1
Q
V/F: les virus affectent tous les organismes?
A
vrai
2
Q
Quels caractéristiques du virus portent à croire que c’est vivant vs que ce ne les pas?
A
lorsqu’ils ne sont pas dans une cellule hôte:
-inerte (pas activité)
-absence de métabolisme
-> impression que ce n’est pas vivant
lorsqu’ils sont dans une cellule hôte:
-réactions et molécules caractéristiques des organismes vivants
3
Q
pourquoi est ce qu’il sont des parasites intracellulaires obligatoires?
A
seulement dans une cellules, ils:
monopolisent les activités cellulaires pour produire des particules virales
4
Q
c’est quoi l’unité infectueuse de base?
A
virion
5
Q
Est ce qu’un virion est une cellule?
A
non
6
Q
Quelle est l’origine des virus?
A
il n’a aucun gène commun
origine multiple
7
Q
Quels sont les constituants de base du virus?
A
-acide nucléique
-capside
-enveloppe (fréquente)
8
Q
Quelle est la différence entre les acides nulcéiques d’une cellule vs du virus?
A
cellule : ADNdb ou ARNsb
virus: ADNsb, ADNdb, ARNsb, ARNdb
9
Q
Comment est ce que le virus se réplique s’il ne peut pas produire de protéines?
A
le virus codent pour les enzymes viraux et sont produite par la cellule infectée
10
Q
Quelle est la taille de l’acide nucléique du virion?
A
de 4-1200 kb
1 gène = 1kb
11
Q
Les virus sont haploïdes ou diploïdes?
A
la plupart haploïdes: possède une seul copie de chaque gène
quelques uns sont diploïdes: 2 copies de chaque gène
12
Q
Pourquoi est ce que le génome des virus est autant compacte?
A
le génome est fragmenté :
les gènes se chevauchent
13
Q
Quel est le rôle de l’acide nucléique?
A
porter l’information génétique (protéines de structures, enzymes, reprogrammation cellulaire)
14
Q
De quoi est composée la capside et où est elle située?
A
structure protéique externe à l’acide nucléique
15
Q
C’est quoi la sous-unité de la capside?
A
des protomères s’assemblent pour former un capsomère
les capsomères s’assemblent pour former la capside
16
Q
Quelles sont les types de symétrie pour la capside?
A
-polyèdrale
-hélicoïdale
-binaire (la queue est un type et la tête l’autre)
17
Q
Quelle est la forme de la capside polyèdrale?
A
un icosaèdre qui a 20 côtés et qui a des sommets, arêtes et des faces
assemblage des capsomères (triangles)
18
Q
Quel est l’avantage des capsides polyèdrale?
A
elle augmente le rapport surface/volume
19
Q
Les capsides polyèdrale sont pour quelles tailles des virus?
A
taille variée
20
Q
Quelle est la forme de la capside hélicoidale?
A
un type de capsomère s’assemblent de façon hélicoidale autour de l’acide nucléique
en microscopie, on le voit comme un bâtonnet creux
21
Q
Quels exemples de virus ont une capside polyèdrale?
A
virus de la polimyélite
fièvre aphteuse
22
Q
quels exemples de virus ont une capside hélicoidale?
A
virus de la mosaïque du tabac
rage
oreillons
rougeole
SARS-Cov-2
bactériophage M13
23
Q
Quels virus ont une capside binaire?
A
exclusive aux bactériophages
-> tête polyèdrale et queue hélicoidale
24
Q
quel exemple de virus ont une capside binaire?
A
T paires (T2, T4, T6…) d’E coli
DT1 de streptococcus thermophilus
25
Quels sont les rôles de la capside?
-protection de l'acide nucléique
-attachement à la cellule cible via les protéines de la capside, fibres/spicules ou la queue
26
V/F : la capside est présente chez tous les virus?
vrai
27
où est située l'enveloppe?
