Cours 5 Flashcards

(42 cards)

1
Q

Quelles sont les quatre bases (nucléotides) de l’ADN?

A

Adénine (A), Guanine (G), Cytosine (C), Thymine (T)

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Q

Quelles sont les pyrimidines et quelles sont les purines?

A

Purines : Adénine (A), Guanine (G)
Pyrimidines : Cytosine (C), Thymine (T)

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Q

Quels sont les ratios de Chargaff qui définissent la composition en nucléotides de l’ADN?

A

Il y a autant de A que de T et de G que de C
A =T
G = C
La somme des purines est égale à la somme des pyrimidines A + G = T + C

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4
Q

Quelles sont les caractéristiques de la structure de l’ADN :
a. Comment les nucléotides sont-ils attachés les uns aux autres?

A

Par des liaisons phosphodiesters entre le groupe phosphate du carbone 5’ d’un nucléotide et le groupe -OH du carbone 3’ du sucre du nucléotide précédent (5’ vers 3’).

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5
Q

Quelles sont les caractéristiques de la structure de l’ADN :
b. Quelle est l’orientation d’un brin par rapport à l’autre?

A

Antiparallèle, un brin est orienté 5’ vers 3’ et l’autre 3’ vers 5’.

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6
Q

Quelles sont les caractéristiques de la structure de l’ADN :
c. Quelles bases sont complémentaires?

A

A =T
G = C
A + G = T + C

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7
Q

Quelles sont les caractéristiques de la structure de l’ADN :
d. Quel type de lien permet aux brins complémentaires d’interagir?

A

Lien hydrogène

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8
Q

Que signifie l’expression « réplication semi-conservative »?

A

Le produit de la réplication de l’ADN sera deux molécules composées d’un brin mère et d’un nouveau brin.

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9
Q

Combien d’origines de réplication sont présentes dans un génome d’une bactérie typique?

A

Une origine de réplication sur son chromosome circulaire

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10
Q

Une origine de réplication génère combien de « fourches » de réplication chez une bactérie?

A

Une origine de réplication génère deux fourches.

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11
Q

Trouve-t-on une seule origine de réplication par chromosome eucaryote?

A

Non, il y en a plusieurs

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12
Q

La structure des gènes codant pour des protéines est-elle identique entre les procaryotes et les eucaryotes?

A

Non, elle n’est pas identique.

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13
Q

Quelles différences trouve-t-on à l’intérieur des séquences codantes?

A

Chez les procaryotes, les séquences sont continues et sans introns. Les ARN ont la même séquence que les gènes inscrit dans le génome.
Chez les procaryotes, les séquences codantes sont fragmentées par des introns et des exons.
Un intron est un morceau d’ADN non-codant. On doit les enlever pour coller les portions codantes (exons) ensemble dans les ARNms. Il faut donc une transcription initiale chez les eucaryotes pour former un pré-ARN, pour ensuite enlever les introns et coller les exons pour former l’ARNm final.
Un exon contient les codons.

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14
Q

La complexité des espèces, tel que les humains, est-elle simplement expliquée par le nombre de gènes, la quantité d’ADN ou le nombre d’exons par gène?

A

La complexité des espèces est corrélée avec la quantité d’introns/exons.

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15
Q

Pourquoi les espèces aux plus petits génomes, autant dans la taille que dans le nombre de gènes, sont-elles souvent des parasites obligatoires ou des endosymbiotes?

A

Vu que celles-ci sont réduites en fonctions physiologiques dû au petit nombre de gènes, l’hôte fourni beaucoup de protéines et d’autres fonctions nécessaires pour faire vivre ces espèces aux petits génomes. Sans l’hôte, elles ne pourraient pas vivre.

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16
Q

Quelles sont les bases de l’ARN?

A

Adénine (A), Guanine (G), Cytosine (C), Uracile (U)

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17
Q

En quoi les bases de l’ARN sont-elles différentes de l’ADN?

A

Thymine (T) est remplacé par Uracile (U)

18
Q

Dans un génome, est-ce que les deux brins d’ADN peuvent servir de matrice pour la transcription des gènes?

A

Oui, tout dépend de l’orientation du gène dans le génome.

19
Q

Quelle est l’orientation de la synthèse de l’ARN?

A

5’ vers 3’.

20
Q

Dans la diapo. 26, quel est le brin matrice et quel est le brin codant?

A

Le brin matrice est le brin du bas (3’ vers 5’) et le brin codant est le brin du haut (5’ vers 3’).

21
Q

Sur le brin matrice, dans quelle orientation voyage la polymérase?

A

De 3’ vers 5’.

22
Q

À la séquence de quel brin correspond la séquence de l’ARNm?

A

Elle correspond à celle du brin codant. (brin-codant et ARNm on la même séquence).

23
Q

À quelle extrémité de l’ARNm la polymérase ajoute-t-elle le nouveau ribonucléotide?

