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2- Résistance bactérienne Flashcards

(76 cards)

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1
Q

Nommer les mécanismes généraux de la résistance aux antibiotiques

A
  • altération de la perméabilité/séquestration
  • Modification ou destruction de l’antibiotique
  • Modification ou remplacement de la cible
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Q

Nommer les cibles des ATB

A
  • paroi/membrane
  • synthèse ATP
  • synthèse acide folique
  • synthèse protéines
  • ADN
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Q

Le génome des bactéries est … généralement dans un chromosome … nommé … Il s’agit du matériel générique …

A
  • compact
  • circulaire
  • nucléoide
  • essentiel
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4
Q

Les plasmides sont des molécules… qui codent … Ils sont plus … que le nucléoide. Ils contiennent de l’infos procurant …, …, … pour l’hôte.

A
  • circulaires bihélicales
  • pour des fcts non-essentielles
  • petits (1-1000 kilo paires de bases)
  • Résistance aux antibiotiques.
  • Capacité métabolique supplémentaire.
  • Facteur favorisant l’infection.
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5
Q

Les bactéries se reproduisent par … Cependant, les … peuvent se répliquer de façon indépendante

A
  • fission binaire
  • plasmides
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6
Q

Nommer les principales différences entre procaryotes et eucaryotes exploitées par les ATB

A
  • nucleoide
  • ribosomes
  • paroi cellulaire
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7
Q

différencier les capacités de survie des bactéries avec des génomes de petite vs grande taille.

A

petit génome = dépend plus de l’hôte pour survivre (<1000kilos paires de bases)

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8
Q

V/F chez les bactéries, un gène d’une longueur moyenne occupe environ 1000 paires de bases et presque toutes les séquences sont codantes

A

V

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9
Q

Définir le pangénome

A

Génome de base: gènes communs à toutes les souches d’une même espèce
Génome accessoire: gènes retrouvés dans certaines souches mais absents chez d’autres souches.
Pangénome: Ensemble des gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne.

Génome de base + Génome accessoire = Pangénome

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10
Q

V/F le pangénome exclut les gènes potentiels de résistance, virulence, antigènes de surface, métabolisme divers …

A

F, pangénome = réservoir potentiel de gènes:
Résistance
Virulence
Antigènes de surface
Métabolismes divers

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11
Q

La fission binaire se fait généralement en… La répartition du chromosome est …, mais celle des plasmides est …

A
  • 20min
  • équitable
  • variable
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12
Q

Le mécanisme de base de régulation de l’expression de gènes des bactéries se fait selon les … dans le but de … Il est donc activé seulement …, mais toujours …

A
  • besoins de la bactérie
  • minimiser la dépense énergétique
  • au besoin
  • prêt à répondre

Afin de minimiser ses dépenses énergétiques, la bactérie n’active un système que si elle en a besoin

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13
Q

Quel est le principal mécanisme de régulation des bactéries qui cause l’antibiorésistance?

A

régulation transcriptionnelle avec activateurs et répresseurs = changement dans le nombre de transcripts

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14
Q

Différencier promoteur vs opérateur

A

**Promoteur: **
- Séquence d’ADN située en amont du gène reconnu par ARN polymérase = amorce transcription
- Permet la transcription de ce gène en ARNm.
Opérateur:
- Séquence d’ADN adjacente du gène reconnue par une protéine régulatrice (répresseur ou activateur)
- Contrôle la transcription

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15
Q

Différencier un répresseur vs un activateur

A

Répresseur : protéine inhibant transcription d’un gène en se liant à l’opérateur = contrôle négatif
Activateur : protéine stimulant transcription d’un gène en se liant à l’opérateur = Contrôle positif

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16
Q

La régulation de l’expression des gènes est un processus … qui exige que la cellule soit dans un état métabolique … Ce processus est plus rapide lors de … Elle comprend aussi un processus de …

A
  • actif
  • actif
  • la phase de croissance exponentielle des bactéries
  • boucle de contrôle
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17
Q

Différencer
- Opéron
- Régulon
- Stimulon

A
  • regroupement de gènes adjacents = **opéron **= un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents
  • contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un régulon (même protéine régulatrice) = une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome.
  • contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un stimulon (même stimulus) = le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus
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18
Q

Une mutation est une … de façon … ou …
Elle sera … à la cellule fille.