à l'extérieur de la capside
28
De où provient l'enveloppe?
membrane cytoplasmique ou nucléaire de la cellules infectée
29
l'enveloppe est liée à quel mécanisme de la réplication?
mécanisme de sortie de la cellule hôte
30
L'enveloppe est fait de quoi?
-phospholipides
-protéines cellulaires
-glycoprotéines virales (péplomères)
31
Quels sont les glycoprotéines virales majeures de l'enveloppe?
1. hémagglutinine
-elle regroupe les hématies (glob rouges)
2. neuraminidase
-digère l'acide neuraminique
32
À quoi sert les glycoprotéines virales de l'enveloppe?
1. identifier un type de virus selon les H+N présents
2. pour un vaccin, on injecte les H+N du virus pour protéger contre une future infection
33
Est ce que SRAS-CoV2 possède une enveloppe est de quel type est sa capside?
oui, il a une enveloppe
capside est hélicoïdale
34
Quels sont les rôle de l'enveloppe?
1. protection
2. reconnaissance des récepteurs spécifiques sur la cellule hôte
3. pénétration/sortie de la cellule hôte
35
Comment est ce que l'enveloppe agit comme protection?
car l'hémagglutinine sert à masquer le virus quand il est en circulation
36
quelle est la glycoprotéines de l'enveloppe de SRAS-Cov2 ?
protéines S qui se lie au récepteur ACE2
37
V/F: les protéines internes de la capside sont présentes chez tous les virus?
faux,
chez plusieurs virus
38
Comment sont appelées les protéines internes de la capside?
nucléoprotéines,
elles sont associées aux acides nucléiques
39
Est ce que les nucléoprotéines ont une origine virale?
oui,
Elles sont codées par le génome du virus lui-même.
40
Quels sont les rôles des nucléoprotéines?
1. neutralise l'acide nucléique pour faciliter son empaquetage
2. enzymes qui font la réplication et la lecture de l'acide nucléique viral de façon précoce
41
Comment est ce que les nucléoprotéines aident à la réplication/lecture de l'acide nucléique?
course entre l'infection du virus et les systèmes de blocage de la bactérie
production d'enzymes qui font ces rôle de façon précoce pour être le plus rapide
-ARN polymérase ARN dépendante
-ADN polymérase ARN dépendante
-transcriptase inverse
42
de quoi est formé la nucléocapside?
-acide nucléique
-capside
-nucléoprotéines
43
Quelle est la taille des virus?
10-400nm
44
Quelle est une exception de la taille des virus?
virus géant: mimivirus qui imitent les bactéries
-1000 nm
45
Pourquoi est ce que la réplication est un processus différent de la reproduction?
réplication:
-pas de croissance
-production de copies
46
Quelles sont les étapes au cycle viral?
1. adsorption à la surface de la cellule
2. pénétration de la cellule infectée
3. réplication des constituants viraux
4. assemblage des constituants viraux
5. sortie du virus
47
Comment se fait l'adsoprtion d'un virus à la surface de la cellule?
1. reconnaissance:
-réversible
-collision au hasard
-forces électrostatiques favorisent le contact du virus à la cellule
2. attachement : irréversible
-complémentarité virus à un récepteur spécifique au virus
48
Chez le virus λ, VIH, la rage et SARS-Cov2 quels sont leurs récepteurs spécifiques?
λ: LamB
VIH: CD4/CCR5
Rage: récepteur d'acétylcholine
SARS-Cov2: ACE2
49
Quels virus ont des mécanismes d'adsorption à la surface de la cellule différents?
virus des plantes:
-absence de récepteurs connus
injection du virus par:
-piqûre d'insecte ou abraison mécanique (les 2 étapes sont fusionnées)
50
Comment est ce que les bactériophages pénètrent dans la cellule?
le bactériophage "s'assit" sur la cellule et la queue pénètre la cellule et permet de propulser dans la cellule l'acide nucléique tandis que la capside reste à l'extérieur
51
Comment est ce que les virus animaux pénètrent dans la cellule?