A

La polymérase ajoute le nouveau nucléotide à l’extrémité 3’ de l’ARNm en formation (ARNm s’allonge du 5’ vers le 3’).

24
Q

À quoi sert le promoteur d’un gène?

A

C’est une région qui permet de promouvoir l’expression d’un gène. Le promoteur est utile à la polymérase pour qu’elle puisse reconnaitre un morceau d’ADN comme étant un gène, pour ensuite commencer la transcription.

25
Qu’arrive-t-il au pré-ARN dans les cellules eucaryotes?
Il doit subir plusieurs modifications pour devenir un ARNm mature prêt à être traduit en protéine; ajout d’une coiffre en 5’, ajout d’une queue pooly-A en 3’ et épissage. L’ARNm mature sera exporté du noyau vers le cytoplasme où il pourra être traduit en protéine par les ribosomes.
26
Comment un gène peut-il encoder différentes protéines?
Grâce à l’épissage alternatif (enlever les introns et recoller et recombiner les exons particuliers ensemble), les organismes complexes utilisent cet outil pour produire à partir d’un même gêne plusieurs versions d’ARNm, donc plusieurs versions de protéines.
27
Qu’est-ce qu’un codon?
Une séquence de trois nucléotides sur une ARNm.
28
Pourquoi dit-on que le code génétique est « dégénéré »?
Car certains codons encodent pour le même acide aminé.
29
Quel type de mutation entraîne un décalage dans le cadre de lecture?
Mutation par décalage du cadre de lecture.
30
Combien de nucléotides faut-on insérer ou déléter pour ne pas affecter le cadre de lecture?
Trois nucléotides.
30
Quelle est la conséquence d’un cadre de lecture décalé pour la séquence d’une protéine?
Un cadre de lecture décalé change toute la suite d’acides aminés après la mutation, ce qui donne une protéine anormale ou inactive. (Structure différente, protéine incomplète = non fonctionnelle, ne peut remplir son rôle)
31
Est-ce que le codon AUG est le seul codon d’initiation possible lorsqu’on inspecte toutes les espèces vivantes?
Non, il y en a trois. Codons start : AUG, GUG, UUG
32
Qu’est-ce qu’un « cadre de lecture ouvert »?
Séquence dans l’ADN où un codon start est séparé d’un codon stop par un nombre de nucléotides divisible par 3. Un tel segment code pour un polypeptide.
33
Sur quel brin d’ADN pourrait-on retrouver un cadre de lecture ouvert? (codant ou matrice)?
Sur le brin codant, mais il est transcrit à partir du brin matrice.
34
Quelle partie de l’ARN de transfert (ARNt) permet la reconnaissance du codon de l’ARNm?
L’anti-codon.
35
Quelle est l’orientation de l’ARNt par rapport à l’ARNm?
L’anti-codon de l’ARNt s’associe au codon de l’ARNm selon une orientation antiparallèle. L’anti-codon de l’ARNt est lu dans le sens 3’ vers 5’.
36
Quelle est la position « flottante » (« wobble ») dans l’anticodon?
Certains nucléotides en 3ième position de l’anticodon peuvent s’apparier avec deux ou même trois nucléotides différents. Le bout 5’ de l’anti-codon a une certaine flexibilité et peut accommoder plusieurs types d’associations de nucléotides.
37
À quelle position du codon de l’ARNm correspond la position flottante de l’anticodon?
Le bout 5’ de l’anti-codon. L’anti-codon de l’ARNt est lu dans le sens 3’ vers 5’, donc la première base de l’anti-codon (en 5’) s’apparie avec la troisième base du codon de l’ARNm en 3’.
38
Quel est l’avantage de la position flottante de l’anticodon?
Cela permet à une même molécule d’ARNt de reconnaitre plusieurs codons différents qui codent pour un même acide aminé, ce qui réduit le nombre d’ARNt nécessaires pour traduire tous les codons (économi pour la celllule). Le wobble permet une traduction plus rapide et efficace.
39
Comment reconnaît-on l’effet de la position flottante dans le code génétique? (indice : codons UUU et UUC codent pour Phe, donc l’ARNt phe peut reconnaitre ces deux codons différents)
La première base (5’) de l’anti-codon peut s’apparier flexiblement avec U ou C. Lorsque plusieurs codons diffèrent uniquement par leur 3e base mais codent pour le même acide aminé, cela reflète le wobble qui permet à un même ARNt de reconnaitre ces codons via un appariement flexible.
40
Dans quels types de génomes retrouve-t-on des exceptions au code génétique?
Les génomes mitochondriaux (eucaryotes simples) et les génomes de certaines bactéries et archées.
41
Connait-on des codes génétiques complètement alternatifs naturels?
Non, tous les exemples sont des petites dérives du code génétique principal et explicable par des mutations simples; aucun organisme vivant avec un code génétique significativement différent et indépendant n’a été découvert.