A
  • modification de la séquence de nucléotides de l’ADN
  • spontannée
  • induite
  • transmise
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19
Q

Les mutations spontannées sont souvent causées par … ou sont le résultat de … Elles sont … fréquentes. Les mutations induites sont … fréquentes et sont causées par …

A
  • l’action des radiations naturelles (rayons cosmiques)
  • d’erreur de réplication aléatoire
  • peu
  • plus
  • une variété d’agent mutagène (physique/chimique/bio)
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20
Q

Nommer les types d’altération de l’ADN possible lors de mutation et les conséquence

A
  • Délétions ou insertions de nucléotides
  • Substitutions de nucléotides
  • Réarrangement
    Résultats:
  • silencieuses
  • mauvais sens = défectueux
  • non-sens = incomplet (stop)
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21
Q

Nommer des phénotypes de résistance d’ATB possible suite à une mutation du génome.

A
  • perméabilité de la membrane
  • La motilité
  • La présence d’une capsule
  • L’apparence des colonies
  • Les éléments nutritionnels requis
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22
Q

Quels sont les avantages d’avoir un phénotype sélectionnable?

A
  • permet aux bactéries de survivre dans un environnement ayant des conditions dites sélectives
  • si population bactérienne exposée à ATB, seuls les mutants résiatants pourront croître
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23
Q

V/F la pression sélective crée la mutation des phénotypes sélectionnables

A

F, la mutation est survenue au hasard et elle existait déjà avant que la pression sélective ne s’exerce