1. fusion directe : virus enveloppés
-enveloppe fusionne avec la membrane cytoplasmique de la cellule hôte et la nucléocapside est libérée
2. endocytose (viropexie) : virus enveloppés
-l'enveloppe se lie aux récepteurs de la
-endocytose
3. endocytose (viropexie) : virus nus
-la capside se lie aux récepteurs
-endocytose
52
qu'arrive-t'il au virus une fois dans la cellule lors de la pénétration?
-libération de la nucléocapside
-décapsidation -> libère l'acide nucléique dans le cytoplasme ou au noyau (selon le système de réplication)
53
Quand est ce que le virion devient absent en microscopie électronique?
lorsque la capside se désagrège et c'est le début de la phase d'éclipse
54
Comment se produit la réplication des constituants viraux?
1. événements précoces
-production d'enzymes de réplication ou de lecture
-quantité en acides nucléiques augmente
2. événements tardifs
-production des protéines de structure pour refaire la capside : capsomères, glycoprotéines d'enveloppe, protéines de queue, enzymes de lyse
55
Comment se fait l'assemblage des constituants viraux?
encapsidation:
1. capsides polyèdrale:
-interaction capsomères-acide nucléique
-fermeture de la capside
2. capside hélicoidale
-interaction capsomères-acide nucléique
-empilement hélicoïdal
3. binaire
-la queue et la tête font des assemblages indépendants
56
Quand est la fin de la phase d'éclipse?
quand l'assemblage de la capside commence
57
Combien de temps dure la phase d'éclipse chez les virus animaux et chez les phages?
virus animaux: 1-10 heures
phages: quelques minutes
58
Comment se fait la sortie des virus de la cellule?
1. lyse cellulaire
-pour les virus nus
-provoque la mort
2. bourgeonnement
-pour les virus enveloppés (emporte avec eux une partie de la membrane)
-survie de la cellule
3. canaux cellulaires
-pour les virus à réplication nucléaire
-survie de la cellule
59
Combien de virus sont produit par cellule?
10^3 à 10^6
T paires: 10^2 à 10^3
car: dans un seul cycle viral, la réplication et l'assemblage est fait plusieurs fois, permettant de faire plusieurs virus en 1 cycle
phage: 1 10^2 10^4 10^6
60
Selon quoi se fait la classification?
-type d'acide nucléique
-présence d'enveloppe
-processus de réplication des acides nucléiques
-taille
-nombre de capsomères
-propriétés immunologiques
-nombres de gènes/carte génomique
-site de réplication, tissus ou l'hôte
61
Comment est ce que le type d'acide nucléique est utilisé pour la classification?
selon :
ADNsb
ADNdb
ARNsb
ARNdb
62
Comment est ce qu'on peut détecter la présence d'enveloppe?
parfois on peut voir en microscopie
sinon, on teste la sensibilité au chloroforme
chloroforme élimine l'enveloppe, un virus qui avait une enveloppe n'est plus infectueux
63
Quelle nomenclature est utilisée?
nomenclature linéenne
l'ordre a comme suffixe virales
la famille a comme suffixe viridae
64
Que veux dire cest virus: Picornavirus, hepadnavirus, tobamovirus, arbovirus, coronavirus?
picornavirus:
-pico: très petite, rna: virus ARN
hepadnavirus:
-hepa: foie, dna: virus ADN
Tobamovirus:
-toba: tabac, mo: mosaique
Arbovirus:
-arthropod-borne virus (virus transmis par des arthropodes)
coronavirus:
-corona: couronne (forme)
65
Comment est ce qu'on fait la croissance de bactériophage en culture?
