RNA pol DNA - dirigidas
Requieren un molde de DNA
No necesitan de primer (pueden empezar la Txn con los 2 primeros nt)
Sintesis de RNA 5’ => 3’
Los enzimas discriminan positivamente en favor del nt que constituye una
pareja Watson-Crick con el nt opuesto en la hebra molde
A diferencia de las DNA polimerasas, las RNApol NO tienen una actividad de corrección de pruebas (exonucleasa 3’ →5’) robusta
V
Las RNAPs celulares (de bacterias y eucariotas) son enzimas multisubunitarias.
V
Por qué “es tolerable” desde el punto de vista biológico cierta tasa de error en la RNAPs, pero no en las DNA polimerasas replicativas?
- Los RNAs celulares tienen una vida media corta, se van renovando durante la vida de la célula, no asi el DNA.
- Los diferentes RNAs celulares existen en múltiples copias, no así el DNA genómico.
- Los RNAs por lo general no se heredan de generación en generación celular, mientras que el DNA sí se hereda: la x2 debe ser súper fiel!
ELONGACIÓN
La polimerasa avanza 5’ → 3’ hacia abajo en la hebra molde, derritiendo el
dúplex de ADN y añadiendo rNTP para el crecimiento del ARN (en sentido 3’→5’)
Falso. Los sentidos están al revés.
¿Qué quiere decir que la txn es reiterativa?
Si el RNApol abandona un altre ARNpol s’enganxa
La RNAP es un motor molecular porque…
Hace una conversión de E química en E mecánica: se mueve a lo largo del DNA molde, impulsada por la energía libre liberada en cada reacción de polimerización de nucleótido. La liberación del Ppi del NTP es exergónica
RNAP I =>
pre-rRNA, insensible a la alfa-amanitina
RNAP II =>
pre-mRNA y ncRNA, muy sensible
RNAP III
r-RNA 5S, tRNA, poco sensible
Transcripción pervasiva
tenim un lloc d’inici determinat, però moltes vegades podem tenir transcripció antisentit per un gen on s’usa el bri oposat o bé tenir un començament intragènic. Això es degut a que Les RNA pol inicien la txn en molts llocs, no només en els TSS de gens anotats, i en zones NFR
És freqüent trobar NFR al final de la seqüència d’un gen
V
Para la mayoría de genes se ha demostrado que hay un Txn antisentido en el gen anotado
V
Transcripción divergente
inicia una RNApol en una direcció del gen anotat mentre que el mRNA va cresquent a la vegada que una altra RNA pol aprofita la NFR en l’altra direcció del bri de DNA
Transcripción antisentido
la RNA pol transcriu un gen codificant en direcció oposada de forma que genera un transcrit no codificant (ncRNA)
CUT
Cryptic unstable transcript. SE degrada por el extremo 3’ por el exosoma nuclear
XUT
Xrn-1 sensitive unstable transcript, se degrada por la Xrn-1-5’3’ exosoma
SUT
STABLE!! unnanotated transcripts
Los tránscritos producidos por la txn pervasiva son funcionales?
Algunos sí..
Algunos pueden regular la expresión génica
Mecanismos de control de la Txn pervasiva
- Mecanismes relacionats amb la cromatina (EX: assemblatge i remodelació de
nucleosomes) - Factors de transcripció que suprimeixen els inicis de Txn pervasiva ocupant i ocloent el
promotor críptic - Terminació prematura i degradació dels ncRNAs (complex NNS en llevats; Integrator en
metazous)
Consecuencias del descontrol de la Txn pervasiva
- Interferència transcripcional
- Interferència amb la replicació de l’ADN
- Segrest de proteïnes d’unió a l’ARN: una sèrie de proteïnes s’uneixen als transcrits de
mRNA que es van produint per fer-los estables, entre altres funcions. Això redueix el no lliure de forma important, pel que pot causar un problema
