Décrivez le domaine pélagique.
- Entre 100 et 6000m de profondeur.
Décrivez le domaine benthique.
- Dans le sol. Le + profond de l’eau.
Quelle est la salinité ‘‘moyenne’’ de l’eau?
Environ 35 ppt.
Vrai ou faux.
Plus la température augmente, plus la quantité d’O2 dissous diminue.
Vrai.
Décrivez la boucle microbienne.
–> Transforme la matière organique de l’océan qui dérive du phytoplancton.
1) Le phytoplancton ‘‘absorbe’’ le CO2 et le transforme en MOP ou MOD.
2) Le MOD commence la boucle avec des bactéries hétérotrophes et produit des nutriments inorganiques et libère du CO2 dans l’environnement.
3) Le MOP, à l’aide de bactéries hétérotrophes, va vers le zooplancton, qui lui produit du CO2 et le libère dans l’environnement.
Quelle est la différence entre MOP et MOD?
MOP : matière organique particulaire
MOD : matière organique dissoute
Nommez des facteurs de contrôle des réseaux trophiques.
- La nature et la concentration des nutriments
- La température
- Les vents
- La pollution
Le milieu marin côtier est…
Enrichi en éléments nutritifs provenant des fleuves et de la pluie.
–> prédominance du réseau trophique classique avec une forte biomasse phytoplanctonique.
Le large marin est…
Plus pauvre en nutriments.
–> Prédominance de la boucle microbienne.
Dans quoi peut se retrouver la variabilité des environnements aquatiques?
Dans la diversité des micro-organismes qui le peuplent.
Nommez les différents groupes de bactéries aquatiques.
- Cyanobacteria : prochlorococcus et synechococcus.
- Proteobacteria : alphaproteobacteria, roseobacteriaceae et gammaproteobacteria.
Les cyanobacteria sont des bactéries Gram positif ou négatif?
Gram NÉGATIF.
Décrivez les Prochlorococcus.
- Cyanobactéries circadiennes.
- Le plus petit diamètre
- abondant organisme photosynthétique au monde
- Contient des pigments photosynthétiques (Chl a2 et Chl b2)
- Écotypes : sont différents dans leurs distributions géographiques, dans l’adaptation à des intensités lumineuses, utilisation des sources d’azote.
Décrivez les synechococcus.
- Cyanobactéries circadiennes
- Abondantes
- Petite taille
- Assez grand génome (2.4 Mbp)
- GÉNÉRALISTE : capable de s’adapter à des environnements différents.
Nommez les différences entre Prochlorococcus et Synechococcus quant à leur stratégie envers la lumière.
- Prochlorococcus : + apte à capter la lumière à l’aide des pigments photosynthétiques Chl a2 et Chl b2.
- Synechococcus : capable de s’adapter aux qualités de lumières différentes à l’aide de la phycoérythine et la phycocyanine.
Décrivez les Pelagibacterales (Alphaproteobacteria).
- 25 à 50% des bactéries des eaux de surface et des eaux mésopélagiques.
- La + fréquente : Pelagibacter ubique.
Décrivez Pelagibacter ubique.
- Isolée par ‘‘high-throughput’’ méthode
- Rôle important dans le cycle du carbone
- Possède le plus PETIT génome des organismes capables de réplication indépendant.
- Une des plus petites cellules connues
- Contient tous les gènes nécessaires pour la biosynthèse des acides aminés et la plupart des cofacteurs.
- Contient très peu de protéines de régulation
- Contient très peu d’ADN non fonctionnel ou redondant.
Décrivez les Roseobacteriaceae.
- Physiologiquement très diversifiée : aérobes (hétérotrophes/phototrophes) ou anaérobes (photosynthèse anoxique)
- Dérivent d’un ancêtre photosynthétique et non d’un ancètre hétérotrophe
- ESSENTIELLES dans le cycle du soufre marin.
Quel est le ‘‘rôle’’ des roseobacter dans le cycle du soufre marin?
- Sont capables de cliver et de déméthyler le DMSP (pour avoir du DMS).
Décrivez les Gammaproteobacteria.
- 30 à 90% des bactéries du milieu pélagique
- Plus on descend en profondeur, plus leur abondance est élevée
Quelles sont les Gammaproteobacteria les plus présentes en dessous de 1000 (profondeur)?
Les Alteromonaldales.
Quelles sont les Gammaproteobacteria présente à 50% dans les eaux de surface et 30-40% en profondeur?
Les Oceanospirillales.
Décrivez les Pseudomonadales et Virbionales (Gammaproteobacteria)
- Abondance constante dans toute la colonne d’eau
- Jusqu’à 40% des gammaproteobactéries de surface.
Décrivez les algues rouges (rhodophycées).
- Majoritairement dans les eaux douces
- Mode de vie : indépendantes, réunies en amas ou en cordons
- Pigment rouge : phycoéryhtrine + accessoirement un pigment bleu (phycocyanine)
- Dans les parois des algues rouges : matrice composée de polymères sulfatés du galactose.