on utilise des cellules bactériennes vivantes sensibles à l'infection qui sont en multiplication (métabolisme actif: phase latence ou expo)
-formation de plages de lyse dispersée car les cellules qui n'ont pas leur métabolisme actif, les virus ne peut pas les infectées
66
Comment est ce qu'on fait la croissance de virus animaux?
on utilise des oeufs embryonnés de poulet. L'embryon possède des cellules métaboliquement actives et donc permet de produire une grande quantité de virions
67
Comment est produit le vaccin de l'influenza?
en utilisant des oeufs embryonnés de poulet
on utilise les glycoprotéines de l'enveloppe (H et N) pour identifier les souches
certaines personnes allergiques aux protéines de l’œuf peuvent réagir
68
Comment est ce qu'on fait la croissance des virus animaux plus fastidieux?
culture de tissu: on fait pousser des cellules dans un milieu pour permettre la croissance des virus
propagation des virions, ce qui cause des effets cytopathiques caractéristiques des cellules:
-changement de forme (arrondie)
- ↑ ou ↓ de volume
-agrégation
-corps d'inclusion
-lyse
-formation de syncitia (membrane cyto fusionnent, une cellule avec plusieurs noyaux)
69
Comment est ce qu'on fait la croissance des virus animaux les plus exigents?
on utilise des cellules très spécifiques au virus
ex: cellules de rein de singe utilisée pour le virus Polio et a servit à établir le vaccin Salk
70
Quelles sont les méthodes d’identification des virus?
1. microscopie électronique
-capside, enveloppe site de réplication
2. immunofluorescence
-réaction avec des anticorps spécifiques
3. infections expérimentales
4. séquence de l'acide nucléique
-> demande du temps et $
71
Quelle est l'origine des virus?
une des hypothèse:
-multiples ADN égoïstes (qui veux juste se répliquer) se seraient spécialisés
-ces éléments pouvaient s'autopropager
-ils ont aquis des gènes pour la capside
72
Pourquoi est ce que le virus évoluent rapidement?
car ces polymérases font beaucoup d'erreurs et induisent des mutations dans le génome
-> évolution rapide
pour cette raison que le VIH a une variation intrapatient (chaque patient a bcp d'espèces différentes)
73
Dans quel environnement sont retrouvés les virus?
océans: 10^6 - 10^9 virion/ml
les virus joue un rôle dans les cycle C et N (en lysant les cellules) et fournissent des sources de nutriments
74
V/F: les virus sont les entités biologiques les plus abondantes?
vrai
5% biomasse
94% abondance
75
Quelles sont les fonctions écologiques des virus?
1. contrôle des populations
-dans un habitat très abondant en une espèce, un infection fait la chute massive de la population
2. court-circuit des cycles de la matière organique
-ils accélèrent les cycles en lysant les cellules et libérant des nutriments
76
Quelles sont les fonctions des virus sur les humains?
-8% du génome provient d'ADN de rétrovirus endogènes (présents dans le génome d'Homo neanderthalis -> évolution)
les fragments de rétrovirus ont un effet sur la santé et le développement (ex: régulation d'hormones)
77
Quels sont les agents infectueux acellulaires?
-virus
-viroïdes
-virusoïdes - ARN satellites
-virophages
-prions
78
Qu'est ce que les viroïdes infectent?
ils sont phytopathogènes
-infecte juste les plantes
pour les pommes de terre:
-indice de l'infection: formation de tubercules en fuseaux sur la pomme de terre
79
Comment est l'acide nucléique des viroïdes?
-ARNsb circulaire (certains linéaires
-359 nucléotides
-10 fois plus petit que le génome viral
80
Pourquoi est ce que les viroïdes sont des organismes simples?
1. pas d'intermédiaire sous forme d'ADN
2. aucun gène qui code pour des protéines -> pas de capside
3. Réplication via les enzymes de l’hôte au noyau
81
Comment est ce que le viroïde peut infecter malgré sa simplicité?
il y a une accumulation massive d'ARN dans le cytoplasme, ce qui cause une interférence (interaction avec ARN de la plante) dans la régulation génétique
82
Quelles sont les voies de transmission des viroïdes?
