ADN - ARN - Protéines Flashcards

(31 cards)

1
Q
  1. Quelles sont les quatre bases de l’ADN?
    a. Quelles sont les pyrimidines et quelles sont les purines?
A

A, T, G, C
pyrimidines : T, C
purines : A, G

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2
Q
  1. Quels sont les ratios de Chargaff qui définissent la composition en nucléotides de l’ADN?
A

Il y a autant de bases A que de T et de G pour C.
Si on additionne les A avec les G c’est égal aux T avec C.

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3
Q
  1. Quelles sont les caractéristiques de la structure de l’ADN :
    a. Comment les nucléotides sont-ils attachés les uns aux autres?
    b. Quelle est l’orientation d’un brin par rapport à l’autre?
    c. Quelles bases sont complémentaires?
    d. Quel type de lien permet aux brins complémentaires d’interagir?
A

a. liens phosphodiester
b. antiparallèle
c. A-T ; G-C
d. ponts H

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4
Q
  1. Que signifie l’expression « réplication semi-conservative »?
A

Lorsque l’ADN est répliqué, chaque brin parental permet la synthèse d’un nouveau brin, on dit alors que c’est semi-conservatif parce qu’on garde toujours 1 brin mère intact et un brin nouvellement synthétisé

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5
Q
  1. Combien d’origines de réplication sont présentes dans un génome d’une bactérie typique?
    a. Une origine de réplication génère combien de « fourches » de réplication?
    b. Trouve-t-on une seule origine de réplication par chromosome eucaryote?
A

1 origine de réplication

a. 1 origine de réplication pour générer 2 fourches

b. Non, plusieurs origines de réplication qui forment des bulles de réplication

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6
Q
  1. La structure des gènes codant pour des protéines est-elle identique entre les procaryotes et les eucaryotes?

a. Quelles différences trouve-t-on à l’intérieur des séquences codantes?

A

Non

a.
Eucaryote : zones codantes exons + régions non-codantes introns retirés dans l’épissage pour produire l’ARNm mature

Procaryote : région entièrement codante et des régions de régulation pour l’initiation de la transcription + zones de terminaison de la transcription

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7
Q
  1. La complexité des espèces, tel que les humains, est-elle simplement expliquée par le nombre de gènes, la quantité d’ADN ou le nombre d’exons par gène?
A

Le nombre d’exons est corrélé avec la complexité en raison de l’épissage alternatif produisant une variété de protéines qui peuvent être exprimées avec le même gène, explique pourquoi les bactéries pourraient être caractérisées comme moins complexes donne de la variabilité génétique.

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8
Q
  1. Pourquoi les espèces aux plus petits génomes, autant dans la taille que dans le nombre de gènes, sont-elles souvent des parasites obligatoires ou des endosymbiotes?
A

Parce qu’ils laissent aller certains gènes qui serviraient à remplir des fonctions qui sont assumées par l’organisme hôte, phénomène dérive génétique. Fait qu’ils ne survivraient pas à l’extérieur de la cellule.

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9
Q
  1. Quelles sont les bases de l’ARN?
    a. En quoi ces bases sont-elles différentes de l’ADN?
A

A, G, U, C

Uracile remplace la thymine
Ont une autre hydroxyle en 2’ en plus 3’

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10
Q
  1. Dans un génome, est-ce que les deux brins d’ADN peuvent servir de matrice pour la transcription des gènes?
A

Oui

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11
Q
  1. Quelle est l’orientation de la synthèse de l’ARN?

a. Dans la diapo. 26, quel est le brin matrice et quel est le brin codant?

A

Se fait toujours dans le sens 5’ - 3’

a.
Brin 3’ - 5’ : brin codant
Brin 5’ - 3’ : brin matrice

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12
Q

b. Sur le brin matrice, dans quelle orientation voyage la polymérase?

A

Voyage de 3’ vers 5’ pour qu’il soit synthétisé de 5’ vers 3’

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13
Q

c. À la séquence de quel brin correspond la séquence de l’ARNm?

A

Brin non-matrice - brin non-transcrit - brin codant

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14
Q

d. À quelle extrémité de l’ARNm la polymérase ajoute-t-elle le nouveau
ribonucléotide?

