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Control Postranscripcio nal. Flashcards

(84 cards)

Study These Flashcards
1
Q

Región 5’UTR:

A

Es la región no traducida del RNAm (Upstream del codón de inicio).
No codifica proteína directamente.
Su función principal es regular la iniciación de la traducción.

Regulación e iniciación de la traducción a veces se traducen a un producto de proteína producto. Este producto puede regular la traducción del RNAm.

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2
Q

N GLICOSILACION

A

Grupo Amino de asparagina
En Golgi y RER

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3
Q

O GLICOSILACION

A

Hidroxilo de ser o Treonina
En Golgi

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4
Q

PROCESAMIENTO PROTEOLÍTICO
Insulina

A

Cuando termina de salir de ribosomas tiene secuencia señal, Cadena B, y Cadena a y Cadena péptidos C. La secuencia señal se quita de las proteínas. A y B se unen por puentes de disulfuro, después se quita Cadena C
El peptido C no cambia, ósea que si está elevado la persona hace su insulina de manera endógena , si está normal es exógena.

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5
Q

UBIQUITINACIÓN

A

Se usa para:
Cambiar localización de una proteína o para degradarla
Se marca proteína para degradar
Primero se usan tres enzimas
1. Agarra ub y la pasa a 2
2. Pasa a 3
3. Es ub Ligasa

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6
Q

Decide cuántas Ub tendrá cada proteína

A

Enzima dos decide cuántas Ub tendrá cada proteína

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7
Q

Tipos de Ubiquitinacion

A

Monoubiquitinacion: 1 ub, ayuda a mover proteína de lugar
Multi: muchas ub pero en distintos aa de la proteína, esto afecta función de proteína
Poli: 4 ub en el mismo aa de la proteína, esto lo manda a degradar a proteasoma

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8
Q

Proteasoma

A

tiene dos casquetes y cuatro anillos, dos alfa y dos beta (proteoliticos esos dos). Casquette ubica proteína por Ubiquitinacion, ahí se desnaturalizan, pasa a los anillos y en los Beta se degrada. Se puede degradar a pequeños peptidos.

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9
Q

SUMOILACIÓN

A

Ayuda a estabilizar proteína para que no se degrade, aparte ayuda a modificar interacción proteína- proteina.
Es similar a Ubiquitinacion. Hay 3 enzimas, la 1 agarra y se la pasa a dos, 2 pasa a 3 y 3 se la pone a proteína SUMO.

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10
Q

PALMITOILACIÓN

A

Para anclar proteínas de membrana. Cuando queremos que proteína se vaya a membrana interna de la membrana plasmatica, si le ponemos el palmitoilo y así se puede anclar, si se la quitamos proteína se queda es citosol.

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11
Q

SULFATACIÓN

A

Mejora la interacción proteína- proteína. También puede modificar proteína para que sea reconocida por un receptor o enzima

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12
Q

En que influye Región 3’UTR

A

Puede influir poliadenilación, la eficiencia de traducción, localización, y la estabilidad del RNAm.

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13
Q

RNA precursores

A

transcritos primarios o hnRNA
• Se procesan para producir una molécula de mRNA madura a través del
proceso de corte y empalme (splicing).

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14
Q

es 10 veces mas grande que el RNA maduro

A

El hn RNA

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15
Q

se eliminan del transcrito

A

Los intrones se eliminan del transcrito dejando a los exones

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16
Q

EMPALME ALTERNATIVO

A

En cada tejido se realiza un procesamiento diferente conocido como procesamiento alternativo o splicing alternativo

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17
Q

procesamiento alternativo o splicing alternativo que es

A

• Los pre- RNAm son procesados por un proceso de corte y empalme.
• Los intrones se eliminan y dejan a los exones.
• Diferente tipo de células
• Diferente tiempo del desarrollo

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18
Q

El mecanismo por el cual se incluye o se excluye un exón depende de

A

si la maquinaria de empalme selecciona los sitios de empalme especificos 3’ y 5’

