Qu’est ce qu’une mutation?
Un changement transmissible dans le matériel génétique
Mutations géniques (aka ponctuel) ?
Mutations qui se produisent à l’intérieur de gènes individuels
Qu’est-ce qu’une mutation chromosomique ?
Changement qui affectent des chromosomes entiers ou des grandes parties de ceux-ci (indels, substitutions, etc
Qu’est-ce qu’une mutation de type transition?
Pouvez-vous nommer les quatre exemples de transitions?
Une transition est un type de substitution (remplacement d’une paire de nucléotides pour une autre) où une purine est remplacée par une autre purine, OU pyrimidine par une pyrimidine.
A -> G ou G -> A
C -> T ou T -> C
Qu’est-ce qu’une mutation de type transversion?
Pouvez-vous nommer les huit exemples de transversions?
Une transversion est un type de substitution (remplacement d’une paire de nucléotides pour une autre) où une purine est remplacée par une pyrimidine, ou vice-versa.
A → C
A → T
G → C
G → T
C → A
C → G
T → A
T → G
Expliquer ce qu’est un « indel »?
1 - Une ou plusieurs paires de nucléotides sont ajoutées ou enlevées à la séquence originale (si indel touche un multiple de 3 nucléotides; cadre est conservé).
2 - Changement de cadre de lecture (si indel est non-multiple de 3).
* Changement de tous les acides aminés à partir du point d’ins/del.
* Potentiel pour un codon STOP illégitime. –> Protéine tronquée
Comment une mutation dans une région codant pour une protéine peut-elle être silencieuse?
Est-ce qu’une mutation de type « indel » dans une région codante peut être silencieuse?
Mutation silencieuse = si le triplet muté code pour le même acide aminé (donc change le codon sans changer l’a.a)
Un indel ne peut pas être silencieux (sauf si insertion/délétion d’un triplet complet qui n’affecte pas la structure ni la fonction (rare).
Qu’est-ce qu’une substitution faux-sens conservatrice (neutre)? Non conservatrice?
Mutation faux-sens : le triplet muté code pour un acide aminé différent
- Conservatrice (neutre): le nouveau codon spécifie un acide aminé similaire à l’ancien. Conséquence est plutôt faible car structure pas trop changée (par ex.: changer a.a. chargé neg par un autre a.a. chargé negatif).
- Non conservatrice: le nouveau codon spécifie un acide aminé dissemblable (par ex.: changer a.a chargé négativement pour un a.a hydrophobe = change beaucoup structure).
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens?
Le triplet muté est un codon STOP illégitime = protéine va être tronquée (souvent non-fonctionelle), codons qui suivent ne sont pas traduits en a.a.
—> peut causer effets moins graves à plus grave selon localisation mutation (selon localisation de la mutation, début ou fin).
Quelle condition faut-il pour qu’une « indel » dans une région codante cause un changement de cadre de lecture?
si indel est non-multiple de 3
Les mutations géniques peuvent-elles avoir un effet si elles ne touchent pas des nucléotides encodant pour une protéine?
Quels types de régions pourraient subir des mutations et causer des effets fonctionnels?
Oui, par exemple les mutations dans des régions non-codantes ont généralement des effets moins prononcés que dans les régions codantes. Par contre, certaines mutations dans des régions régulatrices peuvent avoir des conséquences très importantes en modifiant l’expression des gènes.
- Régions promotrices, amplificateurs, silençeurs.
- Sites d’épissage dans les jonctions introns/exons.
Qu’est-ce qui distingue la réversion « vraie » de la réversion « équivalente »?
La réversion se produit au même site (même codon) que la mutation directe.
Réversion vraie : restaure le codon original (génotype original)
Réversion équivalente : restaure un codon différent pour le même acide aminé ou un codon pour un acide aminé synonyme (par ex.: même acide aminé mais codon différent / pas le même génotype mais même phénotype).
Qu’est-ce qui distingue une suppression extragénique d’une suppression intragénique?
Pourquoi la suppression intragénique est-elle plus difficile à identifier que la suppression extragénique? (indice : quel serait le résultat dans un croisement-test?)
