Qu’est-ce que le microbiote?
L’ensemble des micro-organismes retrouvées dans le microbiome et évalué par le séquençage de l’ARN 16S.
Qu’est-ce que le métagénome?
L’ensemble des séquences du microbiote (chromosomes + plasmides)
Qu’est-ce que le microbiome?
L’ensemble des gènes du microbiote + les métabolites microbiens + l’environnement hôte.
Vrai ou faux.
Les métabolites présents dans le microbiome sont communs à tous les individus mais les espèces sont spécifiques à chacun.
Vrai.
Nommez les différentes fonctions clés du microbiome.
- Assimilation des nutriments
- Modulation de transcriptome humain
- Lutte contre les pathogènes
- Axe intestin-cerveau
Quels sont les principaux nutriments du microbiome?
- Les sucres et les acides gras à chaine courte (SCFA).
- Les autres produits de l’hydrolyse sont recyclés par les méthanogènes et les acétogènes.
Quels sont les rôles des SCFA?
–> Rôle PROTECTEUR.
- Protection contre le cancer du côlon
- Protection contre le risque d’obésité et de résistance à l’insuline
- Activation de la différenciation cellulaire.
Décrivez les différentes ‘‘méthodes’’ de lutte contre les pathogènes du microbiome.
- Stimulation du système immunitaire
- Sécrétion d’antimicrobiens
- Compétition
- Modification de composés non toxiques en toxiques.
Décrivez la stimulation du système immunitaire (lutte contre pathogènes).
- Production de peptides antimicrobiens (cellules de Paneth) : limiter l’attachement des bactéries aux cellules épithéliales et lyse bactérienne.
- Activation des fonctions de barrière : liaison aux Ag microbiens, neutralisation de l’activité pathogène et prévention de l’infection.
- Immunomodulation
Décrivez l’axe intestin-cerveau.
- Présence d’un SNE.
-Tout ce qui se produit dans le milieu intestinal influence les actions des neurones du SNE. - Communication BIDIRECTIONNELLE.
- Régulation de plusieurs fonctions (immunité, digestion, métabolisme, satiété, réaction au stress, humeur).
Décrivez le lien possible entre l’autisme et le microbioome.
- Le profil bactérien révèle une plus grande abondance de Clostridium.
- Diminution du rapport Bacteroidetes/Fimicutes.
- La sévérité des symptômes est liée à une réduction de la production d’acides gras à chaine courte.
Vrai ou faux.
Un traitement antibiotique peut diminuer la sévérité des symptômes du microbiome mais il y a reprise des symptômes après l’arrêt du tx chez les personnes autistes.
Vrai!
Des études ont démontré un lien entre l’utilisation d’atb à large spectre et la diarrhée chronique suivie de la perte du langage, du jeu et des compétences sociales.
Nommez les différents microbiomes.
- Intestin.
- Peau
- Voies respiratoires
- Vagin
- '’Nouveaux’’ microbiome.
Vrai ou faux.
Les microbiomes ont des profils bactériens semblables.
Faux. Leurs profils bactériens sont très différents.
Décrivez le microbiote intestinal.
- Distribution microbienne dans le système digestif.
Décrivez l’évolution avec le temps du microbiote avec le temps.
- Microbiote humain est établi avec le temps : varie en fonction du type d’accouchement.
- Augmentation de la diversité et de l’abondance avec l’âge.
- Aux derniers stades de la vie, la composition du microbiote redevient moins diversifiée et plus dynamique.
Nommez les différents entérotypes.
- Bacteroides
- Prevotella
Décrivez l’entérotype Bacteroides.
- Principale source d’É : les carbohydrates et les protéines par fermentation
- Enrichi en biosynthèse de différentes vitamines : biotine, riboflavine, pantothénate et ascorbate.
Est-ce que le microbiote intestinal diffère selon l’alimentation?
Oui.
- Seul le régime à long terme permettait le regroupement d’entérotypes.
Vrai ou faux.
Les entérotypes sont dépendants de la nationalité, du sexe, de l’âge ou de l’indice de masse corporelle mais corrèlent plutôt avec l’alimentation à long terme.
FAUX. Ils sont INDÉPENDANTS.
Décrivez l’entérotype Prevotella.
- Dégradent les glycoprotéines de mucine présentes dans la couche muqueuse de l’intestin.
- Enrichi en biosynthèse de différentes vitamines : thiamine et folate dans le second.
Vrai ou faux.
L’alimentation à long terme détermine l’entérotype.
Vrai.
Quels sont les impacts d’une alimentation végétale sur le microbiote?
- Augmentation des bactéries lactiques
- Diminution des bacteroides et de clostridium perfingens
- Augmentation des SCFA
–> Diminution de l’inflammation et augmentation des cellules Treg
Quels sont les impacts d’une alimentation à base de protéine animale sur le microbiote?
- Augmentation des bacteroides
- Diminution des bifidobacterium
- Augmentation des TMAO : marqueur des maladies cardiovasculaires
- Diminution des SCFA
