ch8 Flashcards

Relation entre l'ADN et le phénotype (44 cards)

1
Q

Quel pourcentage du génome nucléaire humain est constitué de gènes codant pour des protéines?

A

Seulement 1.5% du génome humain est constitué de gènes codant pour des protéines.

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2
Q

Quelle est la principale fonction des séquences d’ADN non-codant entourant les gènes?

A

Elles sont importantes dans la régulation de l’expression des gènes.

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3
Q

La variabilité de quels deux phénomènes génétiques est souvent expliquée par l’ADN non-codant?

A

La variabilité de la pénétration et de l’expressivité.

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4
Q

Définissez la densité génique.

A

C’est le nombre de gènes par mégabase (Mb) d’ADN.

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5
Q

Comment la densité génique varie-t-elle avec la complexité d’un organisme?

A

La densité génique est plus faible chez les organismes plus complexes, qui ont un plus grand génome mais pas nécessairement plus de gènes.

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6
Q

Qu’est-ce que la pénétrance en génétique?

A

C’est la proportion d’individus possédant un génotype spécifique qui expriment réellement le phénotype attendu.

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7
Q

Quelle est la différence entre la pénétrance complète et la pénétration incomplète?

A

En pénétrance complète, 100% des individus avec le génotype expriment le phénotype, tandis qu’en pénétrance incomplète, ce pourcentage est inférieur à 100%.

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8
Q

Qu’est-ce que l’expressivité en génétique?

A

C’est le niveau ou l’intensité auquel un allèle donné est exprimé au niveau phénotypique chez un individu.

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9
Q

Quelle est la distinction fondamentale entre la pénétrance et l’expressivité?

A

La pénétrance concerne la présence ou l’absence d’un phénotype, tandis que l’expressivité concerne le degré d’expression de ce phénotype lorsqu’il est présent.

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10
Q

Où se retrouve la majorité des SNP (Single Nucleotide Polymorphism) liés à des maladies?

A

La majorité se retrouve dans l’ADN intergénique ou dans les introns, et non dans les régions codantes.

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11
Q

Comment le polymorphisme des régions régulatrices peut-il affecter un phénotype?

A

Il influence la pénétrance et l’expressivité d’un phénotype en modifiant la régulation du gène d’intérêt.

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12
Q

Dans l’exemple de la polydactylie, la mutation causant le phénotype se trouve-t-elle directement dans le gène SHH (Sonic hedgehog)?

A

Non, la mutation se trouve dans une région régulatrice située à une grande distance du gène SHH.

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13
Q

La mutation responsable de la polydactylie chez certaines familles se trouve dans un élément amplificateur du membre appelé ZRS. Dans l’intron de quel gène se situe le ZRS?

A

Le ZRS se situe dans un intron du gène LMBR1, à environ 1Mb du gène SHH qu’il régule.

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14
Q

Quel est l’effet de la mutation dans le ZRS sur l’expression du gène SHH?

A

Elle provoque une mauvaise expression de SHH dans la partie antérieure du bourgeon du membre, menant à la formation de doigts supplémentaires.

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15
Q

Définissez l’épigénétique.

A

Ce sont des changements stables et transmissibles lors de la mitose, causés par l’activation et la désactivation des gènes, sans altération de la séquence d’ADN.

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16
Q

Nommez deux mécanismes épigénétiques principaux.

A

La méthylation de l’ADN et la modification des histones.

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17
Q

Quel est l’effet de l’ajout d’un groupement méthyle ($CH_3$) sur l’ADN?

A

Il provoque une répression de la transcription en marquant la région pour la formation d’hétérochromatine.

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18
Q

Quel est l’effet de l’ajout d’un groupement acétyle sur les histones?

A

Il neutralise la charge des histones, ce qui permet un accès facilité à l’ADN et augmente la transcription.

19
Q

Le _____ est un processus d’extinction de gènes impliquant l’ajout de groupements $CH_3$ directement sur l’ADN.

A

méthylation de l’ADN

20
Q

Quelle est la cause génétique du syndrome du X fragile?

A

Une augmentation du nombre de répétitions du trinucléotide CGG dans le promoteur du gène FMR1 sur le chromosome X.

21
Q

Comment un grand nombre de répétitions CGG dans le gène FMR1 conduit-il au syndrome du X fragile?

A

L’augmentation des répétitions (>200) induit la méthylation du promoteur, ce qui éteint l’expression du gène FMR1.

22
Q

Que se passe-t-il avec les marques de méthylation de l’ADN lors du développement des cellules germinales (gamètes)?

A

Il y a un effacement intensif des marques épigénétiques, suivi d’un rétablissement selon le sexe de l’individu.

