Define complejo integrador
Complejo modular que se encuentra en eucariotas multicelulares, que interacciona con el complejo de elongación pausado, atenuando la Txn de los genes codificantes al favorecer la terminación de la Txn cerca de la PPP
El factor de elongación SII (TFII S)…
Ayuda a revertir los retrocesos de la RNAPII y estimula su actividad endonucleolítica
¿Por qué existiría el backtracking?
Pauses i detencions normatives
Mecanismes de terminació
Fidelitat transcripcional
Control de velocitat d’allargament
Acoblament de la transcripció amb la traducció en bacteris
Plegament i processament de l’ARN co-transcripcional Inestabilitat del genoma
Las histonas y los remodeladores de cromatina son enzimas que ayudan a modular el estado de la cromatina y así, favorecer o no la txn génica
Falso. Las histonas no son enzimas. Son las chaperonas y los remodeladores de cromatina ????
Las máquinas remodeladores de cromatina introducen cambios en la estructura de la cromatina, con gasto de ATP
Verdadero
Elongator …
Es un complejo multiproteico con actividad acetiltransferasa que se asocia a la RNAPII con CTD hiperfosforilado
Nombra los 2 tipos de chaperonas de histonas:
- FACT
- Spt6
FACT…
Chaperona de histona que facilita la Txn de la cromatina acompañando a la RNAPII y desplazando los dímeros de H2A/H2B de los nucleosomas al paso de la polimerasa. Después, facilita la reconstrucción de los nucleosomas
Spt6…
Chaperona de histona que desplaza el tetrámero H3/H4 de los nucleosomas al paso de la RNAPII, facilitando también su posterior reconstrucción. Actúa en coordinación con FACT.
DNA topoisomerasas son muy importantes en la elongación de la Txn
V. Ya que introducen cortes transitorios para liberar las tensiones topológicas que genera el propio proceso de Txn
Una acumulación de superenrollamiento negativo no permite el avance de la RNAPII
Falso. Superenrollamiento positivo.
La elongación es un proceso monótono
Falso.
La velocidad de elongación no es cte (puede variar de gen a gen, e incluso en un mismo gen, dependiendo del ambiente celular). Esto se debe a factores como disponibilidad de NTPs y secuencias en el RNA naciente o en el DNA molde que contribuyen a las interacciones RNA-RNAP o DNA-RNAP, proteínas-DNA, nucleosomas, PTM de histonas, act de factores reguladores.
el reclutamiento del PIC y la terminación son mucho más rápidos que
la pausa.
Verdad
DSIF
DRB sensitivity inducing factor, heterodímero que se une a RNAPII que favorece la pausa
Fosforilado => se convierte en un factor activador
NELF
Negative Elongation Factor
También favorece la pausa
Fosforilación que favorece la PPP
Ser 5 en la CTD de Pol II
P-TEFb
Positive-Txn Elongation Factor
Heterodímero formado por una Quinasa dependiente de ciclina (CDK9) +prot eso¡p
que promueve la SALIDA de la pausa:
- disociación de NELF
- Pol II CTD en Ser 2 => reclutar Sp6
- DSIF => lo convierte en un factor de elongación POSITIVO
Qué hace DRB
Inhibe la quinasa P-TEFb
La regulación de P-TEFb consiste en su asociación reversible a un complejo ribonucleico de snRNA que…
lo inactiva.
Per sortir de la pausa PPP, l’activitat de P-TEFb és essencial. Com es recluta?
- Es pot reclutar interaccionant amb un activador (act) unit a un element de seqüència
que no és part del promotor mínim. Allà fosforila NELF i DSIF. - Pot interaccionar amb el factor BRD4, regulador de txn molt important, que té 2 bromodominis que permeten la interacció amb lisines acetilades (histones). Quan un gen és actiu les histones estaran acetilades.
- Mitjançant el mediador es pot reclutar el Super Elongation Complex (SEC) que conté P- TEFb y proteïnes ELL. En gens molt actius el complex continua activant la elongació després de la sortida del PPP i romana associat a la RNAP
La PPP es un mecanismo represivo de la txn.
De fet, quan a llevats es silencien factors proteics (NELF) que fan possible la pausa, la txn de molts de gens queda reduïda.
Té funcions reguladores i ajuda a mantenir aquesta zona lliure de nucleosomes i per tant permissiva al voltant de promotors gènics
A més, pot deixar la RNAP preparada (poised) per la seva acció assegurant una resposta transcripcional ràpida i sincronitzada (En caso de txn sincrónica => activación simultánea de varios genes)
Multiplica les possibilitats de control, ja no només serà a nivell de iniciació sinó també a nivell de la sortida cap a l’elongació productiva (control independent)
Para qué crees que serviría el complejo integrador
Intervé en el processament en 3’ de molts ncRNAs sintetitzats per la RNAP II (ex: UsnRNAs, eRNAs…)
El complejo integrador tiene 2 módulos…
Endonucleasa => libera el RNA unido al RNAPII (sólo se activa al interaccionar con PEC)
Fosfatasa, antagonista de P-TEFb
La terminació normal és dependent de la transcripció de senyals de processament en 5’ del transcrit d’ARN (sitio de poliadenilación)
Falso. 3’ del transcrito.
