Cours 4 Flashcards

(60 cards)

1
Q

Si l’allèle de type sauvage est haplo-suffisant les mutations sont généralement dominantes ou récessive?

A

Généralement récessives, parce que la plupart des mutations cause perte de gène.

Si mutation dans un allèle seulement (exemple milieu) –> mutation à effet dominant.

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Q

Comment déterminer le type d’interaction (dominance complète/incomplète, codominance, etc) en comparant le phénotype des hétérozygotes avec ceux des homozygotes?

A
  • Dominance complète = si l’hétérozygote a le même phénotype que l’homozygote dominant.
  • Dominance incomplète = si l’hétérozygote a un autre phénotype.
  • Codominance = si l’hétérozygote exprime les deux phénotypes.
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3
Q

L’allèle de type sauvage est haplo- insuffisant (une seule « dose » du produit du gène ne peut pas assurer la fonction normale) Cette condition est souvent rencontrée pour les gènes qui ont une fonction….?

A

régulatrice

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4
Q

SI un allèle muté est dominant- négatif, le produit du gène muté interfère avec le produit du gène de type sauvage et l’empêche de fonctionner normalement. Cette condition est souvent rencontrée pour quels genre de gènes?

A

Gènes qui codent pour des protéines dont la forme fonctionnelle regroupe plusieurs sous-unités (protéines dimériques, tétramériques; multimériques)

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5
Q

Que signifie le terme haplo-suffisant pour un allèle de type sauvage?

A

Haplo-suffisant = un seul allèle fonctionnel d’un gène est suffisant pour produire le phénotype normal, même si l’autre allèle est inactivé ou supprimé.

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6
Q

Quelle est la nature (dominante ou récessive) des mutations « perte de fonction » pour un gène dont l’allèle sauvage est considéré haplo-suffisant?

A

Récessives.

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7
Q

Dans quels gènes sont retrouvés des mutations dominantes causées par haplo-insuffisance du type sauvage?

Et par un dominant-négatif?

A

Haplo-insuffisance = souvent chez gènes qui ont une fonction régulatrice.

Dominant-négatif = chez gènes qui codent pour des protéines qui regroupe des sous-unités.

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8
Q

Qu’est-ce que la dominance incomplète?

A

C’est un effet de dosage où: 2 doses de d’allèle W par exemple = 2 doses de pigment.

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9
Q

Quel est le ratio des phénotypes qu’on pourrait obtenir dans un croisement monohybride où il y a dominance incomplète?

A

1:2:1

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10
Q

Qu’est-ce que la co-dominance?

A

Deux génotypes sont dominants de façon égale.

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11
Q

Dans l’exemple de l’anémie falciforme, pourquoi est-il possible de conclure qu’il existe trois types d’interactions entre l’allèle normal (HbA) et l’allèle défectueux (Hbs)?

A

Pourquoi = parce que la dominance dépend du niveau d’analyse (moléculaire, cellulaire, phénotypique).

  • Niveau de l’organisme (expression de la maladie): dominance de HbA sur HbS
  • Niveau cellulaire: dominance incomplète de HbA sur HbS
  • Niveau moléculaire: codominance dans l’expression des protéines.
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12
Q

Qu’est-ce qu’un allèle à effet récessif létal? Quel rapport phénotypique obtient-on dans un croisement monohydride avec un tel allèle?

A
  • Allèle à effet récessif létal = tout allèle récessif qui provoque, a l’état homozygote, une maladie telle, que l’individu décède avant l’âge reproducteur.
  • Ratio = 2:1
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13
Q

Peut-il exister un allèle à effet létal dominant?

A

Oui, il peut exister des allèles létaux dominants (ex : chorée de Huntington), mais ils sont souvent viables jusqu’à l’âge adulte (sinon, ils disparaîtraient vite de la population).

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14
Q

Que signifie un allèle à effet pléiotropique?

A

Allèle avec plusieurs rôles, causé par une seule mutation, qui influence la formation de multiples traits semblant indépendants (ex.: gène Agouti pour la couleur des souris jaunes).

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15
Q

Qu’est-ce qu’un mutant auxotrophe?

A

Auxotrophe = mutant déficient en une voie de biosynthèse d’une composante cellulaire essentielle. Incapable de croître sur un milieu minimal, besoin qu’il soit supplémenté d’une substance organique particulière (acide aminé, vitamine, base azotée etc.).