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24
Q

Mécanisme contre mutations

Nommer les 5 groupes de système de réparation pour l’ADN bactérien

A
  • La réparation directe de l’ADN
  • La réparation par excision
  • La réparation par recombinaison
  • La réponse SOS (peut stimuler le transfert de gènes)
  • La réparation sujette à erreur (peut induire des mutations)
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25
V/F l'action de certains ATB peut activer les systèmes de réparation de l'ADN bactérien
V, aminoglycosides, bêta–lactamines et quinolones à faible concentration
26
Nommer des phénotypes de mutation bactérienne
- non-utilisation du lactose - morphologie allongée - présence de capsule/incapacité d'en produire une - résistance accrue dans certaines colonies
27
Définir la fenêtre de sélection par les ATB
Lorsque la CMI est entre la fraction susceptible et la fraction résistance = concentration suboptimale des ATB durant tx peut sélectionner les mutants résistants.
28
V/F plusieurs études concluent qu'un tx d'ATB plus court serait comparable si on augmente les doses d'ATB
F, trop peu d’études robustes pour conclure sur la réduction de la durée de l’antibiothérapie
28
Comment éviter la fenêtre de sélection par ATB?
- traiter rapidement - traiter efficacement = bon dosage et durrée complète
29
Le transfert horizontal est une manière d'... sans ... Il existe 3 mécanismes ...
- échanger de l'info génétique - reproduction sexuée - transformation - conjugaison - transduction
30
# TRansfert horizontal Définir: - transformation - conjugaison - transduction
- transformation: résidus de l’ADN de bactéries mortes entre dans une bactérie vivante - conjugaison: rapprochement physique entre deux cellules bactériennes où une cellule donatrice peut transférer activementune partie de son bagage génétique à une bactérie réceptrice - transduction: des bactériophages (des virus qui n’infectent que les bactéries) empaquetent accidentellement du matériel génétique appartenant à lacellule hôte = transfert certains gènes bactériens de manière horizontale
31
Quel est le mécanisme de transfert horizontal le plus prédominant?
conjugaison
32
Définir la compétence
concept en lien avec la transformation = capacité qu'ont certaines cellules d'être transformées par de l'ADN externe provenant de bactéries mortes
33
La transformation est beaucoup plus efficace entre bactéries ...
d'une même espèce
34
Nommer la bactérie la plus souvent soumise à des transformation qui augmente sa résistance
Streptococcus pneumoniae (et autres espèces apparentées de streptocoques/pneumocoque)
35
V/F les bactéries réceptrices de l'ADN étranger par transformation contrôle cet ADN
V
36
Comment les ATB ou d'autres médicaments non-antibiotiques peuvent favoriser la transformation?
* En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance. * En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence. * En favorisant la lyse de cellules, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation.
37
La conjugaison est un échange de matériel génétique ... qui requiert un ... entre les cell. Il s'agit d'un type d'échange ... Les gènes échangés sont appelés ...
- unidirectionnel - contact - parasexuel - plasmides conjugatifs
38
Les plasmides conjugatifs de type R donne de la ... aux bactéries ... Les Gram - font de la conjugaison avec ... alors que les Gram+ utilisent ...
- résistances aux ATB - Gram+ et - - un pili conjugatif ou sexuel - un mécanisme de rapprochement
39
Définir la mobilisation
transfert de plasmide non conjugatifs en même temps qu'un plasmide conjugatif
40
Quel est le principal mécanisme d'échange horizontal responsable de la résistance aux ATB?
conjugaison
41
V/F la conjugaison est observée entre différentes espèces de bactéries
V
42
Décrire les différents cycles de vie des bactériophages
- phage virulent ou lytique: cause mort cellulaire - phage lysogénique ou tempéré: entre dans cell et introduit matériel génétique pour qu'il soit répliqué - phage chronique: capables de sortir de la cellule bactérienne sans la lyser = infecte à répétition
43
Définir la transduction spécialisée
génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du prophage est improprement excisé du génome de l'hôte
44
V/F le phénomène de transduction spécialisée est rare et les bactériophages hybrides peuvent se propager
V
45
L'empactage accidentel de fragment de l'ADN de l'hôte dans une capside de phage est le résultat de ... Ce type de phase ne peut se ... suite à l'infection initiale.
- transduction généralisée - propager
45
Nommer des gènes transférés par transduction
- la toxine de Corynebacterium diphteriae - l'entérotoxine de certaines souches de E. coli - la toxine du streptocoque responsable de la scarlatine - certaines toxines de Clostridium botulinum - certains gènes de résistance aux bêta-lactamines chez les Pseudomonas
46
V/F La transmission horizontale de certains gènes entre les bactéries appartenant à des lignées distinctes a pour effet de relentir les capacités d’adaptation évolutive des bactéries
F, effet d'accélérer adaptation
47
La transposition est le ... Elle requiert ... entre les lieux de transfert et peut s'opérer entre ... éléments génétiques.
- mvt de segment d'ADN dans une même cell - proximité physique - différents
48
Nommer les 3 classes de transposons
- les séquences d'insertion (IS) - les transposons complexes (composites avec IS + autres gènes) - les phages transposables
49
Expliquer l'importance médicale des transposons complexes
