muchas veces se da una regulación combinatoria en la transcripción → Efectos aditivos o sinérgicos
Verdadero. (no siempre)
Definición de cooperatividad
Tipo de comportamiento en el que varios componentes aparentemente independientes de un sistema actúan colectivamente, al unísono o casi al unísono. No tiene porqué ser contacto directo.
Mecanismos de cooperatividad entre FTs al nivel de su unión al DNA
- Cooperativitat pasiva o unió colaborativa. Juntos, los FTs pueden desplazar los nucleosomas del enhancer (aunque no haya contactos FT-FT); individualmente, no pueden
- Interacciones físicas FT-FT (facilitadas por el DNA en cis) facilitan/estabilizan la unión de ambos FTs al DNA. Si que tenim interaccions directes.
- Model de l’enhanceosoma. Caso extremo de unión cooperativa de FTs al DNA
- Modelo jerárquico. Tenim un FT pioneer que quan s’uneix desplaça nucleosomes o encadena una remodelació de la cromatina
Ejemplo de unión cooperativa entre 2 factores de txn
Unión cooperativa de NFAT y AP1 a sitios vecinos en el promotor de muchos genes inducidos durante la activación de las células T (como el gen para IL-2)
los enhancers que contienen sitios de unión para diferentes FTs son más efectivos que los que contienen multiples sitios para un solo FT.
Sí, porque…
cada FT interacciona con dominios o subunidades diferentes de un mismo coactivador (o componente del PIC), de modo que el reclutamiento de este queda favorecido
cada FT pueda ayudar a reclutar un coactivador diferente, o un componente
del PIC diferente
Los PTMs y su importancia tras la cooperatividad.
Sí. Muchos cofactores transcripcionales son enzimas que catalizan PTMs de proteínas (por ej., de histonas o de componentes del PIC), y estas modificaciones pueden estar detrás de fenómenos de cooperatividad (ex. la unió de un FT indueix la unió de altre) en la activación transcripcional.
Tipos de señales que afectan la expresión génica
- nutrientes y derivados (ej: PUFA, ácido retinoico)
- hormonas y segundos mensajeros (ej: hormonas esteroideas y tiroideas, AMPc)
- cambios físico-químicos a nivel celular (ej: estrés térmico, estrés oxidativo, hipoxia)
- metabolitos que señalan el estado energético celular (ej: increment dels nivells de AMP)
- insultos varios: toxinas, antígenos, lesiones en el DNA…
La expresión génica se controla…
controlando a los controladores.
Modulando la concentración y actividad de:
- factores de transcripción*
- coreguladores transcripcionales*
- complejos remodeladores de cromatina dptes de ATP - complejos modificadores de histonas
- RNAs reguladores
Control de la concentración de ft
*El FT se expresa solo o preferentemente en ciertas células, momentos del desarrollo, y/o en respuesta a determinadas señales.
*Típico de FTs que controlan genes específicos de tejido y/o genes regulados durante el desarrollo.
*La expresión del FT puede controlarse en cualquier punto del flujo de información biológica, desde la Txn de su gen hasta su vida media como proteína.
RESPUESTA LENTA
Control de actividad
*El FT está presente en la célula en una forma inactiva, que se activa en respuesta a determinadas señales o estímulos.
*Típico de FTs que modulan la transcripción de genes inducibles!!!.
*Permite una respuesta rápida de la célula a condiciones cambiantes/llegada de estímulos.
ejemplo de FT modulados por la activación por ligando
Receptores nucleares
Ejemplos superfamila de receptores nucleares
Receptores de hormonas esteroides
Receptores de hormonas tiroideas
Receptores de vitamina D
Receptores de ác. retinoico
Receptores activados por proliferadores peroxisomales
2 grupos de receptores nucleares
- Receptores de señales esteroideas => homodímeros
- Receptores de señales no esteroideas => heterodímeros (con RXR)
por qué es importante el ligando para los receptores de h esteroideas
Para acceder al núcleo. Los receptores nucleares de h esteroideas se encuentran en el citoplasma y su unión con la hormona, provoca su disociación, la formación del dímero y el paso al núcleo
Todos los receptores nucleares se encuentran en el citoplasma, y pasan al núcleo al ser activados por ligando
Falso.
Los receptores para hormonas no esteroideas ya se encuentran en el núcleo
Heterodímeros no permisivos… (no es muy imp)
no requieren la unión del ligando RXR, sino solo la del ligando del otro componente, para ser máximamente activos???
NRF2
FT que activa genes para la respuesta antioxidante
Los FTs contienen señales de
importación y exportación nuclear
V. Pueden estar enmascarados.
Ejemplo: Carbohydrate response element binding protein. En condiciones de abundancia de glucosa, ChREBP se concentra en el núcleo, donde estimula genes de la glucólisis y la lipogénesis
SREBPs (no entra)
Sterol regulatory element binding protein
NFkB (no entra)
Factor nuclear kappa B.
Funciona como dímero formado a partir de 5 subunidades distintas (las mostradas en la figura). Algunos dímeros reprimen la transcripción de genes diana de NF-kB, al poder unirse al DNA cis, pero faltarles el dominio de transactivación (TAD).
Un mismo FT puede estar controlado a diversos niveles
- su expresión es tejido-específica
- regulados por la unión de ligando
- su actividad depende de su estado de dimerización
- su actividad depende de modificaciones covalentes
- su actividad depende del repertorio y nivel de expresión de coactivadores y
corepresores en las células diana.
