1
Q
Qu’est-ce que la diversité génétique ? (3)
A
Variabilité génétique entre les individus qui influence l’apparence, les préférences et la réponse aux traitements
Inclut des différences dans la susceptibilité aux maladies et la réponse à l’environnement.
2
Q
Quel est l’impact de la variabilité génétique sur la santé ? (2)
A
Permet d’établir des préventions et traitements personnalisés selon l’individu
Cela fait partie de la pharmacogénétique.
3
Q
Quels exemples montrent l’impact de la variabilité génétique ? (3)
A
- Allergies
- Réponse aux traitements
- Sensibilité aux médicaments
Inclut les problèmes gastriques et la susceptibilité à différentes maladies.
4
Q
Comment une mutation génétique peut-elle affecter le développement du cancer ?
A
Une mutation peut être à la fois bénéfique ou néfaste, dépendant du contexte
Peut empêcher le développement du VIH ou causer d’autres problèmes.
5
Q
Pourquoi s’intéresser à la variabilité génétique ? (3)
A
- Explique les différences phénotypiques
- Cause des maladies
- Permet de suivre l’histoire de l’homme
Ces points soulignent l’importance de la variabilité génétique dans divers domaines.
6
Q
Quels éléments contribuent aux différences génétiques inter-individuelles ?
A
- Gènes codant pour plusieurs protéines
- Épissage
- Modifications post-transcriptionnelles
- Isoformes
Cela inclut également des gènes qui ne codent pas pour des protéines.
7
Q
Combien de gènes et de protéines les humains possèdent-ils ?
A
20 000 à 25 000 gènes codant pour environ 100 000 protéines
Les gènes ont la structure d’un gène.
8
Q
Combien de paires de chromosomes les humains ont-ils ?
A
23 paires de chromosomes
Comprend 22 paires d’autosomes et 1 paire de chromosomes sexuels.
9
Q
Quel est le pourcentage de différence entre le code génétique des humains ?
A
Le code génétique est identique à 99,8%
Cela signifie qu’il y a une différence d’une paire de bases pour chaque 1000 paires de bases.
10
Q
Quelle est la différence entre l’homme et le chimpanzé en termes de code génétique ?
A
Environ 2%
Cette différence change l’espèce.
11
Q
Quelles molécules composent l’ADN ?
A
- A
- T
- G
- C
Ce sont les quatre bases nucléiques qui forment l’ADN.
12
Q
Quelle est la nature des différences génétiques?
A
Inclut des variations comme substitutions, insertions, et délétions.
13
Q
Qu’est-ce qu’un SNP?
A
Single nucleotide polymorphism, une variation d’un seul nucléotide dans le génome
Les SNPs se produisent en moyenne 1 SNP à chaque 300 pb.
14
Q
Quels types de mutations sont considérés dans les SNPs?
A
- Substitution
- Insertion
- Délétion (indel)
Les mutations ponctuelles peuvent être soit des insertions soit des délétions selon la séquence de référence.
15
Q
Quelle est la fréquence des petites insertions/délétions?
A
1 indel à chaque kb
Ces variations peuvent affecter la structure et la fonction des gènes.
16
Q
Qu’est-ce qu’un CNV?
A
Copy number variant, variation du nombre de copies d’un segment d’ADN
Peut être à petite échelle ou plus grande, avec des répétitions variant selon les individus.
17
Q
Quelle est la définition d’un microsatellite?
A
Répétitions de séquences de moins de 10 pb
Se retrouvent environ 1 tous les quelques kb.
18
Q
Quelle est la définition d’un minisatellite?
A
Répétitions de séquences de 10 à 100 bp
Se retrouvent environ 1 tous les quelques kb.
19
Q
Quels types de gènes peuvent être répétés?
A
- rRNA
- Histones
Les mutations chromosomiques incluent les inversions, insertions, délétions, et translocations.
20
Q
Quels sont les types de SNPs?
A
- rSNP (SNP régulateur)
- iSNP (SNP intronique)
- cSNP (SNP codant)
- gSNP (SNP génomique)
Chaque type a des effets différents sur l’expression des gènes.
21
Q
Quel est l’impact d’un iSNP?
A
Ne code pas pour des protéines, a un faible impact sur l’expression
Peut produire des microARN qui régulent l’expression génétique.
