Hoeveel procent van de eiwitten in een mens zijn transmembraan eiwitten?
20%
Welke ankers zijn betrokken bij C14, C16, en C15 bindingen
C14: Myristoyl anker
C16: Palmitoyl anker
C15: Farnesyl anker
Hoe kun je onderzoeken of een eiwit een transmembraan eiwit is?
Door de aminozuur sequentie te onderzoeken (met hydropathy plotting) en te kijken of er een sequentie is van ~20 hydrofobe aminozuureenheden, aangezien hydrofobe aminozuren binnen het membraan zitten. Positieve waarden in zo’n plot komen van hydrofobe eenheden en negatieve van hydrofiele eenheden
Welke bindingen maken eiwitten met C14, C16, en C15?
C14: Amidebinding
C16: Thio-ester binding
C15: Thio-ether binding
Wat vormen de meeste Beta-Barrels in een membraan?
Een porie
Waar zijn de suikereenheden gekoppeld als een eiwit in het membraan zit?
Altijd buiten de cel
Binnenkant van de cel: Reducerende/Oxiderende omgeving
Buitenkant van de cel: Reducerende/Oxiderende omgeving
Binnenkant van de cel:
Reducerende omgeving
Buitenkant van de cel:
Oxiderende omgeving
Wat is de functie van de suikerlaag op cellen?
Het zorgt voor cel-cel communicatie; cellen kunnen elkaar herkennen.
Hoe werkt het zuiveren van een Natrium Kalium Pomp uit een membraan?
- Je voegt detergentie toe, waardoor de lipidemoleculen worden opgelost
- Door kolomchromatografie, dat plaatsvindt in aanwezigheid van detergentie, zuiver je de pomp. Je houdt het eiwit continu opgelost in detergentie
- Je voegt fosfolipiden toe en haalt langzamerhand de detergentia weg. Dit kan tegenwoordig door nano deeltjes toe te voegen, waar de detergentia deeltjes aan vast gaan zitten
- De fosfolipiden gaan spontaan een bilaag vormen. Van het eiwit dat je hebt haal je de detergentie eruit weg. Dat eiwit wilt niet in water zitten, dus gaat die in de bilaag zitten, waardoor je dus een functionele Na-K pomp hebt in een fosfolipide vesicle
Welke twee detergenties worden het meest gebruikt?
SDS en Triton X-100
Wat is het verschil tussen een liposoom en een proteoliposoom?
Een liposoom bevat geen eiwitten en een proteoliposoom wel
Rangschik de volgende vier groepen op basis van hoe goed een membraan hen doorlaat (1. het meest, 4. het minst):
-Grote, ongeladen, polaire moleculen
-Kleine, ongeladen, polaire moleculen
-Ionen
-Hydrofobe moleculen
- Hydrofobe moleculen (gaan spontaan door het membraan heen)
- Kleine, ongeladen, polaire moleculen (gaan langzaam door het membraan heen)
- Grote, ongeladen, polaire moleculen (gaan niet/erg langzaam door het membraan heen)
- Ionen (gaan niet door het membraan heen)
Wat zijn de twee hoofd soorten membraaneiwitten?
Transporteiwitten en kanaaleiwitten
Beschrijf de werking van een transporteiwit
Een transporteiwit bindt een substraat molecuul aan één kant van membraan, dan ondergaat het eiwit conformationele verandering, waarbij hij opengaat aan andere kant van membraan
Beschrijf de ‘werking’ van een kanaaleiwit
Eiwit in membraan dat een porie vormt (zoals beta barrel) en een molecuul dat bindt kan hier doorheen zonder dat het kanaal eiwit een conformationele verandering moet aangaan
Als een ion door een membraaneiwit wordt getransporteerd in dezelfde richting als de concentratiegradiënt, is dit dan actief of passief transport
Dit is passief transport.
Je spreekt pas van actief transport als het ion tegen de concentratiegradiënt in zou gaan, waarbij ATP nodig zou zijn (dit kan alleen bij transport eiwitten, niet bij kanaaleiwitten)
Van welke twee factoren hangt de elektrochemische gradiënt van een membraan af?
- De concentratiegradiënt (het verschil in concentratie van een stof tussen binnen en buiten de cel)
- De ladingscomponent (het verschil in elektrische lading over het membraan)
Wat is de drijvende kracht bij diffusie door een kanaaleiwit?
De concentratiegradiënt
Wat zijn de drie verschillende manieren waarop actief transport kan verlopen? (Noem ook bij elke de type pomp)
-Gekoppelde transporter: Je maakt gebruik van de concentratiegradiënt van een ander molecuul dat naar binnen wilt. De concentratiegradiënt van één molecuul drijft de concentratiegradiënt van een ander molecuul
-ATP gedreven pomp: Dit is de meest voorkomende pomp. Met behulp van ATP kan het te transporteren molecuul tegen de concentratiegradiënt in bewegen.
-Licht gedreven pomp: Je hebt hierbij licht energie nodig. Dit type energie wordt dan gebruikt om bijvoorbeeld ionen zoals H+ door het membraan te pompen
In welke twee onderdelen kun je ‘gekoppeld transport’ splitsen?
-Symport: Beide moleculen gaan zelfde kant op, maar eentje tegen de concentratiegradiënt in en andere met de concentratiegradiënt mee
-Antiport: De moleculen gaan verschillende kanten op
Wat is de drijvende kracht voor het transporteren van glucose naar de binnenkant van een cel?
Natrium
De natriumgradiënt is gericht naar de binnenkant (cytosol) van de cel, terwijl die van glucose is gericht naar de buitenkant (extracellulaire ruimte) van de cel. De concentratiegradiënt van natrium geeft dus energie voor het transport van glucose tegen zijn eigen concentratiegradiënt in. Door gekoppeld transport gaan een natrium ion en een glucose molecuul dus door een transport eiwit heen.
Waarom gaan de meeste glucose moleculen die de cel ingaan, niet via dezelfde route naar buiten?
Omdat er binnen de cel weinig natrium is dat in het transport eiwit kan om het glucose naar buiten te brengen (gekoppeld transport).
Dit komt omdat het binnengebrachte natrium door een natrium-kalium pomp weer uit de cel wordt getransporteerd, waarbij kalium de cel ingaat en natrium de cel uit (ATP-gedreven transport)
In het geval van 1 ‘pomping’, hoeveel kalium ionen betreden de cel en hoeveel natrium ionen verlaten de cel?
3 Natriumionen verlaten de cel, 2 kaliumionen betreden de cel
Als glucose vanuit de cel naar de extracellulaire ruimte wilt gaan om zo in het bloed te komen, welk type transport is hier dan bij betrokken?
Passief transport
De concentratiegradiënt van glucose is van binnen naar buiten gericht, dus er is geen energie nodig om glucose vanuit de cel naar de extracellulaire ruimte te transporteren.
