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Hérédité traduction Flashcards

(40 cards)

Study These Flashcards
1
Q

AUG code

A

méthionine initiation traduction avec section Kozac

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Q

Définition d ’un codon

A

Un codon = 3 nucléotides qui codent pour 1 ac. Aminé
Parfois plusieurs codon code pour un acide aminé

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3
Q

Le code génétique Ses propriétés

A
  • Code non chevauchant
    -Trois cadres de lectures
    -Lecture des codons de 5 ’ vers 3 ’
    -Code génétique est « Universel » -
    -Code génétique est dégénéré sauf pour Trp et Met
    -Ponctuation du code génétique
    -Les 2 premiers nucléotides suffisent à préciser un aa
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4
Q

Les codons avec une pyrimidine en position 2 codent généralement pour

A

des aa hydrophobes

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5
Q

Traduction Molécules mises en jeux

A
  • ARNm
  • ARNt
  • Aminoacyl-ARNt synthétase
  • Ribosomes
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6
Q

ARNt nombre et rôle

A
  • Nombre: au moins 20 différents
  • Rôle = interprète
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7
Q

ARNt structure

A

soit 2D soit 3D

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8
Q

ARNt Structure 2D

A
  • 73-95 nucléotides
  • Lobe D, lobe TfC
  • Tige acceptrice en 3 ’: CCA (on attache avec liaison ester acide aminé)
  • Anticodon
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9
Q

ARNt Structure 3D

A

Région apparié vont se twister en 3D
- forme en L
- Structure très stable
- base flottante (Wobble)

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10
Q

ARNt isoaccepteurs c’est quoi

A

Différents ARNt qui fixe un même aa

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11
Q

Aminoacyl-ARNt synthétase rôle

A

catalyse l ’addition d ’un aa à la molécule d ’ARNt
- Reconnaît son aa spécifique
- Puis l’active
- Lie l’aa activé à son ARNt

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12
Q

Activation en 2 étapes Aminoacyl-ARNt

A

1- Activation de l ’aa
-aa + ATP -> amino acyl-adénylate + PPi
2- Formation de l ’amino acyl-ARNt
-amino acyl-adénylate + ARNt -> 3 ’aminoacyl-ARNt + AMP

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13
Q

Correction d ’erreurs par

A

l ’aminoacyl-ARNt synthétases
Un seul aminoacyl-ARNt synthétase pour chaque aa, même si plusieurs ARNt isoaccepteurs

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14
Q

Nombre de ribosomes E-Coli vs eucaryote

A
  • E.coli: 20 000/cell
  • Eucaryote:2 300 000/cell
    Procaryote(70s) vs Eucaryote (80s)
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15
Q

Polyribosome (polysome)->

A

traduit par plusieurs ribosome

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16
Q

Structure d ’un ribosome

A
  • tunnel dans la grosse sous-unité
  • Ribosomes des mito et chloroplastes similaires ou procaryotes
  • Toujours 2 sous unités
  • Ribonucléoprotéines tjr associé à protéine (+ pour grosse unité)
  • on voit au niveau intime du ribosome qu’il y a un site A, P et E
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17
Q

Site sur le ribosome

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A

Site P-> ancrage de la chaîne polypeptidique naissante
Site A-> entrée de l ’ARNt-aminoacylée
Site E-> EXIT

18
Q

Les étapes de la traduction

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A
  • Initiation de la traduction
  • Élongation de la traduction-
  • Terminaison de la traduction-
19
Q

Initiation sous-étape

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A
  • ARNt initiateur
  • Les facteurs d ’initiation
  • Respect du cadre de lecture
  • Processus de l ’initiation de la traduction
20
Q

ARNt initiateur-> chez les eucaryote

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A

ARNt met, Remarque : une seule aminoacyl ARNt synthétase pour les deux types ARNtmet

20
Q

ARNt initiateur-> chez les procaryotes

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A

La méthionine peut ainsi être chargée à la fois par l’ARNt.Met (N-formylation) et l’ARNt.fMet (ajout du groupe formyl par la méthionyl-ARNtfMet formyltransférase ), mais seule la méthionine chargée sur l’ARNt.fMet sera formylée par la transformylase.

