amas de cellule représente 1 colonie = forme des UFC (unités formant des colonies)

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15
Q

Après dilution successives et étalement sur gélose, quel est le nombre de colonies idéales pour faire un bon décompte?

A

Entre 30 et 300 colonies

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16
Q

Quels sont les méthodes indirectes pour faire le comptage de la croissance des microorganismes?

A
  • mesure de l’activité : mesure de
    • consommation de substrat (C, N2, O2)
    • concentration de constituant (ATP/FAD ou FMN/ADN)
    • sécrétion de produit (CO2 ou NH3)
  • mesure de la masse cellulaire :
    • poid sec (g/L) :
      • récolte par filtration membrane
      • lavage + dessination (100à110C)
      • pesée (toute bactéries morte/vivantes)
    • turbidité par densité optique (OD) : turbidimétrie
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17
Q

Quest ce que la turbidimétrie?

A

Évaluation de la concentration cellulaire par denisté optique (DO) = absorption lumineuse à une certaine longueur d’onde. Entre 10^6/ml et 10^8/ml, la DO est directement proportionnelle à sa concentration cellulaire.

En bref, + turbide = + dense = - capable passer au travers

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18
Q

Quelles sont les différentes expressions mathématiques de la croissance bactérienne?

A
  1. Temps de génération / dédoublement (g)
  2. Taux de croissance (k)
  3. Nombre de génération?
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19
Q

Quest ce que le temps de dédoublement?

A

Intervalle de temps entre 2 divisions successives en min. (Ex. E coli = 20 min)

  • g = t/n ou
    • t = temps
    • n = nombre génération
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20
Q

Quel est la formule du taux de croissance? Qu’est ce que le taux de croissance?

A

C’est le nombre de génération par unité de temps : inverse du temps de génération. (Ex. E coli 3/h)

k = n/t

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21
Q

Qu’est ce que le nombre de génération?

A

Permet de trouver le temps

n = (LogNt - LogN0) / Log2

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22
Q

Quels sont les macroéléments et ou sont-ils présents?

A

C, H, N, O : molécule organique

Glucide, lipide, protéine, acide nucléique

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23
Q

Quels sont les ions qui font partis des macroéléments?

A

Na, K, Mg, Ca, Cl, Fe : ions

Cofacteur enzyme

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24
Q

QUels éléments sont sous la forme de traces?

A

Microéléments (oligoéléments), donc besoin particulier:

Mn, Co, Cu, Zn

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25
De quoi sont formé les: * protéine * lipide * glucide * acide nucléique
26
Quest ce que des nutriments?
Substance qui est utilisé pour la biosynthèse / conversion de l'E pour la croissance bactérienne
27
Quels sont les 10 nutriments essentiels pour la croissance microbienne?
C HOPK'NS = macromolécule en grande quantité * C : source carbone * H et O : eau = indispensable * pH : sensible au H+ * O2 : indispensable à toxique * facteurs de croissance : acide aminés, vitamine, base azotés * ' : Fe, Ca, Mg
28
COmment classe t-on les microorganismes?
Selon leur besoin nutritif : * Source de carbone * Source d'E * Source d'electron
29
Comment appelle t-on les 2 types de microorganismes selon une source d'énergie?
* phototrophe : lumière * chimiotrophe : oxydation de composés organique (glucose) et inorganique (H2S, Fe)
30
Comment appelle t-on les 2 types de microorganismes selon une source d'électron?
* litotrophe : molécule inorganique réduite (H2S, Fe) * organotrophe : molécule organique réduite (glucose)
31
Comment appelle t-on les 2 types de microorganismes selon une source de carbone?
* autotrophe : CO2 est seul/principale source, ils peuvent le dégrader eux mm avec leur enzyme * hétérotrophe : molécule organique préformé (glucide, lipide)
32
Comment appelle t-on un composé qui oxyde des composé organique? Et chez les composés inorganique?
Chimioorganotrophie Chimiolithotrophie
33
Quels sont les 5 différents types nutritionnels?
* photolithoautotrophe * photo-organohétérotrophe * chimiolithoautotrophe * chimiolithohétérotrophe * chimio-organohétérotrophe (**_majorité bactéries_**)
34
Source de Carbone. 2 types?
Unité de base structure organique * carbone inorganique = autotrophe : les chimio/photoautotrophe peuvent utiliser CO2 comme seule source pour créer des macromolécule * carbone organique = hétérotrophe : substance hydrocarburé (glucide, lipide) qui peuvent être presque tous dégradés (si aucun chimiohétérotrophe peut dégrader, on l'appelle non bio-dégradable)
35
Source d'azote. 2 types?
* forme inorganique : * athmosphérique (N2) : fixation de l'azote par nitrogénase chez certaines bactéries * amoniaque (NH3) : oxydation de l'ammoniaque en nitrite (nitrosation) * nitrite (NO2) : oxydation nitrite en nitrate(NO3) (nitration) * sels amonium (NH4+) : plusieurs espèces - E coli * forme organique (majorité des microorganismes) : * composé azote : acide aminé, base azotés, etc.
36
Source de phosphore. Expliquer.
Absorbé sous forme inorganique (PO42-), il est essentiel à la formation d'acide nucléique, phospholipide, coenzyme et ATP
37
Source de soufre. Expliquer
Absorbé sous forme de sulftate (SO42-) ou composé soufré organique (cystéine), il composent les acides aminés (cystéine et méthionine)
38
Source d'ions inorganique. Expliquer.
Na, K, Mg, Fe, Ca, Co, Cu, Mn, Zn (2+) Essentielle pour l'équilibre physiocochimique de la cellule (constituants des enzyme, structure, cofacteur)
39
Facteur de croissance. 3 types. Auxotrophe Vs prototrophe
Composé organique essentiel, qui ne sont pas synthéttisé par la bactérie * acide aminé * vitamines * base azoté - prototrophe : type sauvage (a tout enzyme pour dégrader, donc croit sur milieu minimal) - auxotrophe : perte de capacité de syntétiser, incapable de croitre sur milieu minimal (besoin de supplément)
40
Source d'eau. Expliquer.
Principal constituant des cellules et indispensable comme solvant dans les réactions chimiques. Seul l'**eau libre** du milieu est disponible pour les microorganisme (et il en faut bcp pour leur croissance).
41
Quels sont les 2 états de l'eau? Avec quoi est-elle mesuré?
* eau liée : lié au macromolécule/ion/surface hydrophile * eau libre : suffisament éloigné des surface chargées (propriétés physico-chimique normale). Indispensable pour une réaction * mesuré avec Aw (activity water) = pression partielle vapeur eau de solution / pression partielle vapeur eau pure * plus le Aw diminue, moins il y a d'eau, plus il y a de sel, donc pas de croissance bactérienne = conservation
42
Chez les procaryote, l'oxygène est-elle nécéssaire? Et eucaryote6
Procaryote : nécéssaire, toléré ou toxique Eucaryote : presque toujours essentielle (certaines levure croit sans = fermentation)
43
5 groupes de bactéries qui ont une réponse différentes à l'oxygène.
1. Aérobie stricts 2. Microaérophiles 3. Anaéoribie stricts 4. Anaérobie facultative 5. Anaérobie aérotolérants
44
Aérobie strict : expliquer.
Exigent obligatoirement l'oxygène libre qui sera utilisé comme accepteur final d'électrons dans la chaine respiratoire. Atmosphère = 21% O2 Ex. Plupart des pseudomomas
45
Microaérophile : expliquer