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19
Q

Qué pasa en splicing Si los sitios son débiles,

A

la maquinaria de empalme la pueden evitar

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20
Q

Espliceosoma Compuesto por:

A

5 ribonucleuproteínas pequeñas 300 proteínas
NTC: (nineteen –complex)
NTR: (nineteen complex related)

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21
Q

PROTEINAS SR

A

(proteinas ricas en serina/arginina).- ProteÍnas que activan los sitios de empalme

Identifican exones

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22
Q

PROTEINAS hnRNP

A

ribonucleoproteinas heterogenea nuclear

  • ProteÍnas que inactivan los sitios de empalme

identifican intrones

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23
Q

Como actúa el Espliceosoma

A

U1 snRNP reconoce y se une a la secuencia GU del extremo 5’ del intrón

U2AF reconoce el sitio 3’ del intrón (punto polipirimidínico + AG)

  1. Unión de U2
    U2 snRNP se une al sitio de ramificación, dejando expuesta la adenina “solitaria”
  2. Llega el complejo U4/U6–U5
    U4, U5 y U6 llegan juntas como un complejo

Al llegar este complejo:
U6 desplaza a U1 del sitio 5’
U4 mantiene a U6 inactivo (lo regula)

  1. Activación del spliceosoma
    U4 se va
    U6 se aparea con U2
  2. Primera reacción (formación del asa / lariat)
    La adenina del sitio de ramificación hace un ataque nucleofílico al extremo 5’ del intrón
    Se forma el asa (lariat)
  3. Segunda reacción (unión de exones)
    U5 mantiene alineados los exones
    Ocurre el segundo ataque nucleofílico
    Los dos exones se unen
    El intrón en forma de asa se libera
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24
Q