-cellule/cellule
-pollen
-abraison
-> permet la transmission car le viroïde ne peut pas être longtemps dans l'environnement car l'ARNsb est fragile
83
Comment sont aussi appelés les virusoïdes?
virus ou ARN satellites
84
Comment est ce que les virusoïdes peuvent infecter?
ils nécessitent des virus auxiliaires pour qu'ils fournissent les protéines de la capside et/ou l'enveloppe
85
Comment est ce que le virusoïde de l'hépatite D fonctionne?
hépatite D: virusoïde avec de l'ARNsb de 1700 nucléotides
-réplication par les enzymes de l'hôte
-activité ribozyme de héptatite D sert que l'ARN s'autocatalyse
-hépatite D code pour la protéine δ
essentielle pour l'assemblage
-utilise le virus auxiliaire: hépatite B pour les protéines de la capside/enveloppe
86
Quelles sont les majeures diff.rence entre le viroïde et le virusoïde?
viroïde:
-code pas pour des protéines
-ne nécessite pas des auxilaires
87
Les virophages infectent quoi?
d'autres virus
88
C'est quoi un mégavirus?
un virus qui se fait infecté par un autre virus
89
Exemple d'un virophage qui infecte?
-Sputnik infecte les mégavirus mimivirus/mamavirus
-utilise les enzymes du mégavirus pour faciliter la réplication
-il intègre le génome du mégavirus, ce qui diminue l’efficacité de réplication du mégavirus
90
Carctéristiques des prions
-pathogènes animaux (majorité)
-pas d'intermédiaire ADN ou ARN
-pas de capside
-taille de 250 aa: 100 fois plus petit qu'un virus
91
Est ce qu'un prion est un organisme?
non,
c'est une protéine infectueuse
92
Comment est ce qu'un prion infecte?
un prion se réplique en modifiant une protéine cellulaire (PrPc)
PrPsc = prion (protéine altérée)
PrPsc + PrPc = 2 PrPsc (le prion induit un changement de conformation de la protéine cellulaire)
-> réplication par modification d’une protéine
-les PrPsc s'accumulent, se polymérisent en matériel fibreux et dérègle les activités cellulaires
93
Comment peut-on inactiver l'action d'un prion?
il résiste des heures à l'autoclave à 121°C , protéases et UV
-> autoclave à 134°C pendant 18 minutes pour changer la conformation du prion (la protéine n'est pas détruite)
94
Quelles pathologies d'autres animaux sont causés par les prions?
-tremblante du mouton
-encéphalopathie spongiforme bovine
-encéphalopathie contagieuse du vison
-maladie du dépérissement chronique des cervidés
95
Quelle pathologies humaines sont causées par les prions ?
maladies dégénératives du SNC
-Kuru
-syndrome de Creutzfeld-jokob
-insomnie familiale fatale
-syndrome de alpers
-maladie de gerstmann-straüssler-scheinker
96
Comment sont transmises les maladies des prions?
-transmission par ingestion (du SNC d'un autre individu)
-transmission génétique
-mutation spontannée
97
Comment peut-on se protéger des maladies causées par les prions?
difficile à traiter car le prion est immunogène car PrPc fait partie du soi (non reconnu par le système immunitaire)
-Prophylaxie: éviter l’exposition aux prions
-Thérapie: aucun
-vaccin: ne fonctionne pas car il est immunogène
microbiologie
flashcards
Decks in class (11)
# Cards
-
historique microbio72
-
microscope124
-
morphologie structures de cellules bactériennes186
-
nutrition et culture des cellules bactériennes147
-
croissance et divisions des cellules bactériennes74
-
caractérisation et classification des microorganismes79
-
archées43
-
mycètes66
-
protistologie74
-
virologie97
-
microbiote28