22
Q
Quel est l’impact d’un cSNP?
A
Code pour des protéines, peut causer des changements d’acides aminés
Ces changements peuvent désactiver le site actif d’une enzyme.
23
Q
Qu’est-ce qu’un gSNP?
A
SNP génomique, se retrouve dans l’ADN non codant
Peut influencer l’expression des gènes sans être traduit en protéine.
24
Q
Quelle base de données est utilisée pour les SNPs existants?
A
dbSNP
Les SNPs y sont mémorisés avec un code RS (chiffres) pour accès aux informations.
25
Vrai ou Faux: Chaque acide aminé correspond à un codon unique.
Faux
## Footnote
Plusieurs codons peuvent coder pour le même acide aminé.
26
Quelles son les mutations ponctuelles existantes?
27
Comment une mutation peut-elle affecter un récepteur?
Peut empêcher le substrat de se lier correctement, affectant la réponse au signal
## Footnote
Exemple: une mutation dans un récepteur peut réduire l'efficacité d'un médicament.
28
Qu'est-ce qu'un SNP non-coding (rSNP)?
Un SNP non-coding (rSNP) est une variation génétique qui n'affecte pas directement le codage des protéines mais peut influencer l'expression des gènes.
## Footnote
Les rSNP peuvent agir comme des sites de liaison pour des enhancers.
29
Quel est le rôle de la partie poly A dans un gène?
La partie poly A régule la transcription d'un gène et peut impacter la fonction si une mutation se produit dans cette région.
## Footnote
Cela peut entraîner des problèmes au niveau de l'expression génique.
30
Qu'est-ce qu'un allèle?
Un allèle est une variante donnée à un gène.
## Footnote
Les allèles d'un même gène occupent le même locus sur un chromosome.
31
Comment définit-on le génotype?
Le génotype représente la constitution d’une paire d’allèles à un locus donné.
## Footnote
Un génotype peut inclure des mutations de substitution ou des indels.
32
Qu'est-ce que le phénotype?
Le phénotype est le trait observable chez une personne résultant de l'expression des allèles.
## Footnote
Des exemples incluent la couleur des yeux, la taille, ou la réponse à un médicament.
33
Quel est l'impact de l'environnement sur le phénotype?
L'influence de l'environnement peut se conjuguer à celle du génotype pour déterminer l'expression du phénotype.
## Footnote
L'interaction entre le gène et l'environnement peut provoquer des variations phénotypiques.
34
Qu'est-ce qu'un polymorphisme?
Un polymorphisme est une variation génétique dans une population, comme un SNP, qui est trouvée chez plus de 1% de la population.
## Footnote
Le SNP est considéré comme une variation stable dans la population.
35
Quelle est la différence entre un SNP et une mutation?
Un SNP est une variation d’une seule base retrouvée chez plus de 1% de la population, tandis qu'une mutation est une variation d’une seule base retrouvée chez moins de 1% de la population.
## Footnote
Les mutations sont généralement rares et peuvent disparaître avec le temps.
36
Qu'est-ce qu'un haplotype?
Un haplotype représente un groupe de SNPs liés sur le même segment chromosomique.
## Footnote
Les haplotypes sont transmis ensemble et permettent d'analyser les données génétiques de manière plus efficace.
37
Comment sont classés les allèles en fonction de leur fréquence?
Les allèles peuvent être classés en allèle majeur (fréquence > 50%) et allèle mineur (fréquence < 50%).
## Footnote
La variation d'un SNP est souvent considérée dans le contexte de la population.
38
Vrai ou Faux: La probabilité d’une mutation récurrente affectant le même locus est très élevée.
Faux.
## Footnote
La probabilité d'une mutation récurrente affectant le même locus est très faible.
39
Qu'est-ce qu'un tag SNP?
Un tag SNP est un SNP particulier qui représente un haplotype dans une population, permettant d'identifier d'autres SNPs associés.
## Footnote
Les tag SNPs sont utilisés pour simplifier l'analyse des variations génétiques.
40
Complétez: Un SNP est généralement une variable _______.
binaire (i.e. 2 allèles).
## Footnote
Cela signifie qu'un SNP a généralement deux formes alléliques.