U6 snRNA es

A

una ribozima

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25
U4 snRNA es
inhibidor de la ribozima
26
Edición del RNA
Modificación en una o mas bases del RNA maduro
27
Adenosin deaminasas
• Desaminación de adenina para producir inosina (A- I) • Desaminación de citocina para producir uracilo (C-U) • Puede producir un cambio en la secuencia de aminoácido de una proteína.
28
RNAm Transporte del Núcleo al citoplasma
1 de cada 20 RNAm deja el núcleo Para poder salir del núcleo, el RNA sufre 3 modificaciones: • Metilguanosina en el extremo 5’ • Adición de la cola Poli-A en el extremo 3’ • Eliminación de intrones
29
Que hace RNAm antes de iniciar la traducción.
Los RNA m se dirigen a sitios específicos dentro de la célula antes de iniciar la traducción. Se sitúan en sitios en donde la proteína se requiere, para concentrar la mayor producción de proteínas en sitios específicos.
30
La señal que determina en donde se va a localizar el RNAm se encuentra en
la región UTR 3’
31
Cuando elF2 se fosforila
Se bloquea la traducción
32
vida media de un RNAm
30 min hasta 10 h
33
Los RNA m mas estables son
los que tienen mas A
34
Que tiene que ver cola poli A con nivel de degradación
• Aprox. 200 nt • Una vez en el citoplasma, la cola se va acortando • Mientras más corta mas inestable
35
25 a 30nt poliA
= inestabilidad de RNAm
36
Las diferencias en la secuencia en la UTR 3’ determinan
la velocidad de acortamiento de la cola poli A. • Si son ricos en AU vida media corta • Si son ricos en C vida media larga
37
MIRNA
interfiere con ARNm de las proteínas
38
siRNA
* siRNA puede tomar estructura de pasador y al irse al citosol, DICER lo corta en las dos cadenas de RNA. * Cuando están las dos cadenas llega complejo RISC con ARGONAUTA. * Complejo RISC se escoge una sola cadena. * Y el complejo de RISC + siRNA se va a región 3’UTR y corta ARNm. * Esto para traducción de ARNm y esto sirve de tratamiento.
39
siRNA Diferencias con miRNA:
- no es sintetizado por POL II - No usamos DROSCHA - No tiene caperuza, cola de poli A - siRNA afuerzas se deben complementar totalmente, es todo o nada. - siRNA corta ARNm - siRNA es ARNm específico
40
Inclisiran
es un fármaco. Se le pone a siRNA una proteína y gracias a un receptor es reconocida y se abre un canal que permite entrada de siRNA al citosol y va a llegar DICER, lo corta y luego llega complejo RISC y escoge una Cadena y el complejo se va a región 3’UTR de ARNm. En este caso suponiendo que es receptor de colesterol entonces ya no se forma receptor de colesterol porque se rompe ARNm, ya no se formó proteína y nadie captura colesterol.
41
RNA LARGOS POL II
IncRNA - sintetizados por la ARN POL II porque tienen caperuza y cola de poli A, - pueden leerse en cualquier sentido, incluso opuesto a la lectura del gen. -Puede ser de regiones intronicas o Intergénicas
42
RNA largos nombres
están asociados con su descubrimiento, por ejemplo primero fueron descubiertos en Cáncer, el primero fue en Mama y se llama MALAT
43
piRNA
piRNA rompe RNAm de los genes transponibles. - ARN pequeños - asociados con proteínas PIWI que son familia de la ARGONAUTA por lo que tmb son ENDONUCLEASAS - específicos para genes transponibles - nos protegen de transposones, que pueden mover genes y esto es malo porque cambia la secuencia lo que genera que la proteína con mutaciones. Hay transposones que necesitan señal para cambiarse de lugar, hay otros que no.
44
RNA CIRCULARES
Se forman durante el splicing 1. Circ RNA: solo provienen de exones 2. EIciRNA: proviene de exones-intrones 3. ciRNA : solo provienen de intrones Son parecidos a los largos: - pueden inhibir ribosomas - sostener miRNA - mantener enzimas modificadoras de histonas unidas. Sirven como andamiaje. Sólo inhiben traducción, o disminuyen expresión de genes, no modifican ARNm en sí.
45
RECEPTOR DE INSULINA
Es de tirosina Cinasa. Ligando llega a receptor y este sufre cambio conformacional que permite la autofosforilación y esto permite unión de otras proteínas que va a fosforilar generando cascada de fosforilación hasta que se enciende una proteína blanco que será en este caso hasta llegar a proteína AS160 que ayuda a llevar vesícula con GLUT4 adentro. En la cascada de señalización tenemos miRNA que la está regulando desde el receptor hasta sus sustratos. Con esto podemos atacar ARNm siRNA Podemos bloquear miRna Y RNA largos