Contraire d’un organisme prototrophe.

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16
Q

Comment les mutants auxotrophes permettent-ils de comprendre les voies de biosynthèse de molécules essentielles?

A

Selon Beadle et Tatum, chaque mutant est touché par un gène différent et comme, selon eux, chaque gène est associé à une enzyme, qui catalysent des réactions différentes dans une même voie de biosynthèse, on peut plus facilement voir les différences.

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17
Q

Si deux mutants ont des « patrons d’auxotrophie » différents, c’est-à-dire qu’ils arrivent à pousser si on supplémente les milieux de culture avec des molécules différentes, que cela signifie-t-il?

A

= Mutations dans des gènes différents, affectant d’autres enzymes de la voie de biosynthèse.

Leurs blocages sont donc à des étapes différentes de la chaîne de réactions.

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18
Q

Quelles sont les étapes afin d’établir le contrôle génétique d’un phénotype?

A

1 - Obtenir des mutants en utilisant un mutagène.

2 - Vérifier que les mutations sont monogéniques.

3 - Déterminer si les mutations sont alléliques (se demander s’ils appartiennent-elles à un locus ou plusieurs loci)

4 - Combiner les mutations chez les mêmes individus en créant des mutants doubles pour constater si les gènes interagissent.

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19
Q

Étapes du contrôle génétique d’un phénotype : Combiner les mutations chez les mêmes individus en créant des mutants doubles pour constater si les gènes interagissent.

Comment faire pour y arriver?

A

Avec analyse de croisements dihybride pour voir les interactions géniques.

  • Les interactions géniques aboutissent à des phénotypes aux rapports mendéliens modifiés en F2 : peut être une épistasie récessive/dominante, phénomène de suppression ou phénotype létal synthétique.
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20
Q

Comment pouvez-vous vérifier si le phénotype d’un mutant que vous tenez sous la main est bel et bien causé par une seule mutation (monogénique)?

A

Se fait avec un simple croisement, puis croisement-test des mutants monogéniques avec type sauvage.

  • Si F2 = 50% mutants -> monogénique, donc une seule mutation cause le phénotype.
  • Si F2 = 25% mutants (ou moins) -> polygénique, donc plus d’une mutation causent le phénotype
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21
Q

Comment pouvez-vous vérifier si les mutants causant un même phénotype que vous avez sous la main sont alléliques?

A

Se fait avec le test de complémentation (= test d’allélisme fonctionnel), s’applique aux mutations récessives.

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22
Q

Quel est le principe d’un test de complémentation?

Quel(s) type(s) de phénotype(s) muté(s) peut-on analyser avec le test de complémentation (récessif?, dominant?)?

A

On doit d’abord : (1) croiser les mutants entre eux pour obtenir des hétérozygotes puis (2) observer le phénotype de l’hétérozygote.

  • Si le phénotype est muté = mutations ne complémentent pas. (donc même gène, ce qui veut dire phénotype récessif)
  • Si phénotype normal = mutations se complément, et donc mutations sont sur des gènes différents = non alléliques. Donc dominant.
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23
Q

Qu’est-ce qu’un groupe de complémentation?

A

L’ensemble des mutations qui affectent le même gène (locus) mais qui ne peut pas restaurer le phéno initiale.

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24
Q

Dans l’exemple de l’explication biochimique de la complémentation, quels mutants sont dans le même groupe de complémentation? ($, £, ¥)

