Gen 4 Flashcards

(71 cards)

1
Q

Front;Back

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad är transkription?;Processen där DNA används som mall för att syntetisera RNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vilket enzym ansvarar för transkription i eukaryoter?;RNA-polymeras II för mRNA

A

RNA-polymeras I för rRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad är skillnaden mellan DNA-replikation och transkription?;Replikation kopierar hela genomet

A

transkription gör RNA-kopior av specifika gener.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vilka är de tre huvudfaserna i transkription?;Initiering

A

elongering

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad är en promotor?;DNA-sekvens framför genen där RNA-polymeras och transkriptionsfaktorer binder för att starta transkription.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad är TATA-boxen?;En promotorsekvens rik på T och A som underlättar bindning av transkriptionsfaktorer.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad gör RNA-polymeras II?;Transkriberar mRNA och många icke-kodande RNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad gör RNA-polymeras I?;Ansvarar för syntes av rRNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad gör RNA-polymeras III?;Ansvarar för syntes av tRNA och vissa små RNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vilken riktning syntetiseras RNA?;Alltid 5’→3’.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är generella transkriptionsfaktorer?;Proteiner som krävs för att RNA-polymeras II ska kunna initiera transkription.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är specifika transkriptionsfaktorer?;Proteiner som reglerar uttrycket av specifika gener genom att binda till enhancers eller silencers.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad är en enhancer?;Cis-regulatoriskt DNA-element som ökar transkription när en transkriptionsfaktor binder.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad är en silencer?;Cis-regulatoriskt DNA-element som minskar transkription när en repressor binder.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad är ett mediator-komplex?;Protein som förmedlar kontakt mellan specifika transkriptionsfaktorer och RNA-polymeras II.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad menas med cis-regulatoriska element?;DNA-sekvenser nära genen (promotor

A

enhancer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vad menas med trans-verkande faktorer?;Proteiner eller RNA som kan påverka gener på olika kromosomer.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hur påverkar kromatinstruktur transkription?;Eukromatin underlättar transkription

A

heterokromatin hämmar den.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad är en ko-aktivator?;Protein som underlättar transkriptionsfaktorers effekt utan att binda DNA direkt.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad är en ko-repressor?;Protein som hämmar transkription genom att interagera med transkriptionsfaktorer.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad är capping?;Addition av en modifierad guanin-nukleotid (7-methylguanosin) i 5’-änden av pre-mRNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vilken funktion har capping?;Skyddar RNA från nedbrytning

A

underlättar export från kärnan och initiering av translation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad är polyadenylering?;Addition av en poly(A)-svans till 3’-änden av pre-mRNA.

