Donnez les généralités des mycètes.
- Plus de 1000 espèces décrites
- Importance majeure dans la décomposition des plantes et animaux morts, recyclage des nutriments et dans les cycles biogéochimiques
- Eucaryotes
- Hétérotrophes avec mode de nutrition par adsorption
- Chitine = constituant principal de la paroi cellulaire
- Reproduction par les spores
- Stockage des réserves de carbohydrate sous forme de glycogène
- Dépourvu de chlorophylle
Quelles sont les 2 méthodes pour identifier les mycètes d’eau douce?
- Séquençage du SSU-rDNA
- Pyroséquençage
Comment peut-on identifier les mycètes d’eau douce?
- Prélèvements à la saison sèche et à la saison des pluies
- RFLP sur tous les sites
- Pyroséquençage
Nommez les Phyla majoritaires des mycètes des sédiments d’eau douce.
1) Ascomycota : Sordariomycetes, Leotiomycetes, Dothideomycetes, Pezizomycetes
2) Basidiomycota : Argaricomycetes
Décrivez les mycètes telluriques.
- Forte diversité
- Globalement une majorité de Basidiomycota suivi des Ascomycota et des champignons primitifs.
Décrivez les mycètes symbiotiques des plantes.
- Mycorhizes 2 types : Ectomycorhizes et Endomycorhizes
- Racines fournissent les ressources carbonées
- Champignon symbiotique fourni les éléments minéraux
- 90% des plantes
Décrivez les Ectomycorhizes.
- Majoritairement des Agaricomycetes mais aussi des Ascomycetes
- Présence d’un manteau fongique enveloppant les racines de l’hôte + réseau de Hartig + hyphes du champignon
Décrivez les Endomycorhizes.
- Mycètes considérés comme asexuées
- Forme des grandes spores contenant des milliers de noyau : difficilement manipulable
- Très forte variabilité génétique et fonctionnelle
- Plusieurs mycètes du groupe Glomeormycota possèdent des bactéries endosymbiotiques non cultivables.
Comment sont classifiées les mycètes phytopathogènes?
Selon leur mode de vie :
biotrophe, necrotrophe et hémibiotrophe
Décrivez le mode de vie biotrophe.
L’agent pathogène colonise des tissus vivants
Décrivez le mode de vie necrotrophie.
L’agent pathogène tue les cellules végétales avant de les coloniser
Décrivez le mode de vie hémibiotrophe.
Commence par une phase biotrophe avant de devenir nécrotrophes
Nommez les 2 groupes de phytopathogènes biotrophes.
- Biotrophes obligatoires
- Biotrophes non-obligatoires
Décrivez les biotrophes obligatoires.
- Limités dans leur capacité à utiliser des substrats communs comme source d’É
- Sont dépendants de leur hôte en tant que source d’É
Décrivez les biotrophes non-obligatoires.
- Peuvent survivre dans leur hôte
Décrivez les nécrotrophes.
- Sécrètent des toxines pour tuer les cellules afin de coloniser la plante
Qu’est-ce que doit faire un phytopathogène nécrotrophe pour survivre?
- Doit contourner les défenses de la plante et générer une zone de tissu mort dans laquelle il sera protégé de l’hôte et ou il pourra se nourrir
- Nécrose est ensuite étendue au fur et à mesure de la croissance du champignon phytopathogène.
Qu’est-ce que les hémibiotrophes?
- Combinent les 2 styles de vie
Qu’est-ce que le mycobiome?
- Ensemble des mycètes présents dans les microbiotes
- 1000 mycètes/g de contenu intestinal
- Contient des commensaux et des pathogènes
- Nombre de gènes fongiques constitue un 0,1% du nombre de gènes totaux dans le microbiome
- Très différent selon le microbiome considéré
Décrivez les mycètes pathogènes.
- Induisent des mycoses
- Majorité infectent des personnes immuno-compromises
- Très peu sont capables d’infecter un individu sain
Quelles sont les caractéristiques essentielles pour être pathogène?
- Résister à la température de 37 degrés et +
- Capacité à atteindre les tissus cibles
- Résister au système immunitaire
- Digérer et absorber des composants de tissus humains
Décrivez les Ascomycetes pour les personnes saines.
- Appartiennent à l’ordre des Onygenales
- Maladie débute de manière asymptomatique dans les poumons
- Peuvent se disséminer vers des sites distants
- Peuvent persister et se réactiver
Donnez des exemples d’Ascomycetes pathogènes.
- Parococcidiodes : muqueuses buccales et respiratoires
- Blastomyces : os, articulations et peau
- Histoplasma : tube digestif et glandes surrénales + os et peau
Décrivez les basidiomycètes pathogènes.
- Appartiennent au genre Cryptococcus
- Cause pneumonies et méningites
- Capacité à persister plusieurs années dans les poumons et à se réactiver quand le système immunitaire plus faible
- Peut se disséminer dans tous les organes via la circulation sanguine
