Cours 12 Flashcards

(36 cards)

1
Q

Qu’est-ce que l’assortiment positif?

A

= les individus se reproduisent préférentiellement en fonction de leur similitude phénotypique.

  • Phénotypes et génotypes soumis à l’assortiment positif ou négatif ne sont pas en équilibre dans une population.
  • Union au hasard mène à l’établissement de l’équilibre de Hardy-Weinberg.
  • Ex.: Homogamie.
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Q

Pouvez-vous donner un exemple d’assortiment positif?

A

Homogamie : très complexe chez les humains (assortiment positif en fonction de la taille corporel, mais aussi ethnicité, statut social, etc.

Chez les plantes, c’est en fonction du moment de la floraison (ex.: assortiment positif pour les plantes à floraisons précoce).

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3
Q

Quelle est la conséquence de l’assortiment positif sur les fréquences génotypiques d’une population?

A

Augmentation de la fréquence des homozygotes, diminution de l’hétérozygosité de la population.

Change les fréquences génotypiques mais pas les fréquences alléliques.

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4
Q

Est-ce qu’une population qui subit l’assortiment positif est à l’équilibre de Hardy-Weinberg?

A

Non, car l’assortiment positif viole l’hypothèse d’union au hasard.

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5
Q

Qu’est-ce que l’assortiment négatif?

A
  • Ex.: reproduction sexuée, car maintient du sex-ratio (ratio 50/50?) dans les populations.
  • Assortiment négatif chez les humain: allèles des loci du complexe majeur d’histocompatibilité (MHC), situé sur le sur le chromosome 6.
  • Chez les plantes: auto-incompatibilité des gamètes et variétés de fleurs: soient longistylées (Étamines courtes + style long) ou brévistylées (aka hétérostylie ; Étamines longues + style court)
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6
Q

Pourquoi la reproduction sexuée est-elle considérée un assortiment négatif?

A

Car maintien du sex-ratio (ratio 50/50), ce qui favorise la rencontre d’individus différents mâles/femelles.

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7
Q

Pourquoi plusieurs angiospermes (plantes à fleurs) ont-elles évolué des mécanismes divers pour forcer l’assortiment négatif?

A

Pour limiter l’autofécondation.

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8
Q

Quelle est la conséquence de l’assortiment négatif sur les fréquences génotypiques d’une population?

A

Augmentation des hétérozygotes au détriment des homozygotes (fréquence des hétérozygotes >2pq —> et donc moins de p^2 et q^2). Maintien de la variabilité génétique dans la population.

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9
Q

Quel est l’effet de l’isolement par la distance sur les fréquences génotypiques d’une population étalée sur un grand territoire?

A
  • Populations immobiles sont séparées
  • Mène à la formation de gradients de fréquences alléliques et à un déficit en hétérozygotes par rapport à la loi de l’équilibre.
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10
Q

Quel est le risque individuel de l’endogamie chez les humains?

A

Augmente le risque que la progéniture soit homozygote pour un allèle nocif (létal ou déterminant une maladie héréditaire).

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11
Q

Qu’est-ce que l’autre nom pour l’endogamie?

A

= consanguinité

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12
Q

Qu’est-ce que le coefficient de consanguinité?

A

La probabilité que deux allèles se retrouvent à l’état homozygote chez la progéniture d’un couple consanguin car ils proviennent d’un ancêtre commun.

Plus l’encêtre commun est loin dans l’arbre, plus la prop d’être homozygote est basse.

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13
Q

Comment calcule-t-on le coefficient pour un individu particulier?

A

Avec cette formule : Fi = (1/2)^n (1+Fa)

  • On multiplie 1⁄2 chances pour chaque génération
  • On estime la probabilité que l’ancêtre A soit aussi homozygote (ex.: 1/2, 2/3, etc).
  • On additionne les probabilités pour les deux allèles.
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14
Q

Dans la formule pour calculer la consanguinité Fi = (1/2)^n (1+Fa), que signifie la variable « n »?

A

n = nombre total d’individus dans une chaîne de parenté en excluant l’individu pour lequel on calcule le coefficient de consanguinité

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15
Q

Dans la formule pour calculer la consanguinité Fi = (1/2)^n (1+Fa), que signifie la variable « Fa »?

A

Fa : Coefficients de consanguinité des ancêtres. Arrondi à 0 si c’est négligeable, sinon doit être calculé individuellement avec la même formule.

Si un ou l’autre des ancêtres était déjà homozygote, les chances de transmettre cet allèle dans les générations seraient plus grandes ((1+Fa) >1)

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16
Q

Quel est l’effet de la consanguinité sur les fréquences génotypiques d’une population?