A
  • Mutant $ et Mutant £ bloquent la même étape = même groupe de complémentation.
  • Mutant ¥ est dans un gène différent = autre groupe.
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25
Qu’est-ce qu’un « double mutant » ?
Mutant qui porte deux mutations combinées, dans deux gènes différents.
26
Comment obtient-on les rapports d’un croisement dihybride en F2 (diapo 31) ?
Avec l'assortiment indépendamment (Loi de Mendel).
27
Quel outil de travail développé par Punnett permet de vérifier l’obtention du rapport 9 :3 :3 :1? Et pourquoi dit-on que lorsqu’on obtient un tel rapport, cela signifie qu’il n’y a pas d’interaction génétique?
Grille de Punnett Pas d'interactions car les deux gènes contribuent chacun indépendamment au phénotype.
28
Pourquoi dit-on qu’un croisement dihybride avec un rapport phénotypique 9 :7 signifie une interaction génétique?
9:7 = 9 dominants 7 mutés : donc gènes participant à la même voie biochimique ou au même réseau régulateur (= épistasie récessive) --> Loi de Mendel ne tiens pas
29
Que signifie le terme épistasie?
Épistasie: le phénotype d’une mutation surpasse celui d’une autre. Peut être récessive (ex.: gène de la fourrure brun des golden retrievers est récessif sur l’allèle du pigment noir) ou dominante (présence d’un seul allèle dominante surpasse les effets des allèles d'un autre gène).
30
Dans l’exemple d’épistasie récessive de la diapo 34, quel allèle à l’état homozygote est épistatique sur l’autre?
w est épistasique sur le m
31
Dans l’exemple d’épistasie récessive de la diapo 35 (les labradors), pourquoi le génotype du phénotype « golden » est-il -/-; e/e?
Car l’allèle e est épistatique (donc domine) sur b
32
Qu’est-ce qu’un suppresseur génétique? Comment pourriez-vous distinguer un mutant suppresseur d’un révertant?
Suppresseur = allèle muté d’un gène qui annule l’effet de la mutation d’un autre gène. Une suppression n’est pas une réversion même si résultat similaire (en microbio, révertant = génotype revient à son état sauvage après 2e mutation), suppression = autre mutation ailleurs qui annule effets. Même phénotype mais pas même génotype.
33
Avantage de la suppression?
Permet d’identifier enzymes qui pourraient avoir fonctions similaires pour pousser recherches
34
Dans le croisement des diapos 38/39 sur la suppression, en assumant que les gènes ne sont pas liés, on obtiendrait un ratio phénotypique type sauvage : mutant de 3 :1; tandis que dans l’exemple de suppression de la diapo 40 on obtient un ratio 1 :1. Comment expliquer ce résultat?
obtient 1:1 car le test est fait avec un croisement qui n'est pas un F2, donc réduit ségrégation.
35
Qu’est-ce que la léthalité synthétique?
Se produit lorsque deux gènes dont la mutation donne un phénotype viable, mais dont le double mutant mène à la léthalité. Est souvent signe de redondance fonctionnelle (=souvent dans gènes essentiels, offre résilience génétique contre mutations, gènes vont compenser s’il y a mutation qui fait en sorte que peut pas se lier).
36
Léthalité synthétique : pourquoi le ratio phénotypique en F2 possède-t-il un dénominateur de 15 plutôt que 16? (par exemple 9 :3 :3 plutôt eu 9 :3 :3 :1)
Donne un ratio 9:3:3 en F2 car le double mutant (le 1 manquant au ratio) est mort.
37
Quelle est la différence entre léthalité synthétique et récessif létal (vu à la diapo 12 par exemple)?
Létalité synthétique = 2 allèles touchés Létalité récessive = 1 seul allèle.
38
Qu’est-ce que la pénétrance d’un trait phénotypique?
= le pourcentage d’individus portant un allèle et qui en expriment le phénotype associé.
39
Que signifie une pénétrance incomplète? Et par quoi cela est-il causé?
Lorsque certains individus porteurs d’un allèle(s) (souvent considéré dominant) n’expriment pas le phénotype. Causes possibles: Influence de l’environnement ou d’autres gènes, subtilité dans le phénotype difficile à observer)
40
Que signifie « expressivité variable » en parlant d’un trait?
Un phénotype qui montre de la variabilité dans son expression. Ex.: corpuscule de Barr.
41
Peut-on observer à la fois une pénétrance incomplète et une expressivité variable?
Oui, et peuvent compliquer l’analyse génétique.
42
Qu’arrive-t-il aux produits de la méiose (microspores) dans les fleurs mâles? Et des macrospores dans les fleurs femelles?
