Quel ‘‘type’’ de Carbone utilisent les autotrophes?
Carbone inorganique
Quel ‘‘type’’ de Carbone utilisent les hétérotrophes?
Le carbone réduit fourni par les autres organismes.
Décrivez les effets du changement climatique sur les microbes.
- Complexes et difficiles de prédire
- Plus de CO2 atmosphérique augmente la biomasse des plantes et la fixation du C dans le sol.
- Long terme : appauvrissement du sol.
Qu’est-ce que l’eutrophisation?
Processus naturel qui se déroule sur une très longue période de temps.
- Explique comment un lac se transforme progressivement en marais puis en tourbière ou en prairie.
–> Diminution de la biodiversité.
Nommez les ‘‘groupes’’ de protéobactéries telluriques.
- Alphaproteobacteria
- Betaproteobacteria
Décrivez les Alphaproteobacteria.
- Bactéries Gram NÉGATIF
- Plusieurs sont symbiotiques de plantes et d’animaux, peu de pathogènes
- Majoritaires dans le sol
Donnez des exemples d’alphaproteobacteria majoritaires dans le sol.
- Bradyrhizobium sp : fixatrices d’azotes symbiotiques
- Rhodoplanes sp : phototrophes
- Sphingomonas sp : dépourvues de LPS
- Devosia sp : certaines espèces son des fixatrices d’azote symbiotiques
Décrivez les betaproteobacteria.
- Bactéries Gram NÉGATIF
- Beaucoup de symbiotiques de plantes, pathogènes
- Majoritaires dans le sol
Donnez des exemples de betaproteobacteria majoritaires dans le sol.
- Methylibium sp
- Ramlibacter sp
Décrivez les actinobactéries telluriques.
- Bactéries Gram POSITIF
- GC% élevé
- Produisent un mycélium et certaines se reproduisent par sporulation
- 40% des bactéries cultivables du sol
Donnez des exemples de de bactéries telluriques
- Streptomyces sp : sécrète de nombreux composés volatils (GEOSMINS)
- Mycobacterium sp
- Salinibacterium sp
Décrivez les actinobactéries telluriques.
- Bactéries Gram NÉGATIF
- Beaucoup sont acidophiles
- Très peu sont cultivables
Donnez des exemples d’actinobactéries telluriques.
- Candidatus Solibacter sp
- Ordre des iii1-15
Quel facteur influence significativement la diversité microbienne ?
Le pH.
Qu’est-ce que les nodules?
- Petites boursouflures se formant sur les racines de nombreuses espèces de plantes, sous l’action de bactéries de l’ordre des Rhizobiales.
Qu’est-ce qu’une relation symbiotique entre les organismes nodulaires?
La plante fournit les substances carbonnées et les bactéries les substances azotées.
Comment se forment les nodules?
1) Racines de plantes émettent des flavonoïdes qui se lient aux récepteurs dans la membrane du plasma
2) En réponse aux flavonoïdes, le rhizobia sécrète le facteur Nod qui se lie au récepteur dans les membranes de l’hôte (racines)
3) La liaison avec le récepteur cause une entrée de Ca2+ dans les racines de plantes. Les racines vont donc s’enrouler autour du rhizobia.
4) Rhizobia injecte des protéines d’infection ce qui cause une infection chez la racine de plante.
5) Les nodules (protéines) causent la division des cellules des racines ce qui forment les nodules.
6) Les nodules deviennent rose à l’intérieur : production d’hémoglobuline
7) Les nodules développent du tissu vasculaire qui transporte le nitrogen
Décrivez les microorganismes phytostimulateurs libres.
- Communauté microbienne du sol (microbiote du sol)
- Microbiote racinaire
Donnez des exemples de micro-organismes phytostimulateurs libres.
- Azotobacter
- Azospirillum
- Pseudomonas
- Bacillus
- Paenibacillus
Donnez les différentes étapes du mécanisme de phytostimulation.
1) Amélioration de la nutrition azotée : diazotrophie
2) Amélioration de la nutrition en P
3) Amélioration de la nutrition en Fe
4) Effets positifs sur la croissance racinaire
5) Émission de composé.s organiques volatils bactériens
Décrivez la diazotrophie.
- Aucune spécificité taxonomique
- Implique la production d’une nitrogénase codée par le gène nifH
Décrivez l’amélioration de la nutrition en Phosphate.
- Les végétaux n’absorbent que le phosphate organique
- Des bactéries peuvent solubiliser le P minéral
- Les bactéries utilisent également le P organique : sécrétion d’enzymes (phosphatases et phosphonatases)
Décrivez l’amélioration de la nutrition en Fe.
- Le Fer est indispensable pour la synthèse de chlorohylle et la photosynthèse, la fixation d’azote, la respiration et les activités enzymatiques
- FeIII : forme hyper prépondérante dans le sol mais insoluble
Quel est le genre bactérien très fréquent en lien avec le fer?
Pseudomonas