La suppression : une mutation différente de la première, qui ramène au phénotype original.
Extragénique : mutation dans un gène différent (facile à découvrir, car lors d’un croisement avec type sauvage, descendants montrent mutations).
Intragénique : mutation dans le même gène, mais à un endroit différent –> beaucoup plus difficile à identifier car croisement classique n’aide pas, et elle est liée à la mutation originale.
Qu’est-ce qu’un tautomère?
Forme isomère d’une base = Même nombre d’atomes, mais changements dans les liens chimiques.
Soit forme céto (dans 99% des cas) ou forme énol (H attaché seul à un O, dans 1%).
Dans les tautomères, c’est rarement une pyrimidine en avant d’une autre, très souvent une purine en avant d’une pyrimidine ou vice-versa.
Comment les tautomères de bases dans l’ADN affecte-t-ils l’appariement des brins?
Quel type de mutation est généralement associé avec la tautomérisation? (transition ou transversion?
Est une source de mutations spontanées lors de la réplication de l’ADN (survient naturellement, par ex.: polymérase qui fait des erreurs, comme mettre un A en avant d’un G). D’abord un mésappariement, mais si pas réparé, devient une mutation.
Transition.
Un dommage à l’ADN est-il la même chose qu’une mutation?
Dommages à l’ADN = source de mutations.
Quel événements (mécanisme) peuvent causer la transformation d’un dommage à l’ADN en mutation?
- Formation de sites apuriniques : incorporation d’une base erronée (souvent A))
- Lésions oxydatives : arrêt de la réplication d’ADN et mène ensuite à des mutations de transversion ou transition .
- Déamination de la cytosine (cause uracil dans ADN) : Transversion G/C → T/A).
Pourquoi les régions répétées en tandem sont-elles plus à risque de mutations de type « indel »?
Car si polymérase décroche, brin se détache et se réassocie, peut se décaler d’un codon et faire une petite boucle à sa base, si polymérase reprend, cause erreur d’insertion ou délétion (indels), un type de mutation spontanée.
Un exemple d’addition : expansions trinucléotidiques (amplification de triplets répétés est à l’origine de plusieurs conditions génétiques rares, comme Huntington’s, X-fragile), dûe à un effet de glissment de la polymérase, réplique une seonced fois un brin
Quel type de mutations sont généralement causées par les analogues de bases azotées (= bases azotées non-conventionnelles, avec changement de protons par exemple)?
Causes mutations induites, comme transition A/T → G/C.
Quel type de mutations sont généralement causées par les « agents intercalants »?
L’agent intercalant (molécules avec structure planaire dûe à la présence de cycles qui rigidifient structure, créer distorsion ce qui déroule ADN), cause intercalage déforme la structure de l’ADN, provoquant l’insertion ou la déletion (Indels) d’un nucléotide lors de la réplication (exemple de mutation induite).
Quel est l’objectif du test d’Ames? Et comment s’y prendre?
But = détecter le pouvoir mutagénique d’un composé chimique, fait sur des micro-organismes.
On mesure la fréquence de réversion du phénotype d’une souche bactérienne auxotrophe de his- vers his+ sur une gélose, en utilisant extra de foie de rat pour mimer le métabolisme.
Types de mutations qui ont causé le phenotype his- dans le test d’Ames?
Transition, transversion, indel.
Résultats obtenues dans le test de l’Ames?
Les mutations peuvent être de type révertant ou suppresseur (augmente les chances d’avoir des révertants (his+) capablent de croîte dans milieu sans histidine).
Taux de colonies sur plaque expériemntale doit être bcp plus grand que celle contrôle.
Qu’est-ce que la transposition?
- Est un type d’éléments génétiques mobiles: « jumping genes », qui sont une source de variation génétique, qui cause une mutagénèse par insertion.
- La transposition désigne le déplacement d’une séquence d’ADN en un nouveau site dans le génome sans qu’il n’y ait aucun lien de séquence avec le locus cible donc déplacement aléatoire.
- Transposons sont présent des des sites intergéniques mais quand ils se transposent ils peuvent aller n’importe où.