41
Quelle est la conséquence d'une mutation dans un site d'épissage?
Une mutation dans un site d'épissage peut empêcher l'enzyme d'épissage de reconnaître le site, entraînant des protéines mal formées.
## Footnote
Cela peut affecter la structure et la fonction de la protéine.
42
Qu'est-ce que l'état polymorphe ou monomorphe?
Caractéristique d'un gène (ou portion non codante d'ADN) et d'une population
polymorphe: Variabilité d’un gene d’une
population a l’autre, ex. Couleur
des yeux
monomorphe: une seule forme de gene dans la population
43
Dans l'etat monomorphe que doit être identique chez une population ?
Un gène ou une partie
44
Une même population peut-elle être polymorphe pour un caractère et monomorphe pour un autre?
Oui
45
V ou F: le caractère polymorphe /monomorphe est lié à la mutation.
F: ce n’est pas lie a une mutation. On parle vraiment d’un caractère dans un population. On parle
plus d’essentialite pour la vie ou non. On veut juste caractériser les populations
46
Quel est le chemin de la mutation vers le SNP?
Apparition d’un nouveau variant par mutation --- Gn ---> Survie d’un allèle rare a cause d’un effet « bottle neck » ------> Élévation de la fréquence allélique suite à l’expansion de la population -------> Le nouvel allèle est fixe dans la population comme un nouveau SNP
47
Qu'est-ce qui peut causer la survie d'un allèle rare?
Effet 'bottleneck'
48
Quelles sont les deux issues possibles d'une mutation?
* Disparition * Élévation de la fréquence allélique suite à l’expansion de la population
49
Les mutations dues à l'exposition aux rayons UV se transmettent-elles aux enfants?
Non, sauf si c'est dans les cellules germinales
50
Qu'est-ce qui peut entraîner une élévation de la fréquence allélique?
Expansion de la population
51
Que se passe-t-il avec un nouvel allèle après son expansion dans la population?
Il est fixé dans la population comme un nouveau SNP
52
explique l'effet du goulot d'etranglement
53
Quelles sont les fréquences des allèles ABO en haut de la liste?
A: 42%, B: 9%, O: 46%
## Footnote
Les allèles A et B sont co-dominants, tandis que l'allèle O est récessif.
54
Quel est le pourcentage de l'allèle AB dans le système ABO?
3%
## Footnote
Ce pourcentage est influencé par l'immigration, ce qui crée de grandes banques de sang.
55
Qu'est-ce que le TPMT?
Enzymes de métabolisation
## Footnote
Le profil des allèles TPMT varie selon les populations, avec des similarités entre les caucasiens et des différences avec les africains.
56
Quelles sont les deux catégories de maladies génétiques?
Maladies simples et maladies complexes
## Footnote
Les maladies simples résultent d'une mutation dans un gène, tandis que les maladies complexes nécessitent des interactions entre plusieurs gènes et l'environnement.
57
Donnez un exemple de maladie mendélienne.
Fibrose kystique
## Footnote
Les maladies mendéliennes sont considérées comme simples.
58
Donnez deux exemples de maladies complexes.
Hypertension, diabète
## Footnote
Les maladies complexes impliquent plusieurs facteurs génétiques et environnementaux.
59
Qu'est-ce qu'une maladie à forte pénétrance?
L'expression de la maladie est sous le contrôle d'un gène à forte pénétrance
## Footnote
Si la mutation existe, son impact est énorme.
60
Vrai ou Faux: La maladie complexe nécessite une mutation dans un seul gène.
Faux
## Footnote
Les maladies complexes nécessitent des interactions entre plusieurs gènes et l'environnement.
61
Complétez: Les maladies simples résultent d'une _______ dans un gène.
mutation
## Footnote
Les maladies complexes, en revanche, impliquent des interactions plus complexes.
62
Quels facteurs affectent l'expression des maladies complexes?
Plusieurs facteurs génétiques et environnementaux
## Footnote
Ces facteurs confèrent un faible risque et sont impliqués dans l'apparition de la maladie.
63
caracteristique d'une maladie mendelienne
64
caracteristique d'une maladie complexe
65
Quel est le taux de mortalité des fœtus atteints de désordres génétiques?
75%
## Footnote
Cela indique la gravité des désordres génétiques au cours du développement fœtal.