A
  • Augmentation de la fréquence d’homozygotes (= homozygotie par filiation) et réduction des hétérozygotes. Les fréquences alléliques = inchangées.
  • Effets négatifs sur populations hétérogamiques (va causer une accumulation des allèles récessives rares).
  • Dépression endogamique: baisse de la vigueur et de la fertilité souvent observée chez les animaux forcés de se reproduire par endogamie. Pas systématiquement observé dans tout les croisements (ex.: drosophiles pas évident), effet du hasard aussi (dérive génétique).
17
Q

Comment calcule-t-on (ou estime-t-on) le coefficient de consanguinité d’une population?

A

Est égal à la moyenne des coefficients Fi de tous les membres de cette population.

18
Q

Pourquoi la consanguinité cause-t-elle des effets néfastes sur la santé de populations qui se reproduisent habituellement par hétérogamie?

A

Comme mentionné à la question 6, va causer une accumulation des allèles récessives rares.

19
Q

Qu’est-ce que la sélection?

A

Taux différentiel de survie et de reproduction.

On « choisit » les mutations déterminant les phénotypes les mieux adaptés, ce qui aboutit à des changements dans les fréquences génotypiques et alléliques.

20
Q

Quels sont les deux paramètres individuels qui peuvent être affectés par la sélection?

A

La survie et la reproduction.

21
Q

Comment la sélection affecte-t-elle les deux types de fréquences (allélique et génotypique) dans la population?

A

Fréquences génotypiques influencées par W (fitness). Le plus fit = 1, le moins = 0 (meurt).

Pour les fréquences alléliques, c’est le type de sélection qui va modifier la tendance, par exemple une sélection directionnelle va favoriser un allèle plus qu’une autre, changeant ainsi la fréquence dans la population.

22
Q

Que signifie la valeur adaptative relative (W)?

A

La probabilité relative de survie et le taux de reproduction d’un génotype (phénotype).

23
Q

Quelle valeur aura la valeur adaptative relative du (ou des) génotype le plus fit?

24
Q

Qu’est-ce que la sélection directionnelle?

A

Variations des fréquences alléliques résultant de la sélection agissant pendant de nombreuses générations envers des allèles favorables ; allèle dominant masque allèle récéssive (cause persistance des hétérozygotes)

25
Qu’est-ce que la sélection directionnelle positive?
Il va y avoir un plateau pour les deux allèles (dominants et récessifs) après un moment.
26
Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle dominant n’atteint-elle la fixation de l’allèle que très lentement dans les générations?
Parce que l’allèle dominant masque l’allèle récessive, ce qui cause une persistance des hétérozygotes.
27
Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle récessif atteint-elle la fixation de l’allèle plus rapidement que dans le cas d’un allèle dominant?
Parce que la sélection élimine rapidement les homozygotes dominants défavorables, et les hétérozygotes expriment le récessif seulement quand il devient fréquent → fixation plus rapide une fois présent.
28
Qu’est-ce que la sélection directionnelle négative (aka sélection « purificatrice ») ?
Perte d’un allèle défavorable chez une population de laboratoire de drosophile.
29
Quel est l’effet de la sélection purificatrice sur la fréquence d’un allèle défavorable?
Perte d’un allèle défavorable chez une population de laboratoire de drosophile.
30
Qu’est-ce que la sélection stabilisante? Quel génotype est favorisé?
Sélection en faveur de l’hétérozygote, puis un équilibre est atteint lorsque la valeur adaptative des hétérozygotes est supérieure à celles des homozygotes (fréquences alléliques tendent vers des valeurs stables). Cette valeur à l’équilibre ne dépend pas des fréquences alléliques du départ, dépend juste du fitness (valeurs adaptatives)
31
La sélection stabilisante dépend-elle de la fréquence des allèles?
Oui, mais pas celle du dépard.
32
Dans le cas de l’anémie falciforme, pourquoi la fréquence de l’allèle HbS est-elle élevée dans certaines populations en Afrique?
À cause d’un effet de surdominance (lorsque le fitness de l’hétérozygote est plus fort que les homozygotes : dominant ou récessif). Ici, plus avantageux d’être hétérozygote car peut survivre contre la malaria.
33
Comment peut-on reconnaître un événement de sélection positive récent dans une population en observant les marqueurs génétiques (polymorphismes)?
Grâce au taux de fixation des allèles (allèle présent à 100% dans population), il peut être possible de voir un balayage sélectif où tous les haplotypes de la population sont identiques. C’est suite à la sélection d’un allèle favorable. Les loci qui sont en désequilibre de liaison (LD) avec cet allèle augmentent aussi leurs fréquences.
34
Qu’est-ce qu’un « balayage sélectif »?
tous les haplotypes de la population sont identiques.
35
Comment peut-on reconnaître un locus sous effet de sélection stabilisante?
La sélection stabilisante (en faveur de l’hétérozygote) peut mener à une grande diversité génétique (comme pour le locus MHC, le complexe majeur d’histocompatibilité). Cette diversité pourrait être du à une plus grande résistance des hétérozygotes aux maladies infectieuses et facilité par les mécanismes d’assortiment négatif.
36
Valeur du coefficient de consanguinité typique dans une union entre cousins?
Fi = 1/16 = 0,0625