peuvent encoder à l'intérieur de leur région centrale, des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques.
50
Définir intégron
- éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément - peuvent se retrouver à l’intérieur de transposons complexes ainsi que sur des plasmides
51
V/F les transposons contiennent des gènes de résistances
F, ils sont seulement responsables du mvt des gènes
52
V/F La présence d'ATB dans l'environnement peut contribuer aux résistances bien que l'ATB ne soit pas directement ingéré ou administré.
V
52
V/F L'administration de médicaments antibactériens perturbe l’équilibre de la flore bactérienne sur le corps humain. Des médicaments ayant des cibles thérapeutiques humaines et **non destinés à attaquer des microbes**, peuvent tout de même parfois avoir des effets antimicrobiens.
V
53
V/F La résistance aux antimicrobiens peut se répandre par de multiples voies directes et indirectes entre les humains, les animaux et leur environnement
V
54
Différencier microbiote et microbiome
MICROBIOTE: Ensemble des microbes, bactéries, archées, fungi, protistes, virus vivant dans un environnement spécifique. MICROBIOME: Ensemble des génomes microbiens colonisant un environnement + composition en microbes et théâtre d’activité de ces micro-organismes dans leur écosystème particulier (métabolites et molécules signales). ## Footnote Notre corps est un écosystème et notre microbiote est une partie essentielle de notre système immunitaire.
55
Il y a 500-1000 espèces de bactéries qui vivent ... le corps humains. Il y a ...x plus de cell bactériennes qu'humaines ...
- dans ou sur - 10 - nuclées
56
Dans les médicaments non-ATB les ... affectent le plus la résistance aux ATB.
antipsychotiques | encore à l'étude
57
Décrire le potentiel d’action du métabolisme bactérien sur des médicaments ciblant l’humain
On connait plus de 40 médicaments qui peuvent être métabolisés par le microbiote intestinal/vaginal = mécanisme encore mal compris
58
V/F l'utilisation disproportionnée des ATB est plus prédominante dans les hôpitaux
F, dans les communautés
59
Nommer les prestataires de soins qui prescrivent le plus d'ATB
1. MD généraliste 2. DMD, Inf, PHA 3. spécialiste (dermato, podiatre)
60
Nommer les infx responsables pour la plupart des ordonnances d'antibiotiques
Adultes: UTI et Infx respiratoire Enfants: otites
61
Décrire les vaisseaux par lesquels le résistance aux ATB peuvent se propager.
1) les humains 2) les animaux et les humains, y compris par les aliments 3) les animaux 4) l’environnement, y compris par de l’eau et des fertilisants contaminés
62
Décrire le système de restriction-modification
- barrières à l’échange des gènes de résistance - enzyme méthylase + nucléase de restriction - CRISPR/Cas
63
Décrire comment le système méthylase et nucléase de restriction fonctionne
1. méthylase modifie l'ADN de l'hôte = protége d'une digestion éventuelle 2. nucléase de restriction =détruit l’ADN étranger non méthylé = restreint l’entrée de matériel génétique nouveau.
64
Décrire le mécanisme de CRISPR/Cas
Lorsqu'un nouveau phage infecte une bactérie, 1. CRISPR de la bactérie incorpore une courte séquence dérivée du génome du phage = « mémoire » 2. séquences CRISPR sont transcrites = courte molécule d'ARN CRISPR qui patrouillent l’intérieur de la bactérie à la recherche de séquence de phages qui pourraient infecter la bactérie 3. Si l'ARN CRISPR reconnait une séquence d’envahisseur, protéine Cas coupe l'ADN étranger
65
Dans les sols, les bactéries ont ... de mobilité et de sélection que chez l'humain.
moins
66
V/F certains médicaments sont synthétisés par des méthodes d'ADN recombinant à l'aide des bactéries, micro-organismes ou cell eucaryotes plus complexes
V
67
Nommer des produits pharmaceutiques synthétisés par des bactéries ou autres types de cell
- l'hormone de croissance humaine - l'insuline humaine - l'érythropoïétine humaine (EPO) - la DNase humaine - l'activateur du plasminogène humain - certains vaccins (hépatite B, COVID-19, etc.) - des anticorps monoclonaux humanisés - des thérapies génétiques utilisant des outils CRISPR Cas9
68
Les dx par test PCR sont un types de test ... Il s'agit de la réplication de ... pour qu'il devient facilement détectable.
- d'amplification d'acide nucléique - milliards de copies du matériel génétique
69
V/F les TAAN ou PCR nécessicitent de devoir multiplier par culture le nombre de microbes afin qu'ils soient détectables avant de les identifier.
F, cette méthode = haut niveau d’amplification spécifique des acides nucléiques ciblés
70
Les bactéries qui deviennent résistante sont plus ... à traiter que celles non résistantes malgrés le développement de nouveaux ATB.
difficiles
71
Nommer des comportements à modifier pour pour réduire la propagation des infx sans l'usage d'ATB
- vaccination - lavage mains - rapport sexuel protégé - bonne hygiène alimentaire
72
Nommer les actions que les professionnels de la santé peuvent faire pour prévenir et combattre la propagation de la résistance aux ATB
* faire de la prévention (propreté mains, instruments et environnement + vaccination) * ne prescrire et délivrer des antibiotiques qui si nécessaires (suivre lignes directrices) * signaler les infections résistantes aux antibiotiques aux équipes de surveillance * conseiller patients de la prise correcte des antibiotiques/dangers d’un usage abusif
73
Le plan d'action de l'OMS définit 5 objectifs stratégiques pour lutter contre la résistance aux ATB. Nommer 1 stratégie.
optimiser l’usage des agents antimicrobiens
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