genomika Flashcards

(85 cards)

1
Q
  1. Rejony około centromerowe SA
A

b) ubogie w sekwencje kodujące

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q
  1. Wskaz technikę, która nie służy do analizy ekspresji genów
A

a) QTI

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q
  1. W oparciu o metody bionformatyczne możemy
A

d) wszystkie odp sa prawdziwe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q
  1. Drzewo filogenetyczne zakładające najmniejszą liczbe zmian nukleotydów lub aminokwasów potrzebnych do uzyskania wszystkich porównanych wariantów sekwencji jest wykreślane w oparciu o
A

a) zasadę parsymonii

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q
  1. Określeniem sekwencji genomu i jego organizacji zajmuje się
A

a) genomika strukturalna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q
  1. Mapę genetyczna można skonstruować w poparciu o
A

c) populacji segregującej np. (F2 , BC1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q
  1. Wielkość genomu A. thaliana
A

c) 125 milionów par zasad

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q
  1. Nieautonomiczny transpozon
A

c) może zostać mobilizowany in-trans

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q
  1. W technologii CHIP-DNA sondy są nanoszone na podłoże przez
A

c) fotolitografie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q
  1. Geny homologiczne obecne w genomach różnych gatunków pochodzące od wspólnego
    przodka nazywamy
A

b) ortologami

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q
  1. Żółty sygnał fluorescencyjny w określonym punkcie mikromacierzy DNA wskazuje ze sekwencja
    identyfikowana przez tam obecna sondę ulega ekspresji
A

c) w obu przypadkach

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q
  1. Liczba grup sprzężeniowych na mapie genetycznej powinna być
A

d) równa liczbie par chromosomów homologinczynch właściwej dla mapowania orgniazmu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q
  1. Transwersja to zamiana
A

b) pirymidyna na puryne i odwrotnie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q
  1. Genom A. thaliana zawiera około
A

c) 25 500 genów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q
  1. Markery SNP polegaja na identyfikacji
A

c) obeność mutacji punktowych

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q
  1. Identyfikacja mutacji punktowych w technice tilling jest możliwa w wyniku
A

d) trawienie heterodupleksów w rejonie braku homologii

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q
  1. Rejonem genomu jądrowego najczęściej wykorzystywane w filogenetyce molekluranej jest
A

a) rDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q
  1. W wyniku transpozycji retrotranspozonów dochodzi do
A

b) zwiększenia ilości kopii tych elementów genomie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q
  1. Transpozony sa wykorzystywane do
A

b) mutagenezy inercyjnej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q
  1. Włączenie konstytuwnego promotora (np. 35S) do konstruktu wykorzystywanego mutagenezie insercyjnej ma na celu
A

a) uzyskanie mutantów charakteryzujących się podwyższona ekspresja genów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q
  1. Podejście badawcze polegające na modyfikacji genu, a nastepnie analizie fenotypu mutanta
A

b) genetyka odwrotna (reverse genetics)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q
  1. Identyfikacja genów w oparciu o markery molekularne to:
A

a) mapowanie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q
  1. Sporządzenie mapy genetycznej jest możliwe dla:
A

