Quelles sont les quatre bases de l’ADN et de l’ARN?
Purines : Adénine, Guanine
Pyrimidines : Cytosine, Thymine (ou Uracile dans ARN)
*ADN fait de désoxyribose, ARN = ribose
Quels sont les ratios de Chargaff (1950) qui définissent la composition en nucléotides de l’ADN?
Chargaff a observé que les différentes bases composant les nucléotides ont toujours le même nombre de A = T et G = C, mais que le ratio de A/T vs G/C dans un organisme est variable selon différents groupes taxonomiques.
Comment les nucléotides dans un brin d’ADN sont-ils attachés les uns aux autres?
Lien phosphodiester : 3’ OH d’un sucre et 5’ du phosphate suivant
Quelle est l’orientation d’un brin d’ADN par rapport à l’autre?
antiparallèle
Quelles bases d’ADN sont complémentaires?
A-T (ou U dans ARN)
G-C
Quel type de lien permet aux brins d’ADN complémentaires d’interagir?
ponts H
Qu’est-ce qu’une réplication semi-conservative ?
Les deux brins d’ADN se séparent et servent de matrice et restent dans brins filles
Combien d’origines de réplication sont présentes dans un génome d’une bactérie typique?
Et une origine de réplication génère combien de « fourches » de réplication ici?
(rappel : chromosome circulaire chez les bactéries)
- Mode de réplication « thêta » θ
- 1 origine et 2 fourches
Trouve-t-on une seule origine de réplication par chromosome eucaryote?
Non, plusieurs, et plusieurs bulles de réplications.
La structure des gènes codant pour des protéines est-elle identique entre les procaryotes et les eucaryotes?
Quelles différences trouve-t-on à l’intérieur des séquences codantes?
- Procaryotes : gènes compacts, souvent organisés en opérons, pas d’introns.
- Eucaryotes : gènes plus grands, introns et exons, régulation plus complexe.
La complexité des espèces, telles que les humains, est-elle simplement expliquée par le nombre de gènes, la quantité d’ADN ou le nombre d’exons par gène?
Aucun des trois, par exemple, la taille du génome augmente avec la complexité des organismes, mais rendu aux animaux et plantes, pas de corrélation, extrême variabilité.
C’est plutôt l’épissage alternatif et l’organisation du génome (introns, ADN non codant fonctionnel, etc) qui l’explique.
Pourquoi les espèces aux plus petits génomes, autant dans la taille que dans le nombre de gènes, sont-elles souvent des parasites obligatoires ou des endosymbiotes?
Mode de vie parasitaire = symbiose avec d’autres espèces, mais au fil de l’évolution, cette symbiose est devenue une endosymbiose (= devenue vital, bactérie ne peut pas vivre sans) c’est pourquoi son génome s’est rapetissé, principe de dérive génétique où mutations dans gènes non importants, qui finissent par disparaître.
Dans un génome, est-ce que les deux brins d’ADN peuvent servir de matrice pour la transcription des gènes?
Non, il y a un brin codant (5’-3’) et un brin matrice (3’-5’, mais transcription se fait du 5’ vers 3’, juste pour indiquer que c’est celui en-dessous).
Cependant, les gènes peuvent être encodés sur un brin ou sur l’autre.
Quelle est l’orientation de la synthèse de l’ARN?
5’ vers 3’
Sur le brin matrice, dans quelle orientation voyage la polymérase?
Antiparallèle
À la séquence de quel brin correspond la séquence de l’ARNm?
brin codant
À quelle extrémité de l’ARNm la polymérase ajoute-t-elle le nouveau ribonucléotide?
3’
À quoi sert le promoteur d’un gène?
Initiation de la transcription, polymérase s’y attache
Qu’arrive-t-il au pré-ARNm dans les cellules eucaryotes?
Comment un gène peut-il encoder différentes protéines?
Pré-ARNm subit épissage pour devenir ARN messager fonctionnel.
Un gène peut encoder plusieurs protéines grâce à l’épissage alternatif.
Qu’est-ce qu’un codon?
- Triplet de nucléotides qui code pour 1 acide aminé.
- Sont situés sur l’ARNm
- Lus 5’ vers 3’
Pourquoi dit-on que le code génétique est « dégénéré »?
Code dégénéré, aussi appelé redondant, car présence de plusieurs variantes de codons pour un même a.a.
Par exemple, pour la phénylalanine (Phe), il y a deux options, soit UUU ou UUC.
Quel type de mutation entraîne un décalage dans le cadre de lecture?
Et quelle est la conséquence pour la séquence d’une protéine?
Des additions ou délétions (indels) dans l’ADN codant provoquent un décalage du cadre de lecture (angl. frame-shift).
La séquence en acides aminés est traduite incorrectement à partir du nucléotide ajouté/délété ou protéine tronquée.
Combien de nucléotides faut-on insérer ou déléter pour ne pas affecter le cadre de lecture?
L’effet d’une addition peut être supprimé par une délétion ou deux autres additions
Est-ce que le codon AUG est le seul codon d’initiation possible lorsqu’on inspecte toutes les espèces vivantes?
Si interne à l’ORF :
* GUG : code pour une valine.
* UUG : code pour une leucine.
GTG et TTG (GUG et UUG dans l’ARNm) sont fréquemment utilisés chez les procaryotes, très rarement chez les eucaryotes.