46
Para hacer siRNA Debemos
conocer secuencia de ARNm
47
Polirribosomas
Ribosomas leen ARNm, este puede ser leído al mismo tiempo por varios ribosomas para tener mayor cantidad de proteínas. A esto se le conoce como Polirribosomas
48
secuencia señal,
Lo primero en salir es el amino terminal con la secuencia señal, para modificar esta secuencia podemos cortar primer AUG y leer a partir del segundo AUG. Todo lo que sigue de Metionina es la secuencia señal que nos dice a donde se va proteína.
49
Proteína si va a RE
va a haber un receptor llamado SRP reconoce y lo lleva a RE entonces se abre proteína translocon, se mete proteína a RE y ahí se corta secuencia señal por una pepetidasa. En RE se siguen las modificaciones del RE.
50
Proteína si va a Golgi
Si necesita ir a Golgi tiene en su amino terminal tmb una secuencia señal. Lo mismo pasa lisosoma. Si tiene que ser transmembranal también tiene su secuencia señal y se detiene traduccion para que se siga traduciendo en citosol y no en RE. Se sintetiza hasta que llega a secuencia de parada, se corta secuencia señal y ahí queda proteína transmembranal Entonces hay Señales de entrada y parada para RE, así se hacen receptores acoplados a proteínas G. En estas proteínas que atraviesan 7 veces va a tener varias secuencias de parada y varias de estar adentro para que pueda atravesar 7 veces
51
Una fosforilación siempre es en
Serina, Treonina y Tirosina
52
Mirna se une a proteínas
para formar: Complejo Silenciador Inducido por RNA (RISC)
53
Biomarcadores
• Técnicas poco invasivas • Se obtienen de celulas necróticas o vivas • Los miRNA son específicos de cada enfermedad y tejido • Las [miRNA] pueden cambiar en estados patológicos • Son estables • Se pueden cuantificar
54
SiRNA origen endógeno
• Transcripción bidereccional • Interacción de transcritos complementarios • Secuencias repetitivas invertidas
55
RNA largos no codificantes (lnc RNA)
• RNA por I, II, III • Unos pueden sufrir splicing, tener caperuza y poliadenilacion • Otros no • Origen: • Intrones • Potenciadores • Regiones intergenicas
56
Origen DE LOS circ RNA
Se forman durante el splicing circ RNA solo provienen de exones EIciRNA proviene de exones-intrones ciRNA solo provienen de intrones
57
SPLICING/CORTE Y EMPALME Proceso
Para el splicing debemos saber encontrar intrones con la HnRP (heteroribonucleoprorínas) , debemos saber donde inician (5’) estos y donde terminan (3’), necesitamos reconocer exones con la SR y también necesitamos una adenina que estará más cerca del ADN 3’. En ARNm, la cabeza siempre es 5’, y 3’ es el final. La adenina está metida en una secuencia específica.
58
concentración de todas las enzimas involucradas
Varian de acuerdo al ambiente, no es fija
59
ribonucleoproteinas que tienen ARNsn
59
identificar intrones
necesitamos la maquinaria de splicing. Tenemos el spliceosoma mayor que identifica GU en el extremo 5’ y AG en extremo 3’ y a la adenina sola.
60
UTR
Región 5’ UTR sirve para modular inicio de la traducción REGIÓN 3’ UTR sirve para saber cuánto vivirá ARNm en citosol, ella lo determina, también sirve para saber a donde se irá ese ARNm esas no se traducen
61
Ribonucleoproteinas
Primero U1 identifica 5’ U2AF identifica 3’ U2 identifica adenina solita U4, U5, U6 llegan juntas, U5 une exones se dobla ARN y se forma asa. U4 regula a U6, U6 quita a U1 y hace ataque nucleofílico de la adenina al 5’ y se forma asa (1ero). U5 al estar uniendo exones favorece el otro ataque nucleofílico, se juntan los dos exones y se libera asa liberando intron. Existen distintos tipos de intrones, los que se quitan solas o por proteínas son en procariotas, nosotros solo usamos ribonucleoproteínas en eucariotas
62
Exporting factor 1
Para ARNm ecesitamos exportina factor 1 que se dedica a sacar ARNm del núcleo al citosol, para esto identifica Caperuza, cola de Poli A y que ya no tenga máquinas de splicing. En citosol, nuestro ARNm tiene región 5’ UTR y la 3’ UTR, primero se identifica 3’ UTR y de ahí se dirige a donde sea necesario para sintetizar la proteína, decide si irse al RE , membrana plasmática o citosol, y ahí se traducirá ahorrando energía pasando directo el ARNm.