a) segregujących populacji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
3. Do mapowania asocjacyjnego wykorzystuje się:
d) osobniki niespokrewnione
22
4. Warunkiem skuteczności wspomaganej markerami genetycznymi selekcji roślin odpornych jest:
c) ścisłe sprzężenie markera i genu odporności
23
5. Analiza QTL to:
b) identyfikacja rejonów genomu warunkujących cechy ilościowe
24
6. Liczba grup sprzężeń zidentyfikowanych podczas sporządzania mapy genetycznej dla gatunku diploidalnego powinna być:
b) równa liczbie chromosomów w gamecie
25
7. Segregacja markera dominującego w populacji DH powinna wyrażać się w stosunku:
b) 1:1
26
9. W systemie DArT (Diversity Array Technology) sondy stanowią:
a) reprezentacje genomowe dla gatunku
27
10. Wskaż nieprawidłowe stwierdzenie:
d) analizy QTL nie można przeprowadzić dla gatunków samopylnych
28
11. Selekcja genomowa (genome-wide selection, GWS):
c) fenotypowaniu i genotypowaniu
29
Sekwencjonowanie następnej generacji pozwala na
wysokowydajne sekwencjonowanie DNA
30
Przygotowanie DNA do sekwencjonowania NGS na platformie Illumina wymaga
ligacji adaptorów i PCRu mostkowego (bridge-PCR)
31
Uzyskanie przez jeden z genów paralogicznych nowej funkcji innej niż genu ancestralnego, nazywamy
subfunkcjonalizacją
32
W wyniku transpozycji retrotranspozonów dochodzi do
zwiększenia ilości kopii tych elementów genomie
33
Tasowanie egzonów (exon shuffling) to zjawisko spowodowane -
alternatywnym składaniem mRNA
34
Określeniem sekwencji genomu i jego organizacji zajmuje się -
genomika strukturalna
35
Te rejony NIE są złożone z sekwencji powtórzonych tandemowo –
promotorowe
36
Wskaż, technikę która nie służy do analizy ekspresji genów
DarT, QTI
37
Oparciu o metody bioinformatyczne analiza (in solico) możemy -
przewidzieć strukturę genu, przewidzieć funkcję kodowanego białka, zidentyfikować sekwencje pokrewne w innych organizmach
38
Podejście badawcze polegające na identyfikacji mutantów i ich analizie prowadzącej do wytypowania genu odpowiedzialnego za zmieniony fenotyp określamy jako
genetyka prosta (forward genetics)
38
Jednym z typów mutagenezy inercyjne jest
transposon tagging
39
Genom Arabidopsis thaliana zawiera około
25 500 genów
40
Autonomiczny transpozon
posiada funkcjonalną ORF kodującą transpozazę
41
Rejony okołocentromerowe są
bogate w sekwencje repetytywne, ubogie w sekwencje kodujące
42
Transpozony DNA są mobilizowane poprzez
fizyczne wycięcie i wstawienie w innym miejscu (cut-and-paste)
43
Markery SNP polegają na identyfikacji -
obecności mutacji punktowych
44
Włączenie konstytutywnego promotora 35S do konstruktu wykorzystywanego w mutagenezie insercyjnej ma na celu
uzyskanie mutantów charakteryzujących się podwyższona ekspresja genów
45
Wielkość genomu Arabidopsis thaliana to
125 milionów par zasad
46
Geny homologiczne obecne w tym samym genomie powstałe w wyniku duplikacji jednego genu nazywamy
paralogami
47
Oligonukleotydy stanowiące sondy są syntetyzowane bezpośrednio na podłożu w przypadku
mikromacierzy ink-jet i gene chips
48
Zachowanie podobnego liniowego układu genów na chromosomach lub w pewnych rejonach u różnych gatunków nazywamy
syntenią
49
Drzewo filogenetyczne zakładające najmniejszą liczbę zmian nukleotydów lub aminokwasów potrzebnych do uzyskania wszystkich porównywanych wariantów sekwencji
zasada parsyminii
50
Mapę genetyczną można skonstruować w oparciu o
populację segregującą (F2,BC1)
51
Nieautonomiczny transpozon
może zostać mobilizowany in-trans
52
W technologii CHIP-DNA sądy są nanoszone na podłoże
w procesie fotolitografii
53
Geny homologiczne obecne w genomie różnych pochodzące od wspólnego przodka nazywamy
ortologami
54
Żółty sygnał fluorescencyjny w określonym punkcie mikromacierzy DNA wskazuje, że sekwencja identyfikowana przez tam obecną sondę ulega ekspresji
w obu przypadkach
55
Liczba grup sprzężeniowych na mapie genetycznej powinna być
równa liczbie par chromosomów homologinczynch właściwej dla mapowania orgiazmu, równa liczbie chromosomów w gamecie
56
Transwersja to zamiana
zasada purynowa ulega zamianie na pirymidynową lub odwrotnie
57
Identyfikacja mutacji punktowych w technice tilling jest możliwa w wyniku
trawienie heterodupleksów w rejonie braku homologii
58
Rejonem genomu jądrowego najczęściej wykorzystywane w filogenetyce molekularnej jest
rDNA
59
Transpozony wykorzystywane są do
mutagenezy inercyjnej
60
Podejście badawcze polegające na modyfikacji genu, a następnie analizie fenotypu mutanta określamy jako -
genetyka odwrotna (reverse genetics)
61
Identyfikacja genów w oparciu o markery molekularne to
mapowanie
62
1. podejscie badawcze polegajce na identyfikacji mutantów i ich analizie prowadzacej do wytypowania genu odpowiedzialnego za zmiany fenotypowe okreslamy jako:
a. Genetyka prosta – forward
63
3. Autonomiczny transpozon:
c. Posiada funkcjonalną otwartą ramkę odczytu kodującą transpozazę
64
4. Rejony okołocentromerowe sa:
b. Bogate w sekwencje repetytywne
65
5. Ranspozony DNA są mobilizowane poprzez:
b. Fizyczne wycięcie i wstawienie w innym miejscu cut and paste
66
6. Markery SNP polegajace na identyfikacji:
c. Obecność mutacji punktowych
67
7. Włączenie konstytutywnego promotora np. 35S do konstraktu wykorzystywanego w mutagenzie insercyjnej ma na celu:
a. Uzyskanie mutantów charakteryzujących się podwyższoną ekspresją genów
68
8. Wielkosc genomu A.thaliana to:
c. 125 000 000
69
9. Geny homologiczne obecne w tym samym genomie, powstałe w wyniku duplikacji jednego genu nazywamy
a. Paralogi
70
10. Oligonukleotydy stanowiace sondy sa syntetyzowane bezposrednio a podłożu w przypadku:
c. Mikromacierzy ink-jet i gene chips
71
11. Zachowanie podobnego liniowego układu genów na chromosomach lub w pewnych ich rejonach u roznych gatunków nazywamyZ
a. Syntenia
72
12. Sekwencjowanie nastepnej generacji NSG nect genertaion sequencing oznzacza grupe technologii pozwalajaych na:
b. Wysokowydajne sekwencjonowanie DNA
73
13. Przygotowanie DNA do sekwencjonowania NGS na platformiwe illuminy wymaga:
d. Ligacja adaptorów i PCRu mostkowego
74
14. Uzyskanie przez jeden z genów paralogicznych nowej funkcji innej niz genu anestrlnego nazywamy
b. Neofunkcjonalizacja
75
15. W wyniku transpozycji retrotranspozonó dochodzi do
b. Zwiększenia liczby kopii tych elementów w genomie
76
16. Tasowanie egzonów - exon shuffling – to zjawisko spowodowane
c. Aktywnością transpozonów
77
17. Rejony ........... nie sa złozone z sekwencji powtórzonych tandemowe
c. Promotorowe
78
18. Wskaz technike która nie słuzy do analizy ekspresji genów:
a. DArT
79
19. W oparciu o metody bioinformatyczne – analiza in silico- mozemy:
d. Wszystkie odp są poprawne
80
20. Jedym z typów mutagenezy insercyjnej jest
c. Transpozon tagging