Ne se développent qu'avec un faible % de pression d'oxygène libre (2-10%)
46
Anaérobie strict : expliquer.
Absence totale d'O2, donc utilisent d'autre substance oxydatrice comme nitrate, sulfate ou carbonate comme accepteur final électron = respiration anaérobiose.
47
Si un accepteur final d'électron est un composé organique, on parle alors de quoi?
Fermentation (dégradation incomplète du glucose) : anaérobie strict
48
Anaérobie facultatif: expliquer.
Croit en présence (respiration = aérobie) ou absence totale (fermentation = anaérobie) d'oxygène libre. Cest le cas de la grande majorité des espèces bactériennes.
49
Anaérobie aérotolérants : expliquer.
Bactéries anaérobique, mais la présence d'oxygène ne les tue pas (tolérant). En présence, leur croissance est donc plus faible que anaérobie facultatif, car elles n'utilisent pas l'oxygène.
50
Même s'il est souvent vital, pourquoi l'oxygène peut parfois être toxique?
La réduction de l'oxygèmne (gain électrons) produit des radicaux libres. * O2 + e = O2- : anion superoxyde * O2- + e + 2H = H2O2 : peroxyde d'hydrogène * H2O2 + e + H = H20 + OH : radical hydroxyle * OH + e + H = H20 : eau Processus accélérer grace à 2 enzymes : 1. Superoxyde dismutase (SOD) : dismutation * 2 O2 + 2H = H2O2 + O2 2. Catalase (transformer peroxyde en eau et oxygène) * 2 H2O2 = 2 H20 + O2
51
Pourquoi survit t-on malgré la production de radicaux libre dans notre corps?
Car nous avons les enzymes pour dégrader ces toxines
52
Quelles techniques emploient-on pour faire croitre les bactéries anaérobie?
* bouillion au thioglycolate * jarre anaérobie (GasPak) * tube de hall * chambre de travail anaérobie
53
De quoi est consitutué un jarre anaérobie? Mécanisme?
* enveloppe génératrice de gaz (l'eau est ajoutée pour générer H2 et Co2) * couvercle étanche * papier indicateur d'anaérobiose (bleu de méthylène devient incolore en absence O2) L'oxygène est éliminé en se combinant à l,hydrogène pour former de l'eau (réaction catalysé par _palladium_)
54
Identifier les différentes bactéries selon leur besoin en oxygène. QUelle est cette technique?
Bouillon nutritif au thioglycolate * a : aérobie strict * b : anaérobie strict * c : anaérobie facultative * d : microaérophile * e : anaérobie aérotolérant
55
Quels facteur physiques influencent la croissance des microorganismes?
* Température * pH (acidité) * Pression osmotique
56
3 types de température. Quest ce que change la température sur une réaction?
Elle affecte direment les réaction enzygmatique (métabolisme) des microorganismes. * T minimale : la plus basse a laquelle il peut croitre * T optimale : idéal pour une croissance maximal * T maximal : la plus élevé a laquelle il peut croitre
57
Chez l'humain, les bactéries poussent le mieux à quel température?
37C, donc mésophile
58
5 classes de microorganismes selon leur _température optimale_ de croissance.
* psychrophile : sous 10 * psychrotrophe : 20-30C * mésophile : 20-45C * thermophile : 55-65C * hyperthermophile : 80-133C
59
À quel température se font : * réfrigiration * pasteurisation
* réfrigiration : 4C * pasteurisation : 66-71C * corps humain : 37C
60
Quel effet a le pH sur les enzymes dans une réaction?
En milieu acide ou alcalin (basique), les enzymes sont inactivés
61
3 types de pH.
* pH minimal * pH optimal (idéale = croissance maximale) * pH maximal
62
Quels sont les 3 types de microorganismes selon le pH? Les bactéries préferent quel milieu? Mycète?
* acidophile : 0 à 5.5 * neutrophile : 5.5 à 8 * alcanophile : 8 à 11,5 Bactérie : pH 6-7 Mycète : pH 5-6
63
Qu,arrive t-il au pH après la croissance microbienne?
Il diminue, car l'acidité augmente
64
Prendre conaissance
65
Quest ce que la pression osmotique?
Pression appliqué sur une membrane plasmique à permabilité sélective (eau se déplace du - au + concentré). La paroi résiste à cette pression.
66
3 situation de pression osmotiques?
1. Hypotonique : plus de soluté à l'intérieur donc l'eau se dirige vers l'intérieur. Paroi oppose une résistance 2. Hypertonique : eau quitte la cellule (désydratation) * plasmolyse = membrane se rétracte de la paroi * faible disponibilité en eau libre 3. Isotonique : équilibre
67
3 différents types de microorganismes selon pression osmotiques?
* Osmotolérants : tolère pression élevé * champignon * Staphyloccocus (tolère 5-20% NaCl) * Osmophile : nécéssitent pression élevé = milieu hypertonique * Halophile : nécéssite concentration NaCl \> 0,2M * Pseudomonas (3,5% NaCl) * Halobacterium, bactérie des saumure (20-30% NaCl)
68
Quest ce que des composés osmocompatible ou osmorégulateur?
Glycine, bétaine, glycérol Permet d'ajuster activité de l'eau du cytoplasme sans nuire au réactions biochimiques des cellules
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