66
Quelles maladies sont considérées comme monogéniques?
* Fibrose kystique
* Cancer du sein
* Leucémie chez les enfants
## Footnote
Ces maladies sont causées par une seule mutation génétique.
67
À quel âge la visibilité critique des maladies monogéniques est-elle généralement observée?
Entre 3 et 5 ans
## Footnote
C'est à cet âge que les symptômes des maladies monogéniques deviennent souvent apparents.
68
Quels sont les trois types majeurs de transmission héréditaire?
* Autosomique dominant
* Autosomique récessif
* Liée au chromosome X
## Footnote
Ces types de transmission décrivent comment les traits génétiques sont hérités.
69
Qu'est-ce que l'hérédité autosomique dominante?
Un trait qui nécessite seulement un parent affecté pour être transmis
## Footnote
Exemple: Hypercholestérolémie familiale.
70
Quel est le pourcentage de probabilité qu'un enfant d'un parent atteint d'une maladie autosomique dominante soit malade?
50%
## Footnote
Cela signifie qu'il y a une chance sur deux que l'enfant hérite de la maladie.
71
Quelles sont les caractéristiques de l'hérédité autosomique récessive?
* Les personnes atteintes sont généralement nées de parents non-atteints
* Porteurs asymptomatiques
* Incidence accrue chez la consanguinité parentale
* Chaque enfant a une probabilité de 25% d’être atteint
## Footnote
Exemple: Fibrose kystique, anémie falciforme.
72
Qu'est-ce que l'état hémizygote dans l'hérédité récessive liée au chromosome X?
Un état où un homme est affecté parce qu'il n'a qu'un seul chromosome X
## Footnote
Les femmes peuvent être porteuses sans être affectées.
73
Quelles maladies sont des exemples d'hérédité récessive liée au chromosome X?
* Hémophilie
* Dystrophie musculaire de Duchenne
## Footnote
Ces maladies affectent principalement les mâles.
74
Quel effet a le stade de développement sur la probabilité d'apparition de certaines maladies génétiques?
La probabilité d'apparition est plus élevée selon le stade de développement
## Footnote
Par exemple, certaines maladies sont moins probables à un stade avancé de la grossesse.
75
Quelles interactions deviennent plus importantes avec l'augmentation des maladies monogéniques?
Interaction gène, mutation et style de vie
## Footnote
Cela souligne l'importance des facteurs environnementaux dans le développement de maladies.
76
Qu'est-ce que l'analyse de liaison?
C'est une méthode pour associer les maladies à la génétique en suivant la co-ségrégation de la maladie et des variantes génétiques dans des familles.
## Footnote
Utilisée principalement avec les maladies mendéliennes.
77
Quels types de familles sont utilisés dans l'analyse de liaison?
Grandes familles
Petites familles
## Footnote
Les grandes familles permettent de mieux retracer les mutations.
78
Pourquoi les petites familles sont-elles moins optimales pour l'analyse de liaison?
Il y a une grande variabilité génétique et il est difficile de déterminer ce qui est différent.
## Footnote
Cela complique l'identification des gènes impliqués.
79
Qu'est-ce que le clonage positionnel?
C'est une méthode qui consiste à comparer l'ADN des personnes malades avec celui des personnes saines pour identifier les régions génétiques pertinentes.
## Footnote
On enlève les régions similaires, se concentrant sur celles qui diffèrent.
80
Quelles sont les applications du diagnostic moléculaire et médecine préventive
* Détecter les porteurs de maladies
* Déterminer la présence d'un fœtus à risque
* Diagnostic prénatal
* Diagnostic préimplantatoire
* Confirmer un diagnostic
* Dépistage pré-symptomatique
* Late adult-onset
## Footnote
Ces applications permettent une meilleure gestion des maladies génétiques.
81
Quels types de maladies sont considérées comme complexes?
* Cardiovasculaires
* Diabète
* Asthme
* Déficiences mentales
* Cancer
## Footnote
Ces maladies résultent d'interactions entre plusieurs gènes et l'environnement.
82
Quelles hypothèses de travail sont proposées concernant les maladies complexes?
