étape 1 initiation
dissociation du ribosome
=> grâce à eIF-3 et eIF-1A => dissocie sous u 40 S et 60 S
permettent
- retarder la ré association
- favoriser arrivée de eIF-1 et eIF-5
étape 2 initiation
formation du complexe de pré initiation 43 S
- association GTP + eIF-2 => complexe binaire
- puis cplx binaire ac ARNtiMet => complexe ternaire
- liaison à la sous u 40 S => complexe d’initiation
- stabilisé par eIF-3 et eIF-1A
étape 3 initiation
formation du complexe d’initiation 48 S
- formation cplx protéique de liaison eIF-4F formé de eIF-4E; eIF-4G et eIF-4A qui se fixe sur coiffe
- fixation sur ARNm coté 5’ de eIF-4B => hydrolyse d’un eq ATP
=> activation ARNm
- ARNm activé + cplx 43 S => cplx 48 S grâce à un eq ATP par eIF-4B
étape 4 initiation
formation du complexe 80 S
- liaison 60 S et cplx 48 S => hydrolyse de 2 eq GTP liés à eIF-2 par eIF-5B
- libération de facteurs d’initiation = formation ribosome 80 S
=> ARNtiMet au niveau du site P = prêt pr élongation
coût énergétique initiation
2 eq ATP + 2 eq GTP
étape 1 élongation
décodage
- eEF-1B catalyse l’échange d’un GDP par un GTP sur facteur eEF-1A
- eEF-1A reçoit un ARNt chargé
- eEF-1A transfère ARNt chargé sur l’ARNm au niveau du site A
étape 2 élongation
formation de la liaison peptidique
- transfert du peptidyl-ARNt du site P à la fonction amine de l’ARNt du site A
=> formation liaison peptidique
- réaction catalysée par la peptidyl-transférase qui utilise l’énergie de la rupture de la liaison ester entre peptide et ARNt
étape 3 élongation
translocation
- ARNt du site P va au site E
- ribosome avance de 3 unités
- ARNm + ARNt + peptide du site A sont transloqués vers le site P sans séparation
coût énergétique élongation
2 GTP / AA intégré
étape terminaison
dissociation cplx en présence des facteurs eRF
- codon stop reconnu par eRF-1 (stimulée par eRF-3)
- cplx eRF-1/eRF-3 clive liaison ester entre peptide et ARNt donc libération de la protéine
=> hydrolyse GTP pr libérer les autres facteurs
coût énergétique terminaison
1 eq GTP
bilan global énergétique
(2n +2) eq ATP + (2n +1) eq GTP
régulation eIF-4E
séquestré par 4E-BP
exemple régulation eIF-4E
insuline :
active une kinase qui phsophoryle 4E-BP => libération eIF-4E qui va s’associer à eIF-4G
cplx 4E/4G s’associe ac eIF-4A pr former cplx eIF-4F = traduction
GCN 2
activée en carence d’AA (stress nutritionnel)
PERK
activée par stress du RE
PKR
activée par infection virale
HRI
activée par carence en fer/hème
combien de prot sont dirigées vers le RE ? et pourquoi ?
1/3
pour être repliées
acquérir une structure secondaire et tertiaire
exp de prot synthétisées en partie dans le RE
- membrane externe
- matrice extra cellulaire
- hormones peptidiques
- protéines plasmatiques
- facteurs de croissance
- facteurs impliqués dans l’inflammation et réponse immunitaire
peptide signal
peptide signal situé à l’extrémité N-term
structure riche en AA hydrophobes
étapes de la signalisation par peptide signal
- liaison du peptide signal à la prot SRP => inhibition de l’élongation
- SRP reconnue par récepteur de la membrane du RE => ouverture d’un pore ds membrane du RE => élimination SRP => reprise de l’élongation
- endopeptidase qui coupe le peptide signal => la synthèse se poursuit jusqu’à la terminaison
antibiotiques = exp
- famille des tétracyclines (fixation au site A)
- chloramphénicol (inhibe transpeptidation donc inhibe la peptidyl transférase)
- famille des aminosides (fixation au site A => mauvaise reconnaissance)
toxines = exp
- ricine : agent biologique toxique => se fixe sur gde sous u ribosome
- toxine diphtérique : responsable diphtérie => bloque élongation en inactivant eEF-2
