Fonctions membrane plasmique
- Compartimentation.
- Support pour les activités biochimiques (enzymes peuvent s’organiser pour interagir efficacement).
- Barrière à perméabilité sélective.
- Transport des solutés (avec protéines membranaires).
- Réponse aux stimuli externe (grâce à récepteurs membranaires).
- Interaction entre les cellules (médiation et reconnaissance).
- Transduction d’énergie
(transformation et emmagasinage de l’énergie)
Composition membranes (quel sorte de molécules)
Molécules lipidiques:
* phospholipides (ex.: phosphoglycérides)
* Sphingolipides
* cholestérol
Glucides (glycolipides)
Protéines membranaires:
* intrinsèques
* périphériques
* ancrées aux lipides
Composition asymétrique pour donner différents rôles selon lieux, etc.
Bicouches lipidiques forment quoi et peuvent peuvent fusionner grâce à quoi?
- Forment membranes plasmiques.
- Peuvent fusionner grâces à protéines.
Phosphoglycérides (c’est quoi, types)
QUOI : Lipides comportant un groupement phosphate lié à une base de glycérol (liens esters)
TYPES :
* Phosphadityl-choline (courbure du feuillet externe).
- Phosphadityl-éthanolamine (courbure du feuillet interne).
- Phosphadityl-sérine (signalisation apoptose lorsque flippée et fixation de résidus chargés).
- Phosphadityl-inositol (signalisation intracellulaire).
Effets cholesterol sur membranes
- Interfère avec la mobilité et l’empaquetage des phospholipides.
- Augmente la durabilité des membranes en diminuant leur perméabilité.
Ce qui modifie fluidité membranaire
- Insaturation des lipides (croche).
- La longueur des acides gras.
- Le cholestérol.
- La température (agitation moléculaire).
Mosaique fluide : déplacement des phosphoglycérolipides. On préfère mouvement slatéraux aux flips de chaques cotés.
Acides aminés (types, ceux qui sont polaires, hydrophobes, etc)
Polaires chargées (interaction avec eau) : acide aspartique, acide glutamique, lysine, arginine, histidine.
Polaires non-chargés : serine, threonine, glutamine, aspargine, tyrosine.
Hyrdophobes : tryptophan, phenylalanine, methionine, isoleucine, leucine, valine, alanine.
Autres : glycine (acide aminé le plus simple), cysteine, proline.
Structure primaire d’un acide aminé?
Liens peptidiques (composés d’atomes de carbone, d’oxygène, d’azote et d’hydrogène)
Structure secondaire d’un acide aminé?
Les hélices alpha et les feuillets beta (sorte de «plancher»)
** Ces structures sont formés principalement par des ponts hydrogènes.
Structure tertiaire d’un acide aminé?
Hélices alpha et feuillets beta interagissent entre elles pour former la forme tridimensionnelle de la protéine.
Structure quaternaire d’un acide aminé?
Plusieurs protéines ensemblent.
Types protéines dans membranes
1 - Protéines intrinsèques:
*Passent à travers les deux couches de lipides.
*25-30 % des protéines et 60 % des cibles thérapeutiques.
2 - Protéines périphériques:
*Reliées à la membrane par de faibles liens facilement solubilisables.
*Situées en dehors de la bicouche lipidique du côté cytoplasmique ou extracellulaire.
*Associées à la membrane par des liens non-covalents.
3 - Protéines ancrées par des lipides:
*Les protéines ancrées par des ancres GPI (glycosyl- phosphatidylinositol à la membrane externe peuvent être relâchées par des lipases phospho-spécifiques.
*Certaines protéines de la membrane interne sont attachées à de longues chaînes d’hydrocarbones.
Profil d’hydrophobicité
Domaine membranaire ont une conformation en hélice α (alpha). Les acides aminés de ces hélices ont une très forte tendance à être hydrophobes. Résidus acides aminés de la protéine permet de trouver profil.
Définition osmose
Déplacement de l’eau vers les régions concentrées en solutés.
Transport des susbtances dans membranes
1 - Diffusion (et diffusion facilitée) :
- Diffusion = mouvement passif des molécules à travers une membrane sans aide, vers concentration basse.
- Diffusion facilitée = implique des protéines spécifiques qui aident les molécules à traverser la membrane. Nécessite un pore, un canal ou un transporteur (canaux voltage-dépendants, ligand-dépendants ou mécanodépendants).
2 - Osmose : Déplacement de l’eau vers les régions concentrées en solutés.
3 - Transport actif (primaire et secondaire) :
- Transport de molécules contre leur gradient de concentration demandant un apport en énergie.
- Transport actif primaire : pompes ATPase.
- Transport actif secondaire : avec symporteurs et antiporteurs.
Molécules pouvant librement traverser la membrane ?
Molécules hydrophobes (lipides, gaz)
Molécules nécessitant des transporteurs/canaux/pore ?
Molécules hydrophiles (eau, acides aminés, glucose, ions, etc)
Types de canaux ioniques ?
- Voltage-dépendant
- Chimio-dépendant
- Mécano-dépendant
Étapes fonctionnement de la pompe ATPase Na+/K+ ?
1 - 3 Na se lient à pompe, puis ATP.
2 - Ouverture pompe vers extérieur.
3 - 3 Na sont relachés vers l’extérieur de la cellule.
4 - 2 K se lient puis hydrolyse de l’ATP.
5 - Ouverture vers intérieur.
