Traduction

Question 1

Que signifie synthèse des prot ?

Answer 1

Étape ultime expression d’un gène codant

Question 2

Chaînes polypeptidiques polymérisées dans quel sens ?

Answer 2

NH2 -> COOH

Question 3

Acteurs de la traduction ?

Answer 3

(Conservés + identiques)

• ribosomes : ne corrige pas ses erreurs
• ARNm
• ARNt
• autres prot

Question 4

ARNt?

Answer 4

-forme de L à l’envers
-tige acceptrice d’AA en 3’
-traducteurs : AN -> AA
-tous identiques sauf sur qq séquences
-ils portent : •l’anti-codon
• l’AA correspond au codon qui sera reconnu par l’anti-codon
-nombreux nt atypiques résultant de modifs post-transcriptionnelles
-structure secondaire : en feuille de trèfle
-associés au même AA : iso-accepteurs
- se termine tjrs par «CCA» en 3’

Question 5

Code génétique ?

Answer 5

• universel ( 20 AA pour 61 codons + codons STOP)
• dégénéré/redondant : différents codons codent pour le même AA
• NON ambigu : 1 codon code tjrs pour le même AA
• NON chevauchant : 1 base est lue 1 seule fois et appartient à 1 seul codon

Question 6

Wobble ?

Answer 6

-Flottement possible entre 3e base codon et 1ère base anti-codon

But : réduire nombre ARNt nécessaires à traduction à moins de 40 aminoacyl-ARNt différents

Question 7

1 codon -> ?
2 codons -> ?
3 codons -> ?
4 codons -> ?
5 codons -> ?
6 codons -> ?

Answer 7

1 ARNt
1 ARNt
1 ARNt
2 ARNt
2 ARNt
3 ARNt

ATTENTION : bien regarder les différents endroits du code génétique où peut apparaître le même AA

Question 8

aminoacyl-ARNt ?

Answer 8

• enzymes aminoacyl-ARNt synthétases catalysent estérification = aminoacylation
• 1 aminoacyl-ARNt par AA
• couplage AA/ARNt = endergonique (besoin d’énergie, ATP)
• enzymes possèdent 2 spé essentielles : 1 pour AA et 1 pour ARNt correspondant
• peut corriger ses erreurs

Question 9

2 AA non classiques ?

Answer 9

1) Sélénocystéine
- > STOP : UGA
- > pas d’état libre
- > anti-codon : UCA
2) Pyrrolysine
- > STOP : UAG
- > que chez certains procaryotes

Question 10

ribosome ?

Answer 10

• ribonucléoprotéine présente dans toutes les ç
• ARNr + prot ribosomiques
• 2 sous-unités : 1 petite S et 1 grande L

1) chez procaryote
- >mesure 70 S
- > grande sous-unité = 50S (36 prot)
- > petite sous-unité = 30S (20 prot)

2) chez eucaryote
- > mesure 80 S
- > grande sous-unité = 60 S(49 prot)
- > petite sous-unité = 40 S(30 prot)

Question 11

ARNm ?

Answer 11

1) chez procaryote
- > polycistronique = différents cadres de lecture = synthèse de différents polypeptides
- > extrémité 5’ reconnait séquence “RBS” : 8-10 nt en amont du codon d’initiation
- > bactérie (1% cas) : codon initiation GUG

2) chez eucaryote
- > TJRS monocystronique
- >ARNm mature = 1 seul cadre de lecture ouvert =ORF
- > 1 seule séquence codante CDS

Question 12

Séquence de Kozak ?

Answer 12

• conservée
• permet aux ribosomes de distinguer les codons AUG d’initiation de tout autre codon AUG codant pour 1 Met
• fin 5’UTR/début initiation (contient site +1)

Question 13

Initiation chez procaryote ?

Answer 13

-> 1er AA : N-Formyl-méthionine(F-Met) = généralement éliminé à la fin de la synthèse polypeptidique

1- IF3 se fixe sur petite s.u du ribosome et empêche de se combiner à grande s.u
IF1 se fixe sur site A : positionne correctement aminoacyl-ARNt d’initiation au nv site P

2-IF2 reconnait F-Met d’initiation

3-IF3 et IF1 se dissocient= recrutement grande s.u
GTP -> GDP + Pi = libération de IF2

Question 14

Initiation chez eucaryote ?

Answer 14

-> reconnaissance codon initiateur AUG par ribosome portant aminoacyl-ARNt initiateur

1-complexe ternaire (eIF2 + Met) + petite s.u ribosome + eIF5/eIF3/eIF1A =complexe pré-initiation 42 S

2- complexe pré-initiation + ARNm + eIF4(se fixe sur coiffe) = complexe 48 S

3-positionnement complexe sur codon AUG initiateur

4-action hélicase, dissociation complexe initiation sauf eIF4, arrivée grande s.u = complexe 80 S

-> Poly A =très forte affinité pour eIF4 qui lui même interagit avec eIF4E = circulation ARNm

Question 15

Elongation chez procaryote ?

Answer 15

• > synthèse prot par ajout d’AA à C-ter de la chaîne polypeptidique naissante
• > lecture ARNm par ribosome 5’ -> 3’
• > formation liaison peptidique (amide)
• > facteurs d’élongation : EFTU (lie site P) + EFTS + EFG

Question 16

Terminaison chez procaryote ?

Answer 16

-> quand ribosome arrive au nv d’1 codon STOP dans site A = fin traduction

• RF1 : reconnait UAG et UAA
• RF2 : reconnait UGA et UAA
• RF3

Question 17

Terminaison chez eucaryote ?

Answer 17

• > codon STOP apparait :
• eRF1 assure reconnaissance codon STOP + hydrolyse liaison entre prot synthétisée et ARNt présent sur site P
• eRF3 apporte GTP

chaque acteur repart dans 1 cycle de traduction tant que ARNm n’est pas détruit

Question 18

polysome ?

Answer 18

• > différents ribosomes travaillent à la suite sur même ARNm circularisé = amplification synthèse
• > visible en ME

Question 19

adressage et maturation chez eucaryote ?

Answer 19

-> prot devant atteindre même compartiment possèdent même séquence de 10 à 30 AA dans partie N-ter (cette séquence n’est pas présente dans la prot finale)
= séquence de signal d’adressage

Question 20

Exemples de modifs co et post-traductionnelles d’1 prot dans le RE ?

Answer 20

• > glycosylation : addition covalente de résidus glucidiques sur chaîne peptidique
• > ponts dissulfures : stabilisent structures tertiaires et quaternaires des prot par prot dissulfure isomérase
• > repliement correct et assemblage sous-unités par prot chaperonnes du RE