DNA-damage

Question 1

Vad är en intrastrand crosslink och varför är den skadlig för cellen?

Answer 1

En intrastrand crosslink är en kovalent bindning mellan två baser i samma DNA-sträng, vilket förvränger DNA-helixen och blockerar både DNA- och RNA-polymerasers framfart vid replikation och transkription.

Ex: Tymin-dimer

Question 2

Vad är deaminering och hur kan den leda till mutationer?

Answer 2

Deaminering är borttagning av en aminogrupp från en bas,

Exempelvis cytosin till uracil eller 5-metylcytosin till tymin, vilket kan leda till felaktig basparning och C→T-mutationer efter replikation.

Question 3

Varför är deaminering av 5-metylcytosin särskilt mutationsfarlig?

Answer 3

Deaminering av 5-metylcytosin ger tymin, som är en normal DNA-bas och därför svår att känna igen som skada, vilket gör CpG-områden till mutationshotspots.

Question 4

Vad är oxidativ DNA-skada och vilken mutation kan den orsaka?

Answer 4

Oxidativ DNA-skada orsakas av reaktiva syreföreningar (ROS), exempelvis bildning av 8-oxo-guanin, som kan felpara med adenin och ge G→T-transversioner vid replikation.

Question 5

Vad är alkylering av DNA och varför är det skadligt?

Answer 5

Alkylering är tillägg av alkylgrupper till DNA-baser, vilket kan störa korrekt basparning eller blockera DNA- och RNA-polymeraser, och därmed leda till mutationsbildning eller stoppad genexpression.

Question 6

Varför är frameshift-mutationer oftast mer skadliga än missense-mutationer?

Answer 6

Frameshift förändrar läsramen, vilket gör att alla efterföljande kodon ändras. Det leder till kraftigt förändrad aminosyrasekvens och ofta tidigt stoppkodon.

Question 7

Varför kan en nonsense-mutation ge ett allvarligare proteinfel än en missense-mutation?

Answer 7

Nonsense-mutationer skapar ett stoppkodon som avbryter translationen i förtid, vilket ger ett trunkerat och oftast icke-funktionellt protein.

Question 8

Vad avgör om en punktmutation blir silent, missense eller nonsense?

Answer 8

Vilket kodon som påverkas och hur det nya kodonet tolkas av den genetiska koden: samma aminosyra, annan aminosyra eller stoppkodon.

Question 9

Varför är transitioner vanligare än transversioner?

Answer 9

Transitioner innebär byte mellan baser av samma typ vilket ger mindre strukturell störning i DNA och uppstår lättare vid replikationsfel.

Question 10

Varför är interstrand crosslinks särskilt farliga för cellen?

Answer 10

De kovalent binder samman de två DNA-strängarna, vilket förhindrar strängseparation och stoppar både replikation och transkription

Ex: tymin-dimer

Question 11

Varför är dubbelsträngsbrott farligare än enkelsträngsbrott?

Answer 11

Båda fosfodiesterbindningarna bryts, vilket gör att det saknas en intakt mall och risken för kromosomala omarrangemang ökar kraftigt.

Question 12

Vad definierar silent mutation?

Answer 12

En bas förändras men kodar fortfarande för samma aminosyra, så proteinets aminosyrasekvens ändras inte.

Question 13

Vad definierar Missense mutationer?

Answer 13

En bas förändras så att en annan aminosyra kodas in i proteinet

Question 14

Gissa dem olika DNA skadorna från vänster till höger.

Answer 14

• Modifierad bas (kan lagas av BER)/Mismatchad basparning (kan lagas av MMR)
• Enkelsträngsbrott (lagas av BER)
• Dubbelsträngsbrott (lagas via Homolog rekombination)
• Pyrimidine dimer = lagas av NER
• ICL

Question 15

Hur bildas ICL skador?

Answer 15

Bildas av kemiska agens som kovalent binder ihop båda DNA-strängarna, till exempel:

• Cytostatika, formaldehyd, acetaldhyd

Question 16

Vilken typ av mutation ger upphov till Cystisk fibros?

Answer 16

• In-frame deletion av tre nukleotider
• Detta gör att Fenylalanin saknas

Question 17

Vilka är dem tre STOPP-kodonen i DNA och hur översätts dem till mRNA?

Answer 17

• TAA → UAA

• TAG → UAG

• TGA → UGA

Question 18

Vad är depurinering?

Answer 18

Depurinering = en spontan skada där en purinbas hydrolyseras bort från deoxyribos, så att bara socker‑fosfat-ryggraden finns kvar men utan bas på den platsen (en så kallad abasic site)

Kan störa replikation/translation