Code Génétique et Traduction Flashcards by Virgil Baret

1954

George GAMOW dit que pour coder 20 aa a partir de 4 bases il faut des séquences de 3 minimum (64)

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1961

CRICK et BRENNER expérimentent et concluent que :
-Le code est constitué de séquences de 3 nucléotides successives et non chevauchantes
-Ces séquences sont spécifiques mais redondantes car 64 codes possibles

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1955

CRICK propose l’hypothèse d’un adaptateur ADN protéine qui est prouver par ZAMECNIK et HOAGLAND qui mettent en évidence l’ARNt

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1964

NIRENBERG et LEDER déchiffrent quasiment l’ensemble du code génétique où chaque codon code pour un aa mais redondance tous les 12 nucléotides

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Codons STOP

UAG
UAA
UGA

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Codon initiateur

AUG

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1955-1975

L’intermédiaire de passage de l’ADN à la protéine est l’ARNt

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1965

Robert HOLLEY séquences le premier ARNt et décrit ça structure en trèfle
-Mais certains appareillement dont différents G-U
-Des bases modifié post-transcriptionnellement

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

1975

ARNt a une séquence anticodon

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Nom réel de l’ARNt et de sont enzyme de couplage

ARNt = aminoacyl-ARNt
Enzyme de couplage = aminoacyl-ARNt-synthétases
20 ARNt existant

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Les deux étapes du couplage de l’ARNt

1* : Reconnaissance et activation de l’AA par aminoacyl-ARNt-synthétase qui consomme un ATP, hydrolysée pour donner AMP lier à l’aa
2* : ARNt arrive avec son anticodon et se lie à l’enzyme. GRANDE SPÉCIFICITÉ POUR LES DEUX DERNIERS ACIDES NUCLÉIQUES DE L’ANTICODON. Position 2 et 3 pour supporter la dégénérescence du code

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Construction du Ribosome

Une petite et une grande SU
Chez procaryotes : 70S
Chez eucaryotes : 80S
C’est une enzyme, la ribozyme avec
-Activité de la grande SU: peptidyl-transférase
-Activité de la petite SU : Décodage, interaction; positionnement et déplacement ARNm
Site A : liaison aminoacyl-ARNt
Site P : liaison du peptidyl-ARNt
Site E : exclusion ARNt
Mise en place de l’ARNt dans le ribosome + mise en place ARNm

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Généralités sur la Traduction

Expérience de Howard DINTZIS montre que la synthèse se fait au niveau du ribosome de N-term vers le C-term

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Les 3 étapes de la Traduction

1* Initiation
2* Élongation
3* Terminaison

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Initiation de la traduction chez les PROCARYOTES

On a en N-term une méthionine-N-formylée (AUG) et une séquence consensus de Shine-Dalgarno
3 étapes pour cette initiation :
1* Les deux SU sont séparer par facteurs d’Initiation, IF1 et IF3 qui se lient à la petite SU
2* petite SU fixe l’ARN avec la séquence de Shine-Dalgarno, en parallèle ,l’aminoacyl-ARNt (obtenue par couplage) se fixe à IF2 sous forme GTP
3* Grande SU revient par libération d’IF3 et hydrolyse de GTP en GDP par IF2 qui libère IF2 et IF1. L’élongation va commencer
» le Site P contient l’ARNt (AUG)
» le Site A est vide

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Initiation de la traduction chez les EUCARYOTES

Study These Flashcards

Pas de séquences de Shine-Dalgarno mais plus de facteurs d’Initiaion
1* Dissociation: eIF1 ; eIF3 et eIF1A se fixe sur la petite SU. Site de reconnaissance pour l’ARNt initiateur qui se lie par eIF2 (GTPase) et eIF5 = complexe de pré-initiation
2* ARNm arrive avec la CAP en 5’ et CBC qui permet de fixer eIF4 sur la petite SU
3* Balayage: Recherche AUG, une fois trouver et lier à l’anticodon de l’ARNt, le système s’arrête. Hydrolyse de GTP par eIF2 puis libération de tous les eIF retour de la grande SU avec site P contient l’ARNt (AUG) et site A vide comme chez les procaryotes

Quelles sont les facteurs d’initiations et quelles sont leurs rôles chez les PROCARYOTES ?

Study These Flashcards

IF1 et IF3 : fixation séquence de Shine-Delgarno sur petite SU
IF2 : GTPase qui est fixée sur l’aminoacyl-ARNt et qui se libérera elle et IF1 dans la troisième étape

Quelles sont les facteurs d’initiations et quelles sont leurs rôles chez les EUCARYOTES ?

Study These Flashcards

eIF1; eIF3; eIF1A: positionnes sur petite SU
eIF5: aide aussi le site de reconnaissance à se fixer
eIF2: GTPase qui aide le site de reconnaissance à ce fixer et hydrolyse GTP pour libérer tous les facteurs
eIF4: qui se fixe sur la petite SU grâce à CBC

Quelles sont les facteurs d’initiations et quelles sont leurs rôles chez les EUCARYOTES ?

Study These Flashcards

Quelles sont les facteurs d’élongations et quelles sont leurs rôles chez les PROCARYOTES ?

