Quelles sont les trois ARN polymérases chez les eucaryotes et quels types d’ARN transcrivent-elles principalement?
ARN pol I (ARNr), ARN pol II (ARNm et autres petits ARN), et ARN pol III (ARNt, ARNr 5S).
Quelle ARN polymérase est responsable de la transcription des ARNr 28S, 18S et 5,8S?
L’ARN polymérase I.
Quelle ARN polymérase est responsable de la transcription des ARNt, de l’ARNr 5S et de l’ARN 7S (SRP)?
L’ARN polymérase III.
Quelle est la caractéristique structurale unique de la sous-unité RPB1 de l’ARN polymérase II eucaryote?
Elle possède une extension C-terminale appelée le domaine carboxy-terminal (CTD).
De quelle séquence d’heptapeptide le domaine carboxy-terminal (CTD) de l’ARN pol II est-il composé de répétitions en tandem?
Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser.
Quelles sont les deux fonctions principales du domaine carboxy-terminal (CTD) lorsqu’il est phosphorylé?
Il est responsable du passage de l’initiation à l’élongation et il recrute les facteurs de maturation des pré-ARNm.
Nommez les quatre séquences conservées que l’on peut trouver dans les promoteurs basaux utilisés par l’ARN pol II.
BRE (TFIIB recognition element), TATA, Inr (initiator), et DPE (downstream promoter element).
Quel est le rôle collectif des facteurs de transcription généraux (GTF) chez les eucaryotes, par analogie à la transcription procaryote?
Ils jouent collectivement le même rôle que la sous-unité $\sigma$ de E. coli.
À quelle position approximative la boîte TATA est-elle généralement située par rapport au site d’initiation de la transcription?
Elle est positionnée à environ -25 à -35 paires de bases en amont du site d’initiation.
Quel est le facteur de transcription général le plus grand, et le premier à interagir avec le promoteur?
Le facteur TFIID.
Le facteur TFIID est un complexe composé de la protéine _____ et de 13 facteurs associés appelés _____.
TBP (TATA binding protein) ; TAF (TBP associated factor).
Comment la protéine TBP (TATA-binding protein) se lie-t-elle à l’ADN au niveau de la boîte TATA?
Son domaine C-terminal se replie comme une selle autour de l’ADN, contacte le sillon mineur et induit un repliement local de l’ADN.
Quel est le premier facteur à se lier au promoteur pour initier l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription?
Le facteur TFIID, via sa sous-unité TBP qui reconnaît la boîte TATA.
Après la liaison de TFIID, quel facteur de transcription général se lie à l’ADN et à la TBP?
Le facteur TFIIB.
Après la liaison de TFIIB, quel complexe se lie au promoteur pour positionner l’ARN polymérase II au site d’initiation?
Un complexe formé de TFIIF et de la Polymérase II.
Quels sont les deux derniers facteurs généraux qui se lient pour compléter le complexe de pré-initiation?
Les facteurs TFIIE et TFIIH.
Quelles sont les trois activités enzymatiques importantes du facteur de transcription TFIIH?
ATPase (hydrolyse de l’ATP), hélicase (déroulement de l’ADN), et kinase (phosphorylation du CTD).
Quelle action de TFIIH permet le passage du complexe fermé au complexe ouvert lors de l’initiation de la transcription?
Son activité hélicase, qui déroule l’ADN au site d’initiation en utilisant l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP.
Quel événement, catalysé par TFIIH, permet à l’ARN polymérase II de s’échapper du promoteur et de commencer l’élongation?
La phosphorylation du domaine carboxy-terminal (CTD) de la polymérase.
Après le début de l’élongation, quel facteur de transcription général demeure typiquement lié à la boîte TATA?
La TBP (une sous-unité de TFIID).
Quel complexe protéique est capable de retirer temporairement un dimère H2A-H2B des nucléosomes pour faciliter le passage de l’ARN polymérase II?
Le complexe FACT (facilitates chromatin transcription).
Quel est le rôle du complexe Médiateur dans l’initiation de la transcription?
Il s’associe à l’ARN pol II et aux facteurs de transcription pour remodeler la chromatine et permettre l’accès au promoteur.
La phosphorylation de quels acides aminés spécifiques sur le CTD de Pol II régule le recrutement de différents facteurs?
La phosphorylation des sérines, des thréonines et des tyrosines dans la séquence répétée de l’heptapeptide.
Quand est-ce que la polymérisation de l’ARN par l’ARN Pol II s’arrête-t-elle généralement?
Elle se poursuit jusqu’à ce que la séquence dictant le clivage et la polyadénylation (signal poly-A) soit dépassée.
