Cours 6 Flashcards

(43 cards)

1
Q

Mutation def

A

Changement transmissible dans le matériel génétique

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2
Q

Mutation génétique def

A

Mutations qui se produisent à l’intérieur de gènes individuels (touche seulement un gène à la fois)

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3
Q

Mutation chromosomique def

A

Changements qui affectent des chromosomes enteirs ou des grandes parties de ceux-ci (touche plusieurs gènes)

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4
Q

Types de mutations au niveau de l’ADN

A
  • Substitutions
  • Indels
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Q

Mutation par substitution def

A

Remplacement d’une paire de nucléotide par une autre

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6
Q

Types de substitutions au niveau de l’ADN

A
  • Transition; purine remplacée par purine et pyrimidine par pyrimidine (A-G et C-T)
  • Transversion; purine remplacée par pyrimidine et contraire (A-T et T-G et G-C et C-A)
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7
Q

Mutation par indels def

A

Insertions ou délétions. Quand une ou plusieurs paires de nucléotides sont ajoutées ou enlevées à la séquence originale

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8
Q

Types de mutations au niveau protéique

A
  • Substitutions
  • Indels
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9
Q

Types de substitutions au niveau protéique

A
  • Mutation silencieuse (triplet muté code pour le même acide aminé)
  • Mutation faux-sens (triplet muté code pour un acide aminé différent)
  • Mutation non-sens (triplet muté est un codon stop)
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10
Q

Mutation faux-sens types

A
  • Conservatrice; le nouveau codon spécifie un acide aminé similaire à l’ancien (ex; polarité)
  • Non-conservatrice; le nouveau codon spécifie un acide aminé dissemblable
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11
Q

Indels au niveau protéique possibilités

A
  • Ajout/perte d’un acide aminé si multiple de 3 nucléotides
  • Changement du cadre de lecture si pas multiple de 3 (donc changment de tous les acides aminés à partir du point d’ins/del. Potentiel pour un codon stop illégitime)
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12
Q

Particularité de mutations dans des régions régulatrices

A

Certaines peuvent avoir des conséquences très importantes modifiant l’expression des gènes (et non leur structure)

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13
Q

Quels types de régions pourraient subir des mutations et causer des effets fonctionnels?

A
  • Régions promotrices, amplificateurs, silenceurs
  • Sites d’épissage dans les jonctions introns/exons
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14
Q

Types de réversion et leur def

A
  • Réversion vraie = restaure le codon original
  • Réversion équivalente = restqure un codon différent pour le même acide aminé ou un codon pour un acide aminé synonyme
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15
Q

Suppression def

A

Mutation différente de la première, qui ramène au phénotype original

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16
Q

Types de suppression et leur def

A
  • Extragénique = mutation dans un gène différent
  • Intragénique = mutation dans le même gène, mais à un endroit différent
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17
Q

Pourquoi plus difficile d’identifier une suppression intragénique que extragénique?

A

Car elle est liée à la mutation originale

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18
Q

Tautomères def

A

Formes chimiques interconvertibles (à l’équilibre, une structure prédomine généralement sur l’autre). Mêmes atomes, mais les liens chimiques changent
Appariment normal; C:G et T:A
Tautomères; C:A T:G C:A T:G*

19
Q

Tautomères associés à quel type de mutation?

A

Transition. Car les bases sont mésappariées, mais restent quand même avec une base complémentaire

20
Q

Sources de mutations et les dommages qu’ils peuvent faire à l’ADN

A
  • Formation de sites apuriniques peut mener à incorporation d’une base erronée
  • Lésions oxydatives peuvent mener à arrêt de la réplication d’ADN OU transversion
  • Déamination de la cytosine (C transformé en U) peut mener à une transition (C/G en T/A)
21
Q

Régions répétées en tandem sont plus à risque de mutations de type indel pourquoi?

A

Car puisuqe plusieurs répétitions, possible pour la cellule de manquer une lettre, ce qui cause une addition ou délétion

22
Q

Mutations induites causes et types de mutations causées

A
  • Agents mutagènes (transition)
  • Agents alkylants (transition)
  • Agents intercalants (indels)
  • Rayons UV (plusieurs différentes possibilités)
23
Q

Test d’Ames objectif

A

Détecter le pouvoir mutagénique d’un composé chimique (détecter les composés mutagènes)

24
Q

Test d’Ames sur quel organisme pratiqué?

A

Cultures de bactéries auxotrophes

25
Test d'Ames protocole
1. Mutagène + extrait de foie de rat dans culture bactérienne (et on fait un témoin sans mutagène) 2. Dépose dans pétri sans his 3. Incubation. Ensuite, témoin nous donne le taux de réversion spontanée alors que résultat avec mutagène donne les mutations de type révertant ou suppresseur
26
À quoi sert le foie de rat dans le test d'Ames?
Permet d'imiter les conditions métaboliques du foie, car parfois c'est le métabolisme qui cause un produit mutagène
27
Transposition def
Désigne le déplacement d'une séquence d'ADN en un nouveau site dans le génome sans qu'il n'y ait aucun lien de séquence avec le locus cible
28
Modes de transposition
- Transposition réplicative (copier-coller) - Transposition conservative (couper coller)
29
Transposition réplicative def
L'élément transposable est dupliqué et c'Est une copie qui est insérée dans l'ADN cible. Le nobre de copies/génome du transposon peut ainsi augmenter
30
Transposition conservative def
L'élément transposable se déplace d'un site à l'autre
31
Types de transposons chez les procaryotes
- Transposon composite - Transposon simple
32
Transposon composite structure
Flanqué par 2 longues séquences répétées inversées. Contient d'autres gènes (résistance, virulence, etc.)
33
Transposon simple structure
Transposase + résolvase et autres gènes. Flanqués par 2 courtes séquences répétées inversées
34
Pourquoi les gènes dans les transposons des procaryotes sont problématiques dans le domaine de la santé et agro-alimentaire?
Car transfert latéral de résistance antibiotique (très facile et rapide)
35
Types de transposons chez les eucaryotes
- Classe I; éléments mobiles à transposition réplicative impliquant un intermédiaire d'ARN (rétrotransposons) dont certains sont apparentés aux rétrovirus - Classe II; transposons d'ADN. Éléments mobiles similaires aux transposons des bactéries (conservatifs ou réplicatifs)
36
Dysgénèse hybride (chez la drossophile) def
Phénomène causé par la transposition des éléments P entre les lignées sauvages et lignées élevées en labo. Découverte transposons de classe 2
37
Classe de transposons la plus abondante dans le génome humain
Rétrotransposons
38
Origine des rétrotransposons
Vestige de rétrovirus
39
Différence entre rétrovirus et rétrotransposons
Rétrotransposons ont pas le gène env (qui encode pour la protéine de l'enveloppe virale)
40
Similarité entre rétrovirus et rétrotransposons
Les 2 sont des séquences de gènes avec des LTR qui les flanquent
41
Quelle expérience chez la levure a permis de conclure que les éléments mobiles Ty étaient des rétrotransposons et devaient passer par un intermédiaire d’ARN pour permettre la transposition?
Élément Ty avec intron inséré par manipulation génétique. Après la transposition, l'élément est dépourvu de l'intron (a subi l'épissage)
42
Utilités des transposons en biotechnologie
1. Agents mutagènes (outil pour créer des mutations aléatoires) ex; transposons chez les bactéries ou la levure 2. Vecteur de génie génétique dna sle but d'introduire des gènes étrangers dans un organisme. Ex; élément P chez la drosophile, rétrovirus pour cellules animales
43
Quelle fraction du génome humain est composé d’éléments transposables?
45%