Microspores --> gamétophytes mâle (pollen) --> noyau végétatif. En même temps : macrospore se dupliquent et forment gamétophyte femelle (sac embryonnaire). Les deux gamétophytes mâle et femelles se joignent pour former une structure triploïde qui va donner la structure de la graine.
43
Combien de noyaux haploïdes retrouve-t-on dans le gamétophyte mâle? Et dans le gamétophyte femelle? Ces noyaux respectifs sont-ils génétiquement identiques?
Gamétophyte mâle = 2 noyaux identiques (sexuels) et 1 différent (végétatif) Gamétophyte femelle = 7 noyaux identiques et 1 différent (1 oosphère, 3 antipodes, 2 synergides, etc)
44
Comment appelle-t-on les structures du grain de maïs?
Péricarpe: * Enveloppe du grain. * Tissu diploïde d’origine maternelle. Albumen (endosperm) : * Tissu triploïde qui vient de 2 noyaux femelles (caryon) et 1 noyau mâle (gamète accessoire). * Contient les réserves nutritives du grain. Aleurone: * Couche extérieure de l’albumen, sous le péricarpe. * Tissu triploïde formé d’une couche de cellules riches en protéines et qui secrètent (quand environnement optimal pour germination) des enzymes hydrolytiques pour la digestion des réserves nutritives.
45
Quelles sont les origines et le génotype de l’embryon?
Issu de l’union d’un gamète mâle (n) et d’un gamète femelle (n). Il est diploïde (2n) et génétiquement constitué pour moitié de gènes maternels et pour moitié de gènes paternels.
46
Quelles sont les origines et le génotype de l’albumen et de l’aleurone?
Albumen = 3n, formé par la fusion d’un 2e gamète mâle (n) avec les 2 noyaux polaires (n+n) de la cellule centrale du sac embryonnaire. Aleurone = 3n (triploïde), comme l’endosperme dont elle est issue.
47
Est-il possible d’avoir un grain de maïs avec un *embryon* au génotype AA et un *albumen* au génotype Aaa?
Non, car implique que la plante mère soit à la fois AA et aa
48
Est-il possible d’avoir un grain de maïs au *péricarpe* de génotype AA avec un *albumen* au génotype Aaa?
Non, problème avec la ploidie.
49
Est-il possible d’avoir un grain de maïs avec un *embryon* au génotype Aa et un *péricarpe* au génotype AA?
Oui, car péricarpe provient uniquement du tissu maternel du fruit (toujours AA), tandis que l’embryon (2n) résulte de la fécondation entre un gamète mâle (ici a) et l’oosphère (A), donnant Aa.
50
Pourquoi est-il possible de déterminer le génotype d’un pollen au caractère amidon cireux (waxy) ou normal?
Amidon cireux = 100% amyloplectine (polymère branché) Pollen de type sauvage (normal) = 30% d’amylose (polymère linéaire, différent de l’autre sorte). + lugol de couleur différent, rare qu'on puisse voir différence à même les gamètes.
51
Pourquoi dit-on que l’expression du phénotype farineux de l’albumen dépend du dosage de chaque allèle?
Car donne soit un phénotype corné (albumen++f) ou farineux (albumen+ff). Ici, f = albumen farineux et + = albumen corné.
52
Comment fait-on pour produire des grains de maïs hybrides?
Dans les champs semenciers, les parents femelles sont “étêtés” (bout mâle est sectionnée avant maturité), puis récolte des semences hybrides se fera uniquement sur les parents femelles.
53
Observation d'un trait dominant doit toujours se faire dans un hétérozygote ou homozygote?
hétérozygote
54
Un gène dont l’allèle récessif est létal est un gène....
essentiel
55
Comment peux-t-on rétablir une voie biochimique avec le test de complémentation?
S'il y a complémentation des deux génotypes.
56
Définition d’un hétérocaryon?
Cellule fusionnée avec 2 noyaux et un seul cytoplasme.
57
Quand est-ce qu’un hétérocaryon (cellule fusionnée avec 2 noyaux et un seul cytoplasme) va avoir un phénotype normal (« sauvage ») ?
Si les mutations présentes dans les deux génomes haploïdes se sont produites dans deux gènes différents.
58
Définition de la redondance fonctionnelle?
= souvent dans gènes essentiels, offre résilience génétique contre mutations, gènes vont compenser s’il y a mutation qui fait en sorte que peut pas se lier.
59
Qu'est-ce qu'une plante monoïque?
Structures femelles et mâles à des endroits différents sur un même pied de maïs
60
Comment calculer le % de recombinaison (exercice 4-4)?
nbr de recombinants divisé par nbr de parentaux