A

Allongement à l’extrémité 3’OH libre, ce qui fait que la synthèse progresse dans le sens 5’ vers 3’

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15
Q
  1. À quoi sert le promoteur d’un gène?
A

Permet de recruter un ARN pol et permet l’expression du gène en l’assoyant sur le gène

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16
Q
  1. Qu’arrive-t-il au pré-ARN dans les cellules eucaryotes?
A

Épissé dans le noyau pour retirer les introns pour le maturer, les introns sont excisés et les exons sont rabouttés.

17
Q

a. Comment un gène peut-il encoder différentes protéines?

A

Grâce à l’épissage produit différentes protéines à partir d’un gène.

18
Q
  1. Qu’est-ce qu’un codon?
A

Triplet de nucléotides qui code pour 1 ou plusieurs a.a. portés par un ARNt possédant anti-codon correspondant

19
Q
  1. Pourquoi dit-on que le code génétique est « dégénéré »?
A

Parce qu’il est redondant, plusieurs triplets composés de façon distinctes, séquences différentes peuvent coder pour un même a.a.

20
Q
  1. Quel type de mutation entraîne un décalage dans le cadre de lecture?

a. Quelle est la conséquence d’un cadre de lecture décalé pour la séquence d’une protéine?

A

Des additions ou des délétions

a. Toute la séquence d’a.a. sera traduite incorrectement à partir du nucléotide ajouté ou délétère, causant mauvais repliement.

21
Q

b. Combien de nucléotides faut-on insérer ou déléter pour ne pas affecter le cadre de lecture?

22
Q
  1. Est-ce que le codon AUG est le seul codon d’initiation possible lorsqu’on inspecte toutes les espèces vivantes?
A

Non, GUG et UUG

23
Q
  1. Qu’est-ce qu’un « cadre de lecture ouvert »?

a. Sur quel brin d’ADN pourrait-on retrouver un cadre de lecture ouvert? (codant ou matrice)?

A

Séquence dans ADN où un codon START est séparé d’un codon STOP par un nombre de nucléotides divisibles par 3. Un tel segment code potentiellement pour un polypeptide.

a. Les deux, mais quand ce l’est c’est sur le brin codant (non-matrice)

24
Q
  1. Quelle partie de l’ARN de transfert (ARNt) permet la reconnaissance du codon de l’ARNm?
    a. Quelle est l’orientation de l’ARNt par rapport à l’ARNm?
A

Loop anticodon complémentaire

a.
ARNt : 3’ vers 5’ pour anticodon
ARNm : 5’ vers 3’ pour codon

25
b. Quelle est la position « flottante » (« wobble ») dans l’anticodon?
b. Le 3e nucléotide de l'anticodon proche du 5' est variable puisqu'il a une certaine flexibilité dans le 5' pour accomoder les deux avec un certain pivotement, ce qui cause le caractère du code dégénéré. Permet de s'apparier 2 ou même 3 nucléotides différents.
26
c. À quelle position du codon de l’ARNm correspond la position flottante de l’anticodon? d. Quel est l’avantage de la position flottante de l’anticodon?
c. Le 3e nucléotide 3' du codon de l'ARNm d. 1 ARNt avec a.a. peut être utilisé pour la transcription de 2 codons différents, permet une économie dans les stocks d'ADN.
27
e. Comment reconnaît-on l’effet de la position flottante dans le code génétique? (indice : codons UUU et UUC pour Phe)
Les 2 premiers nucléotides d'un codon si pareilles, ex : UUA, UUG vont coder pour la traduction du même a.a. parce que le wobble se fait dans le dernier nucléotide et ça ne modifie pas l'a.a. de l'ARNt.
28
112. Dans quels types de génomes retrouve-t-on des exceptions au code génétique?
Certaines bactéries, archées, génome mitochondrial chez les eucaryotes simples
29
113. Connait-on des codes génétiques complètement alternatifs naturels?
Non, mais partiellement alternatif oui Naturellement → seulement des variantes partielles. Complètement alternatifs → créés artificiellement par la biologie de synthèse.
30
Avec quelle base se lie le 5-bromo-uracile?
Avec un G - va faire 3 liens - fait une transition
31
Durant la transcription, quel est le nom du brin sur lequel l'ARN pol se déplace en 3' vers 5' et le nom de l'autre, lequel est l'ARNm?
ARN pol sur le brin 3' vers 5' : Brin matrice Brin transcrit Brin non-codant 5' vers 3' : Brin non-matrice Brin non-transcrit Brin codant L'ARNm a la même séquence que le 5' vers 3' , le brin non-matrice, non-transcrit, codant