* Variations phénotypiques dans certaines voies métaboliques/biologiques affectent le risque de maladie
* La variabilité inter-individuelle est modulée par des variants fonctionnels d'ADN
## Footnote
Ces hypothèses aident à comprendre le lien entre génétique et risque de maladie.
83
Comment associe-t-on un gène/SNP à un trait complexe?
À travers des études d'association, qui incluent des designs Cas-Contrôles, de Cohorte, et familial (trio parental).
## Footnote
Ces méthodes sont plus appropriées pour les maladies complexes.
84
Qu'est-ce qu'un design Cas-Contrôles?
C'est une méthode d'étude qui compare les personnes malades à celles qui ne le sont pas pour détecter des associations génétiques.
## Footnote
Utilisé dans les études d'association.
85
Qu'est-ce que le design familial TDT?
C'est une méthode d'analyse familiale qui considère les trios parentaux (père, mère, enfant atteint).
## Footnote
Elle est utilisée pour rechercher des mutations chez des individus ayant des liens familiaux.
86
Quelle est la préférence dans les études d'association familiale?
Family-Based Cas-Contrôles
## Footnote
Cela permet d'explorer les mutations même sans lien familial direct.
87
Qu'est-ce qu'une étude d'association?
Comparaison des cas et contrôles pour étudier les maladies complexes
## Footnote
Inclut l'évaluation des effets secondaires associés à des gènes spécifiques
88
Quelle est la différence entre une étude d'association pangénomique et une étude de gène candidat?
Pangénomique: libre d'hypothèse, coût élevé, correction pour analyses multiples
Gène candidat: basée sur une hypothèse, faible coût, moins d'impact de la correction statistique
## Footnote
Les études pangénomiques examinent tout le génome tandis que les études de gènes candidats se concentrent sur des gènes spécifiques
89
Qu'est-ce qu'un tag SNP?
Un SNP choisi pour réduire le nombre de polymorphismes à étudier
## Footnote
Utilisé pour représenter d'autres SNP sur le même haplotype
90
Quels sont les avantages d'une étude d'association pangénomique (GWAS)?
Libre d'hypothèse, permet d'étudier tout le génome, risque de ne rien manquer
## Footnote
Cependant, il y a un coût élevé et un besoin important en genotypage
91
Quels sont les inconvénients d'une étude de gène candidat?
Biais potentiel, moins de cibles manquées, moins de faux positifs, mais basé sur une hypothèse
## Footnote
Peut conduire à l'oubli de certains gènes importants
92
Quelles informations peuvent être utilisées pour sélectionner des gènes candidats?
Fonction et localisation chromosomique
## Footnote
Par exemple, cibler un gène connu pour être impliqué dans une maladie spécifique
93
Vrai ou faux: Les études de gènes candidats ont un besoin élevé en genotypage.
Faux
## Footnote
Les études de gènes candidats ont un faible besoin en genotypage
94
Qu'est-ce qui peut causer des faux positifs dans les études pangénomiques?
Utilisation de bruits de fond comme étant des signaux
## Footnote
Cela peut conduire à des associations erronées
95
Complétez la phrase: Les fréquences alléliques détermineront le nombre de _______.
patients
## Footnote
Cela affecte la puissance de l'étude
96
Quels sont les gènes sélectionnés dans les voies métaboliques pertinentes?
Gènes codant pour les déterminants pharmacocinétiques et pharmacodynamiques des effets des médicaments.
## Footnote
Ces gènes sont cruciaux pour comprendre comment les médicaments interagissent avec le corps.
97
Comment la technique du gène candidat est guidé ?
On choisit selon l’hypothèse pour la technique du gène candidat.
## Footnote
Cela implique de sélectionner des gènes en fonction de leur rôle présumé dans les effets secondaires des médicaments.
98
Quels types de cibles sont sélectionnés pour comprendre les effets secondaires d'un médicament?
* Récepteurs des médicaments
* Enzymes
* Transporteurs
* Canaux ioniques
## Footnote
Ces cibles sont essentielles pour analyser comment un médicament agit dans le corps.
99
Quelles sont les approches sélectionnées pour les gènes candidats dans l'asthme?
* Approche fonctionnelle
* Approche positionnelle
## Footnote
Ces approches aident à identifier les gènes en lien avec l'asthme.
Pharmacogénétique A25
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