23
Q

Nommez trois facteurs externes (environnementaux) qui peuvent altérer les marqueurs épigénétiques.

A

La nutrition, les polluants (tabac, métaux lourds) et la température.

24
Q

Comment une exposition maternelle à un facteur environnemental peut-elle affecter la génération F2 (les petits-enfants)?

A

Les cellules germinales de la génération F2 sont déjà présentes dans le fœtus F1 et peuvent donc être directement exposées au facteur environnemental via la mère.

25
Qu'est-ce que l'empreinte génomique?
C'est un phénomène épigénétique où une des deux copies d'un gène (soit maternelle ou paternelle) est gardée silencieuse par la méthylation.
26
Dans le cas de gènes soumis à l'empreinte, combien de copies du gène sont exprimées dans une cellule?
Une seule copie, soit celle provenant de la mère, soit celle provenant du père.
27
Le syndrome d'Angelman est généralement causé par un problème sur quelle copie parentale du chromosome 15?
Il est causé par la délétion ou la mutation d'une portion du chromosome 15 maternel.
28
Quel gène, lorsqu'il est manquant ou muté sur la copie maternelle du chromosome 15, cause le syndrome d'Angelman?
Le gène UBE3A.
29
Pourquoi une mutation sur la copie paternelle du gène UBE3A ne cause-t-elle généralement pas le syndrome d'Angelman?
Parce que la copie paternelle du gène UBE3A est naturellement inactive (silencieuse) dans le cerveau en raison de l'empreinte génomique.
30
Les syndromes d'Angelman et de Prader-Willi sont tous deux liés à des défauts dans la région _____ du chromosome 15.
15q11-q13
31
Qu'est-ce que la compensation de dosage chez les mammifères?
C'est le processus qui inactive les chromosomes X supplémentaires pour que l'expression des gènes portés par le chromosome X soit équivalente entre mâles (XY) et femelles (XX).
32
Comment appelle-t-on le chromosome X inactivé et condensé visible dans le noyau des cellules femelles?
Le corpuscule de Barr.
33
L'inactivation du chromosome X chez l'humain est-elle aléatoire ou parent-spécifique?
L'inactivation initiale est aléatoire; soit le X maternel, soit le X paternel peut être inactivé dans une cellule.
34
À quel stade du développement embryonnaire humain l'inactivation du chromosome X se produit-elle?
Elle se produit au stade blastocyste.
35
Une fois qu'un chromosome X est inactivé dans une cellule, que se passe-t-il dans les cellules descendantes?
Toute la descendance de cette cellule portera le même chromosome X inactivé.
36
Quel est le résultat de l'inactivation aléatoire du X chez une femelle hétérozygote pour un gène lié au X?
Cela crée une mosaïque au niveau de l'organisme, avec certaines cellules exprimant l'allèle d'un X et d'autres cellules exprimant l'allèle de l'autre X.
37
Quel type de molécule est XIST, qui est responsable de l'inactivation du chromosome X?
XIST est un long ARN non-codant (lncRNA).
38
Comment le lncRNA XIST provoque-t-il l'inactivation du chromosome X?
Il se lie et tapisse le chromosome dont il est issu, ce qui recrute des complexes répressifs et condense le chromosome en hétérochromatine.
39
Combien de corpuscules de Barr une femme avec un caryotype 47,XXX aura-t-elle?
Elle aura deux corpuscules de Barr (nombre de X - 1, soit 3 - 1 = 2).
40
Combien de corpuscules de Barr un homme atteint du syndrome de Klinefelter (47,XXY) aura-t-il?
Il aura un corpuscule de Barr (nombre de X - 1, soit 2 - 1 = 1).
41
Combien de corpuscules de Barr une femme atteinte du syndrome de Turner (45,X0) aura-t-elle?
Elle n'aura aucun corpuscule de Barr (nombre de X - 1, soit 1 - 1 = 0).
42
Dans le cas des chats Calico, le gène responsable de la couleur du pelage (orange ou noir) est localisé sur quel chromosome?
Il est localisé sur le chromosome X.
43
Pourquoi une chatte hétérozygote pour la couleur du pelage a-t-elle des taches orange et noires?
Son pelage en mosaïque est dû à l'inactivation aléatoire du chromosome X : dans les zones orange, le X porteur de l'allèle noir est inactivé, et vice-versa.
44
Un chat mâle peut-il normalement être Calico (orange et noir)?
Non, car les mâles n'ont qu'un seul chromosome X (XY) et ne peuvent donc exprimer qu'une seule couleur (soit orange, soit noir).