21
Q

Les facteurs d ’initiation de la traduction->
Chez les eucaryotes

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A
  • eIF1-8 (il y en a 8)
22
Q

Les facteurs d ’initiation de la traduction->
Chez les procaryote

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A
  • IF1
  • IF2 :
  • IF3 :
23
Q

IF1

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A

s ’attache à la sous-unité 30 S et amplifie les effets de IF 2 et IF3

24
IF2
sélectionne l ’ARNti et repousse les autres aminoacyl-ARNt et porte un site fixateur pour le GTP
25
IF3
se fixe à la petite sous-unité ribosomique et empêche la fixation de la grosse sous-unité et aligne fMet-ARNtmet sur le site P
26
Respect du cadre de lecture Procaryote
séquence de Shine-Dalgarno va reconnaitre séquence de shine et une fois qu'il la sport il sait que le premier AUG qu'on trouve on va commencer
27
Respect du cadre de lecture eucaryote
structure secondaire de l ’ARNm
28
Processus Initiation de la traduction chez le procaryote
1- Petite sous cette unité on fixe IF1 et IF3 2- IF2 va aller chercher amino-acide ARNt, va chercher de manière spécifique meth formyler et va fixer sur le site P 4- Une fois anticodon de ARNt avec codon de ARNm changement de conformation qui va hydrolyser le GTP et GDP 5- alors GDP, IF1, IF3, If2 s'échappe et la grosse unité va pouvoir embraquer et coincé ARNm et l'initiation est terminé on part dans l’élongation
29
Processus Initiation de la traduction chez l'eucaryote
similaire à procaryote mais plus complexe bcp plus de facteur de traduction et on a une queue de poly a qui a un rôle pour stabiliser la traduction
30
Élongation sous étape
- Mise en place correcte de l ’aminoacyl ARNt au site A (premier aa est sur le site P alors site a est libre alors on va fixer lui du P sur le A) - Formation de la liaison peptidique - Glissement du ribosome sur le codon suivant
31
Mise en place correcte de l ’aminoacyl-ARNt au site A
-EF-Tu : monomère protéique fixe GTP, forme le complexe ternaire sur le site A -Fixation du complexe ternaire sur le site A -Appariement correcte : hydrolyse de GTP, changement de conformation de EF-Tu*GDP, EF-Tu*GDP quitte le complexe d ’élongation, EF-Tu*GDP ne peut plus se réassocier à une autre molécule aminoacyl-ARNt
32
Formation de la liaison peptidique
- Peptidyl transférase de la sous-unité 50 S du ribosome associé p - Rupture de la liaison aminoacyl-ARNt pAB occupe le site A et inhibe l’enzyme
33
Glissement du ribosome sur le codon suivant (chez procaryote)
- Besoin de EF*G->protéine abondante et fixe GTP - Fixation de EF-G*GTP sur le ribosome - Élimination de ARNt du site E - Translocation du site A au site P - Hydrolyse du GTP - Libération de EF-G*GDP - Recommence un autre cycle d ’élongation
34
Terminaison de la traduction
-Facteurs de largage : - Fixation de RF3*GTP-RF1 ou 2 sur site A -Hydrolyse de la liaison ester peptidyl-ARNt -Relargage du peptide néoformé -Hydrolyse du GTP -Dislocation du complexe de traduction
35
Facteur de relargage
- RF1 - RF2 - RF3 Remarque: chez l ’eucaryote un seul facteur de relargage RF
36
RF1
reconnaît UAA et UAG
37
RF2
reconnaît UAA et UGA
38
RF3
fixe GTP et augmente efficacité de RF1 et RF2
39
Pour chaque incorporation d ’aa (ATP)
2 ATP pour l ’activation de l ’aa + 2 GTP pour l ’enchaînement de cet aa donc 4 équivalent ATP pour chaque liaison peptitidique
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