Study These Flashcards

EF-Tu et EF-G sont des GTPases :
-Fixation GDP = Inactive
-Fixation GTP = Active

Quelles sont les facteurs d’élongations et quelles sont leurs rôles chez les EUCARYOTES ? (ÉLONGATION)

Study These Flashcards

eEF-1-a et eEF-2 GTPases comme les Procaryotes

Quelles sont les facteurs d’échanges et quelles sont leurs rôles ? (ÉLONGATION)

Study These Flashcards

GEF : GDP en GTP par ÉCHANGE (pas de conso d’énergie) favorise l’activation
GAP : favorise l’activité GTPasique en aidant à HYDROLYSER GTP en GDP favorise l’inactivation

Quelles sont les 3 étapes + la préalable lors de l’ELONGATION

Study These Flashcards

Préalable : mise en place Complexe AA-ARNt avec EF-Tu liée au GTP
1* Liaison: AA-ARNt / EF-Tu dans le site A ; Reconnaissance codon/anticodon ; hydrolyse GTP + libération EF-Tu
2* Transpeptidation: Dernier AA du peptide du site P de lie à l’AA de l’ARNt du site A ; sans énergie ; facilité par ARNr
3* Translocation: GTPase EF-G hydrolyse GTP et décale le peptidyl-ARNt du site A au site P. ARNt désacétylé libéré au site E
-on a avancé d’un codon

Quelles sont les facteurs de Terminaison chez les PROCARYOTES ET les EUCARYOTES ?

Study These Flashcards

PROCARYOTES = RF-1; RF-2 et RF-3
EUCARYOTES = eRF (rempli tous les rôles)

Quelles sont les trois étapes de la Terminaison ?

1* Reconnaissance Codon STOP : - RF-1 reconnaît UAA et UAG - RF-2 reconnaît UAA et UGA - Installation d’un des deux dans le site A = arrêt système + RF-3 se positionne sous forme GTP 2* Libération du Polypeptide: -Hydrolyse GTP libère le polypeptide RF-1/RF-2 et RF-3 GTP sont dans le Site A = Ribosome Activité Hydrolase 3* Inactivation du ribosome: -ARNt désacylé libéré -Hydrolyse RF-3, libération RF-1/RF-2 -ARNm libéré et Ribosome devient inactif

Quelle est le bilan énergétique de la traduction ?

-Chargement AA : -1 ATP -ARNt dans le site A : -1GTP - Translication site A/P : -1 GTP -Initiation : -1GTP -Terminaison : -1GTP -IF-4 chez les eucaryotes : Plusieurs ATP en moins

Qu’est ce qu’un Polyribosome ?

Multiples ribosomes qui traduisent simultanément un ARNm

Qu’est ce qu’un cadre de lecture POSSIBLE ?

Combinaison de lectures possible sur le brin d’ADN = 6

Qu’est ce qu’un cadre de lecture OUVERT ?

Une seule possibilité qui sera transformé en protéine /!\ que sur l’ARN /!\ Séquence débute par AUG - une séquence d’ADN peut donner différents ARNm qui eux mêmes donnent différentes protéines

Qu’elle est le problème avec la B-thalassemie ?

Son codon 39 perd une cystosine se qui modifie le CAG qui normalement donne de la glutamine en AGA qui donne de l’arginine se qui entraîne une fixation moindre d’oxygène et des globules rouges falciformes.

Qu’elle est l’action du Chloramphénicol ?

Inhibe la grosse SU du ribosome procaryote en inhibant sont activité peptidyl transférase

Qu’elle est l’action du Macrolide ?

Bloque la Translocation sur la grosse SU procaryote

Qu’elle est l’action du Tétracycline ?

Empêche la liaison de l’ARNt sur la petite SU procaryote

Qu’elle est l’action du Cycolheximide ?

Inhibe la grande SU chez les Eucaryotes et agit en tant qu’anticancéreux

Qu’elles sont les modifications post-traditionnels ?

1* Repliement de la chaîne : donne une forme et génère les éléments qui vont permettre la fonction de la protéine 2* Les coupures protéolytiques : -élimination de l’extrémité N-term = deuxième AA maintenant premier -élimination des séquences particulières -Coupure et réassemblage par pont S-S ex: Insuline

Que se passera-t-il avec l’Insuline ?

1) perte Peptide signal en N-term = preproinsuline dans RE 2) Clivage pour donner Proibsuline 3) Séparation proinsuline en A ; B et C 4) C est éliminer et assemblage A et B par S-S 5) Réassemblage final

Sur quoi peut on et ne peut on pas faire de phosphorylations ?

On ne peut pas sur l’Arginine mais on peut sur les serines ; les threonines ; les tyrosines et parfois les histidines

Qu’elle rôles peuvent avoir les lipides sur la membrane ?

Ils peuvent mieux interagir et mieux s’y insérer

Qu’elles exemples de fonctions acquises suite à une modification post-traditionnel sont cités ?

-Régulation de l’activité -Localisation -Interactions -Propriétés physiques -Durée de vie

Code Génétique et Traduction Flashcards

(39 cards)