63
Quien sintetiza los MIRNA
Sintetizados por RNApol II • Cap y poliA
64
MiR-24
se encuentra en bajas concentraciones y es un miRNA que promueve apoptosis
65
MiR-21
Mirna que promueve el crecimiento celular inhibiendo a genes supresores del ciclo celular
66
Onco-miR
(miRNA oncogenicos)
67
TS-miR
(supresor de tumores)
68
Origen Endógeno de los
69
Cual es el espacio 5} UTR
espacio entre la caperuza y el primer AUG se llama región 5’ UTR.
70
Cual es la Región 3’ UTR
de codón de paro hasta Cola de Poli A
71
Región 5’ UTR para que sirve sirve
sirve para modular inicio de la traducción
72
Para que sirve REGIÓN 3’ UTR
REGIÓN 3’ UTR sirve para saber cuánto vivirá ARNm en citosol, ella lo determina, también sirve para saber a donde se irá ese ARNm
73
Degradan ARNm
Mirna
74
Degradan ARNm
Mirna
75
Cortan ARNm
SiRNA
76
Orígenes de siRNA
Tienen dos orígenes pueden ser exógenos o endógenos Endógenos: mi célula los está sintetizando, pueden provenir de exones, intrones o de regiones Intergénicas. Estos no son sintetizados por POL II, no sabemos quien la sintetiza , tampoco quien los pasa del núcleo al citosol Los exógenos nosotros los generamos e introducimos a la célula.
77
Diferencias SIRNA Y MIRNA
Diferencias con miRNA: - no es sintetizado por POL II - No usamos DROSCHA - No tiene caperuza, cola de poli A - siRNA afuerzas se deben complementar totalmente, es todo o nada. - siRNA corta ARNm - siRNA es ARNm específico
78
Inclisiran
Inclisiran es un fármaco. Se le pone a siRNA una proteína y gracias a un receptor es reconocida y se abre un canal que permite entrada de siRNA al citosol y va a llegar DICER, lo corta y luego llega complejo RISC y escoge una Cadena y el complejo se va a región 3’UTR de ARNm. En este caso suponiendo que es receptor de colesterol entonces ya no se forma receptor de colesterol porque se rompe ARNm, ya no se formó proteína y nadie captura colesterol.
79
ARN en spliceosoma
se llama ARNsn (pequeño nuclear) + proteínas sin la maquinaria del Splicing
80
APOlipoproteínas
B100 utiliza el 100% del arn B48 usa el 48% Esto es gracias a la desaminacion Si en el gen completo tenemos CAA, si sufre desaminación se vuelve UAA, que es codón de paro, entonces la proteína queda más pequeña, esa es B48.
81
ALTERACIÓN EN CAPERUZA
Si está dañada o no tenemos caperuza: no llega IF4 y por ende IF2 el ARNm se pliega de tal forma que se pueda acoplar la Subunidad menor del ribosoma sin IF4 se llama Sitio de unión especificó de ribosomas independiente de caperuza (IRES) se empieza traducción, esto pasa en proteínas víricas.
82
ARNm degradación
se debe degradar en algún punto, quien determina es 3’UTR, entre más larga sea la cola de poli A más vive. FORMA 1. Se empieza a degradar por dos enzimas: 1. deadenilasa: corta adeninas, entonces empieza a comerse las adeninas de la cola de Poli A. cuando ya va a acabar, llama a la otra enzima 2. Enzima de descapsulación, que quita la caperuza. Entonces ya no hay cola ni caperuza quedando nucleótidos 3. llegan exonucleasas que quitan nucleótidos al cortar enlaces fosfodiéster de extremos . FORMA 2. 1. deadenilasa quita todas las adeninas 2. llegan un conjunto de exonucleasas llamado EXOSOMA, que va girando y cortando enlaces fosfodiéster y se come todo hasta caperuza.
83
Proceso de formación de MIRNA
* El gen de miRNA se transcribe en el núcleo formando un **pri-miRNA**. * Drosha quita cola y caperuza. (Pre Mirna) * Queda estructura de pasador. * se va a citosol por exportina 5. * llega Dicer que corta el bucle del pasador dejando dos cadenas de miRNA. * Luego llega complejo RISC que tiene una proteína llamada Argonauta que es endonucleasa, por lo que corta enlaces fosfodiéster de adentro de la cadena. * Escoge una cadena de miRNA y busca el extremo 3’UTR en ARNm. * Cuando llega a ese extremo: 1. si se complementa completamente se activa Argonauta y se corta ARNm y esto hace que no se traduzca y se degrade. 2. Si miRNA se complementa parcialmente a 3’UTR se detiene la traducción y lleva ARNm a cuerpos P (sitios de degradación del ARN). Tenemos muchos miRNA por cada ARNm
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