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Vilken funktion har poly(A)-svansen?;Stabiliserar mRNA och reglerar dess halveringstid och translation.
26
Vad är splicing?;Process där introner avlägsnas och exoner fogas ihop i pre-mRNA.
27
Vilket komplex utför splicing?;Spliceosomen
bestående av snRNA och proteiner.
28
Vad är alternativ splicing?;När olika kombinationer av exoner inkluderas i det mogna mRNA:t
vilket ger olika proteinprodukter från samma gen.
29
Varför är alternativ splicing viktigt?;Det ökar proteindiversiteten utan att antalet gener ökar.
30
Vad är snRNA?;Små nukleära RNA som deltar i splicing.
31
Vad är en lariatstruktur?;En loopform som bildas under splicing när intronen klipps ut.
32
Vad är mRNA?;RNA som bär den genetiska koden till ribosomen för proteinsyntes.
33
Vad är rRNA?;RNA som utgör den katalytiska och strukturella kärnan i ribosomen.
34
Vad är tRNA?;RNA som transporterar aminosyror till ribosomen under translation.
35
Vad är lncRNA?;Långa icke-kodande RNA som deltar i reglering av genuttryck.
36
Vad är miRNA?;MikroRNA som reglerar genuttryck genom att binda till mRNA och hindra translation eller främja nedbrytning.
37
Vad är siRNA?;Små interfererande RNA som kan tysta gener genom RNA-interferens.
38
Vad är piRNA?;Piwi-interacting RNA som reglerar transposoner i könsceller.
39
Vad är snoRNA?;Små nukleolära RNA som modifierar rRNA.
40
Vad är skillnaden mellan miRNA och siRNA?;Båda reglerar genuttryck posttranskriptionellt
men miRNA ofta partiell komplementaritet
41
Vad är XIST-RNA?;Ett lncRNA som täcker X-kromosomen och initierar X-inaktivering.
42
På vilka nivåer kan genuttryck regleras?;Transkriptionell
posttranskriptionell
43
Vad menas med posttranskriptionell reglering?;Reglering av genuttryck efter att RNA transkriberats
t.ex. via splicing eller miRNA.
44
Vad menas med RNA-editing?;När nukleotider i RNA förändras efter transkription
t.ex. A→I eller C→U.
45
Ge ett exempel på biologisk betydelse av RNA-editing.;Kan skapa proteinvarianter eller påverka RNA-stabilitet.
46
Vad är skillnaden mellan stabilt och instabilt mRNA?;Stabilt mRNA har lång halveringstid och kan ge mycket protein
instabilt bryts ner snabbt.
47
Hur bidrar RNA-binding proteins (RBP) till reglering?;De kan påverka splicing
transport
48
Vad menas med RNA-interferens?;Process där små RNA (miRNA
siRNA) tystar genuttryck genom att binda mRNA.
49
Vad menas med nonsense-mediated decay?;En kvalitetskontrollmekanism som bryter ner mRNA med för tidiga stoppkodon.
50
Vad menas med AU-rich elements (AREs)?;Sekvenser i 3’-UTR som reglerar mRNA-stabilitet.
51
Hur transporteras mRNA ut ur kärnan?;Genom kärnporer med hjälp av exportproteiner.
52
Förklara i detalj hur initiering av transkription sker i eukaryoter.;Generella transkriptionsfaktorer binder till promotorn (TATA-box)
TFIID känner igen TATA-boxen
53
Hur fungerar elongering under transkription?;RNA-polymeras rör sig längs DNA
öppnar dubbelhelixen
54
Hur avslutas transkription i eukaryoter?;RNA-polymeras transkriberar en terminatorsekvens
RNA klyvs nedströms poly(A)-signalen och polyadenylering sker.
55
Förklara mekanismen bakom spliceosomen och hur alternativ splicing bidrar till proteindiversitet.;snRNA i spliceosomen känner igen splicesites
introner tas bort som lariat
56
Hur kan mutationer i splice sites orsaka sjukdom?;Felaktig splicing kan ge onormala proteiner eller icke-funktionella mRNA.
57
Hur regleras transkription av kromatinmodifieringar?;Acetylering av histoner öppnar kromatin (aktivt)
deacetylering och metylering kan stänga det (inaktivt).
58
Förklara skillnaden mellan cis-reglering och trans-reglering.;Cis = DNA-element nära genen (enhancers
silencers)
59
Varför är alternativ splicing särskilt viktigt i nervsystemet?;Ger stor proteindiversitet som behövs för synaptisk funktion och komplexitet.
60
Hur kan lncRNA reglera genuttryck?;Genom att binda DNA
RNA eller proteiner och fungera som guider
61
Diskutera skillnaden mellan miRNA och siRNA i terapeutisk användning.;siRNA kan designas för att tysta specifika gener exakt
medan miRNA ofta reglerar nätverk av gener och kan vara svårare att kontrollera.
62
Hur kopplas XIST-RNA till epigenetiska modifieringar?;XIST täcker X-kromosomen och rekryterar histonmodifierande enzymer och DNA-metylering som stänger ner kromosomen.
63
Varför är RNA-processing nödvändig för eukaryot mRNA men inte för prokaryot mRNA?;Eukaryoter har introner som måste splicas bort och kräver capping/poly(A) för stabilitet och export
medan prokaryoters mRNA ofta används direkt.
64
Diskutera hur RNA-reglering kan bidra till sjukdomar som cancer.;Mutationer i miRNA-gener
felaktig splicing eller defekter i RBP kan ge okontrollerat genuttryck och bidra till cancer.
65
Förklara varför icke-kodande RNA bidrar till genkomplexitet hos eukaryoter.;De möjliggör reglering på många nivåer
vilket ökar komplexiteten utan fler gener.
66
Hur kan epigenetik och RNA-reglering samverka i genkontroll?;lncRNA kan rekrytera epigenetiska modifierare till DNA
vilket kopplar RNA och kromatinreglering.
67
Varför är nonsense-mediated decay en viktig kvalitetskontroll?;Förhindrar att felaktiga proteiner produceras från mRNA med tidiga stoppkodon.
68
Diskutera betydelsen av RNA-editing i evolution och sjukdom.;RNA-editing kan skapa proteindiversitet
men felaktig editing kan bidra till neurologiska sjukdomar och cancer.
69
Förklara varför miRNA ofta har partiell komplementaritet till mRNA och vilken konsekvens det får.;Det gör att miRNA kan reglera flera olika mRNA samtidigt
vilket ger bred genkontroll.
70
Hur kan transkriptionsfaktorer samverka synergistiskt?;Två eller fler faktorer binder olika element och förstärker varandras effekt på transkription.
71
Varför är spliceosomen ett exempel på ribozym-aktivitet?;snRNA i spliceosomen har katalytisk aktivitet som medverkar till splicing.